| 摘要 | 第12-17页 |
| ABSTRACT | 第17-22页 |
| 符号与缩略语 | 第23-24页 |
| 第一章 文献综述 | 第24-52页 |
| 1 大豆育种资源研究进展 | 第24-28页 |
| 1.1 大豆种质资源的构成和保存现状 | 第24-25页 |
| 1.2 大豆不同类型种质资源的特征及在育种中的应用 | 第25-26页 |
| 1.3 中国大豆地方品种研究进展 | 第26-28页 |
| 2 大豆异黄酮的组成和功能 | 第28-34页 |
| 2.1 异黄酮在植物中的分布和组成 | 第28-30页 |
| 2.2 大豆异黄酮的生物代谢途径 | 第30-32页 |
| 2.3 大豆异黄酮对人体的保健功能 | 第32-34页 |
| 3 中国大豆种质资源中异黄酮含量的遗传变异 | 第34-37页 |
| 3.1 不同品种及种质资源间异黄酮的遗传变异 | 第34-35页 |
| 3.2 不同生态区大豆种质资源间异黄酮的遗传变异 | 第35-37页 |
| 4 植物数量性状位点(QTL)定位方法研究进展 | 第37-42页 |
| 4.1 连锁定位 | 第37-38页 |
| 4.2 关联分析 | 第38-41页 |
| 4.3 连锁定位与关联分析的比较 | 第41-42页 |
| 5 大豆异黄酮的遗传与QTL定位研究进展 | 第42-46页 |
| 5.1 大豆异黄酮的遗传 | 第42-43页 |
| 5.2 大豆异黄酮含量和组分的QTL定位 | 第43-46页 |
| 6 大豆异黄酮遗传改良研究进展 | 第46-48页 |
| 7 QTL定位结果的育种利用 | 第48-49页 |
| 8 本研究内容和目标 | 第49-52页 |
| 第二章 材料与方法 | 第52-62页 |
| 1 中国大豆地方品种群体CSLRP异黄酮性状的表型变异 | 第52-55页 |
| 1.1 供试材料与田间试验 | 第52页 |
| 1.2 大豆异黄酮性状的表型鉴定 | 第52-54页 |
| 1.2.1 大豆籽粒异黄酮的提取 | 第53页 |
| 1.2.2 大豆异黄酮组分含量的HPLC测定 | 第53-54页 |
| 1.3 数据分析 | 第54-55页 |
| 2 SNP连锁不平衡区段标记SNPLDB的构建、特性及优点 | 第55-57页 |
| 2.1 供试材料与田间试验 | 第55页 |
| 2.2 全基因组分子标记的测序和基因分型 | 第55页 |
| 2.3 SNPLDB组装 | 第55页 |
| 2.4 群体连锁不平衡(LD)的衡量 | 第55-56页 |
| 2.5 大豆异黄酮性状的表型鉴定 | 第56页 |
| 2.6 群体结构分析和全基因组关联分析 | 第56-57页 |
| 3 大豆异黄酮性状的QTL定位研究 | 第57-59页 |
| 3.1 供试材料与田间试验 | 第57页 |
| 3.2 大豆异黄酮性状的表型鉴定 | 第57页 |
| 3.3 全基因组分子标记 | 第57-58页 |
| 3.4 全基因组关联分析 | 第58-59页 |
| 3.5 QTL连锁定位 | 第59页 |
| 4 异黄酮性状QTL-allele矩阵的建立、区域分化及优化组合设计 | 第59-62页 |
| 4.1 QTL-allele矩阵的建立 | 第59-60页 |
| 4.2 中国大豆地方品种群体的遗传多样性分析 | 第60页 |
| 4.3 亲本组配预测 | 第60-62页 |
| 第三章 中国大豆地方品种群体异黄酮性状的表型变异 | 第62-76页 |
| 1 CSLRP中异黄酮组成的变异以及目标性状的确定 | 第62-63页 |
| 2 CSLRP中异黄酮性状的总体变异情况 | 第63-68页 |
| 2.1 异黄酮总含量的总体变异情况 | 第63-65页 |
| 2.2 异黄酮组分含量的总体变异情况 | 第65-68页 |
| 3 CSLRP不同生态区来源品种异黄酮性状的变异情况 | 第68-70页 |
| 4 异黄酮性状特异种质的优选 | 第70-72页 |
| 5 讨论 | 第72-76页 |
| 5.1 异黄酮性状与生态区及地理因素的关系 | 第72-73页 |
| 5.2 异黄酮各组分含量变异间的关系 | 第73页 |
| 5.3 异黄酮性状特异种质材料的育种利用 | 第73-76页 |
| 第四章 中国大豆地方品种群体中全基因组SNPLDB标记的构建、特性及优点 | 第76-98页 |
| 1 CSLRP中基因组标记SNPLDB的构建和特性 | 第76-83页 |
| 1.1 全基因组SNP的特性 | 第76-79页 |
| 1.2 全基因组SNPLDB标记的构建 | 第79-83页 |
| 1.3 基因组序列标记SNPLDB的主要特征 | 第83页 |
| 2 CSLRP中使用SNPLDB进行异黄酮性状的GWAS研究 | 第83-90页 |
| 2.1 利用SNPLDB和SNP发掘全基因组QTL | 第83-86页 |
| 2.2 关联结果的结构组成 | 第86-90页 |
| 3 异黄酮关联定位中SNPLDB相对于SNP的特征 | 第90-94页 |
| 3.1 SNPLDB为自然群体提供复等位变异信息 | 第90-91页 |
| 3.2 关联SNPLDB涵盖更多的基因组信息量 | 第91-92页 |
| 3.3 SNPLDB提高关联分析的准确性 | 第92-94页 |
| 4 讨论 | 第94-98页 |
| 4.1 自交作物的连锁不平衡特征 | 第94-95页 |
| 4.2 在资源群体GWAS中使用SNPLDB的优点 | 第95-98页 |
| 第五章 中国大豆地方品种群体异黄酮性状的GWAS解析 | 第98-122页 |
| 1 CSLRP中异黄酮性状的遗传结构解析 | 第98-100页 |
| 2 地方品种群体异黄酮性状的GWAS解析 | 第100-116页 |
| 2.1 异黄酮总含量的全基因组关联分析结果 | 第100-105页 |
| 2.2 异黄酮组分含量的全基因组关联分析结果 | 第105-116页 |
| 3 讨论 | 第116-122页 |
| 3.1 家系连锁分析和关联分析结果的比较与定位策略的讨论 | 第116-117页 |
| 3.2 与SSR标记相比使用SNPLDB进行关联分析的优点 | 第117-118页 |
| 3.3 异黄酮性状的相关候选基因 | 第118-122页 |
| 第六章 中国大豆地方品种群体异黄酮性状QTL-allele矩阵的建立、生态区分化及优化组合设计 | 第122-162页 |
| 1 地方品种群体异黄酮性状QTL-allele矩阵的建立 | 第122-129页 |
| 1.1 异黄酮总含量QTL-allele矩阵的建立 | 第122-124页 |
| 1.2 异黄酮组分含量QTL-allele矩阵的建立 | 第124-129页 |
| 2 不同生态区间异黄酮性状QTL-allele矩阵的分化 | 第129-140页 |
| 2.1 不同生态区间CSLRP的总体遗传分化 | 第129-131页 |
| 2.2 不同生态区间异黄酮总含量QTL-allele矩阵的分化 | 第131-134页 |
| 2.3 不同生态区间异黄酮组分含量QTL-allele矩阵的分化 | 第134-140页 |
| 3 地方品种群体异黄酮性状的优化组合设计 | 第140-153页 |
| 3.1 异黄酮性状亲本组配预测的策略 | 第140-141页 |
| 3.2 异黄酮总含量的亲本组配预测 | 第141-144页 |
| 3.3 异黄酮组分含量的亲本组配预测 | 第144-153页 |
| 4 异黄酮性状遗传体系的共性和特异性以及综合优化设计 | 第153-160页 |
| 4.1 四个异黄酮性状遗传体系的共性和特异性 | 第153-156页 |
| 4.2 目标性状选育过程对其他相关性状的影响 | 第156-157页 |
| 4.3 高异黄酮组分含量的综合优化设计 | 第157-160页 |
| 5 讨论 | 第160-162页 |
| 5.1 异黄酮性状QTL-allele矩阵的特征 | 第160页 |
| 5.2 不同生态区中异黄酮性状的育种潜力 | 第160-161页 |
| 5.3 异黄酮性状共同的遗传基础 | 第161页 |
| 5.4 异黄酮性状综合育种的探索 | 第161-162页 |
| 第七章 全文讨论、结论和创新点 | 第162-166页 |
| 1 全文讨论 | 第162-164页 |
| 1.1 研究所选地方品种样本的代表性 | 第162页 |
| 1.2 SNPLDB对于改善种质资源群体GWAS的潜在效用 | 第162-163页 |
| 1.3 基于全基因组QTL-allele矩阵的设计育种 | 第163-164页 |
| 2 全文主要结论 | 第164-165页 |
| 3 主要创新点 | 第165-166页 |
| 参考文献 | 第166-178页 |
| 附录 | 第178-192页 |
| 致谢 | 第192-194页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第194页 |
