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家猫pFLA Ⅰ-167W/S和CD8αα精细结构与递呈抗原表位结构机理的研究

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
缩略词表第13-15页
第一章 引言第15-32页
    1.1 MHC Ⅰ类分子的研究进展第15-29页
        1.1.1 MHC分子的发现第15页
        1.1.2 MHC Ⅰ类分子的功能第15-19页
        1.1.3 病原和肿瘤逃逸MHC Ⅰ类分子递呈抗原策略第19-22页
        1.1.4 MHC Ⅰ类分子的结构第22-23页
        1.1.5 基于MHC技术检测抗原应答T细胞的研究进展第23-27页
        1.1.6 猫MHC Ⅰ类分子的研究进展第27-28页
        1.1.7 FIV的基因组结构和分子特征第28-29页
        1.1.8 CD8分子的结构第29页
    1.2 研究目的与意义第29-30页
    1.3 研究内容和技术路线第30-31页
    1.4 研究目标第31-32页
第二章 FLA Ⅰ多态性分析第32-47页
    2.1 引言第32页
    2.2 材料第32-33页
        2.2.1 猫第32页
        2.2.2 载体及菌株第32页
        2.2.3 主要试剂第32页
        2.2.4 仪器设备第32-33页
        2.2.5 常用溶液及试剂的配制第33页
    2.3 方法第33-38页
        2.3.1 引物设计第33-34页
        2.3.2 猫外周血淋巴细胞的分离第34页
        2.3.3 总RNA提取第34-35页
        2.3.4 FLA Ⅰ基因克隆第35-38页
        2.3.5 软件及公式第38页
    2.4 结果第38-45页
        2.4.1 FLA Ⅰ基因扩增与鉴定第38页
        2.4.2 FLA Ⅰ基因序列的测定及分析第38-42页
        2.4.3 FLA Ⅰ等位基因系统进化树分析第42-43页
        2.4.4 FLA Ⅰ α1、α2和α3各区变异分析第43-45页
    2.5 讨论第45页
        2.5.1 FLA Ⅰ的克隆及其分子特征第45页
        2.5.2 FLA Ⅰα1、α2和α3区氨基酸变异频率的分析第45页
        2.5.3 高变异位点对FLA Ⅰ多肽递呈规律的影响第45页
    2.6 小结第45-47页
第三章 pFLA Ⅰ递呈抗原多肽功能机制研究第47-83页
    3.1 引言第47页
    3.2 材料第47-54页
        3.2.1 载体与菌株第47-48页
        3.2.2 引物设计与合成第48页
        3.2.3 多肽的预测与合成第48-50页
        3.2.4 主要试剂第50页
        3.2.5 仪器设备第50-51页
        3.2.6 常用溶液及配制第51-54页
    3.3 方法第54-62页
        3.3.1 FLA-E~*01801_(-63E/N)和FLA-E~*01801_(-167W/S)表达载体的构建第54-58页
        3.3.2 FLA-E~*01801_(-63E/N)和FLA-E~*01801_(-167W/S)分子的表达第58-59页
        3.3.3 FLA-E~*01801_(-63E/N)和FLA-E~*01801_(-167W/S)包涵体的提取第59页
        3.3.4 FLA-E~*01801_(-63E/N)或FLA-E~*01801_(-167W/S)、fβ2m及多肽的体外共复性与纯化第59-60页
        3.3.5 FLA-E~*01801_(-167W/SRMA-PlD)蛋白结晶第60-62页
        3.3.6 FLA-E~*01801_(-RMA)和FLA-E~*01801_(-167W/S-RMA-PlD)结构分析第62页
    3.4 结果第62-81页
        3.4.1 FLA-E~*01801_(-63E/N)和FLA-E~*01801_(-167W/S)胞外区成熟肽表达载体的构建第62-63页
        3.4.2 FLA-E~*01801_(-63E/N)、FLA-E~*0180_(167W/S)、fβ2m蛋白表达第63页
        3.4.3 FLA-E~*01801_(-167W/s-RMA-PlD)体外复性结果第63-64页
        3.4.4 FLA-E~*01801_(-167W/S-RMA-PlD)复合物蛋白的结晶、数据收集及结构解析第64-66页
        3.4.5 FLA-E~*01801_(-RMA9)和FLA-E~*01801_(-167W/S-RMA-PlD)蛋白晶体结构分析第66-81页
    3.5 讨论第81-82页
        3.5.1 A口袋的限制性第81页
        3.5.2 A口袋限制性因素的分析第81-82页
        3.5.3 FIV的抗原肽谱第82页
    3.6 小结第82-83页
第四章 pFLA Ⅰ结合基序的鉴定第83-89页
    4.1 引言第83页
    4.2 材料第83页
        4.2.1 随机肽的合成第83页
        4.2.2 FLA-E~*01801、fβ2m蛋白/分子生物学试剂/菌株/仪器第83页
    4.3 方法第83-85页
        4.3.1 FLA-E~*01801、fβ2m及随机多肽的体外复性及纯化第83页
        4.3.2 随机多肽的处理第83-84页
        4.3.3 色谱分离前样本处理第84页
        4.3.4 LC-MS/MS检测第84页
        4.3.5 高效液相色谱分离第84页
        4.3.6 质谱分析第84-85页
        4.3.7 多肽统计第85页
    4.4 结果第85-88页
        4.4.1 FLA-E~*01801/fβ2m/随机多肽的体外复性结果第85-86页
        4.4.2 LC-MS/MS TIC和Base Peak谱图分析第86-87页
        4.4.3 De Novo数据解析第87页
        4.4.4 随机多肽谱图质量分析第87页
        4.4.5 结合FLA-E~*01801的九肽每一位氨基酸的偏好性分析第87-88页
    4.5 讨论第88页
    4.6 小结第88-89页
第五章 家猫CD8αα晶体结构研究第89-101页
    5.1 引言第89页
    5.2 材料第89-91页
        5.2.1 设计引物第89-90页
        5.2.2 合成编码猫CD8α链胞外区IgSF结构域的基因序列第90-91页
        5.2.3 菌株及载体第91页
        5.2.4 分子生物学试剂及仪器第91页
    5.3 方法第91页
    5.4 结果第91-100页
        5.4.1 fCD8α蛋白表达第91页
        5.4.2 fCD8αα蛋白的复性及纯化第91-92页
        5.4.3 fCD8αα蛋白的结晶条件及晶体外观第92页
        5.4.4 fCD8αα蛋白晶体衍射数据的收集第92-93页
        5.4.5 fCD8αα蛋白晶体结构解析第93-94页
        5.4.6 fCD8αα晶体结构分析第94-100页
    5.5 讨论第100页
        5.5.1 fCD8αα分子的结构特点第100页
        5.5.2 fCD8αα的CDR1 loop具有刚性特征第100页
    5.6 小结第100-101页
第六章 结论第101-102页
第七章 创新点第102-103页
参考文献第103-117页
致谢第117-119页
个人简历第119-120页

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