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毛竹AQPs家族全基因组分析及PeTIP4;1-1和PePIP2;7功能研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
第一章 绪论第18-33页
    1.1 引言第18-30页
        1.1.1 研究背景第18-19页
        1.1.2 国内外研究现状及评述第19-30页
    1.2 研究目标及主要研究内容第30-32页
        1.2.1 拟解决的科学问题和研究目标第30页
        1.2.2 主要研究内容第30-32页
    1.3 技术路线第32-33页
第二章 毛竹PeAQPs基因家族成员鉴定和表达模式分析第33-55页
    2.1 实验材料第33页
        2.1.1 植物材料第33页
        2.1.2 主要试剂及仪器第33页
    2.2 实验方法第33-39页
        2.2.1 毛竹PeAQPs基因序列的获取及分析第33-35页
        2.2.2 毛竹材料处理第35页
        2.2.3 毛竹总RNA提取及检测第35-36页
        2.2.4 cDNA第一链合成第36-37页
        2.2.5 特异引物设计第37页
        2.2.6 qPCR分析第37-39页
    2.3 结果和分析第39-54页
        2.3.1 基因查找和命名第39-41页
        2.3.2 基因结构分析和基因在Scaffold上位置预测第41-45页
        2.3.3 PeAQPs的基本理化性质分析第45页
        2.3.4 PeAQPs的亚细胞定位和跨膜结构域预测第45页
        2.3.5 PeAQPs的保守结构域分析第45-46页
        2.3.6 PeAQPs基因的组织特异性分析第46-49页
        2.3.7 胁迫条件下PeAQPs基因表达模式分析第49-54页
    2.4 小结第54-55页
第三章 基于基因组重测序和转录组数据的PeAQPs基因鉴定和表达模式分析第55-61页
    3.1 实验方法第55-58页
        3.1.1 基于基因组重测序的PeAQPs基因查找和鉴定第55页
        3.1.2 转录组数据分析第55-58页
    3.2 结果和分析第58-60页
        3.2.1 基因序列信息第58页
        3.2.2 基因在26个组织中的表达模式分析第58-60页
    3.3 小结第60-61页
第四章 毛竹笋期根压与PeAQPs基因表达量关联分析第61-68页
    4.1 实验材料第61-62页
        4.1.1 植物材料第61页
        4.1.2 实验方法第61页
        4.1.3 毛竹笋总RNA提取及检测第61-62页
        4.1.4 特异引物设计第62页
        4.1.5 cDNA第一链合成第62页
        4.1.6 qPCR分析第62页
        4.1.7 根压和基因表达量相关性分析第62页
    4.2 结果分析第62-66页
        4.2.1 毛竹笋期根压日变化第62-64页
        4.2.2 毛竹PeAQPs基因在笋中表达量的日变化第64-66页
        4.2.3 毛竹PeAQPs基因表达量与根压关联分析第66页
    4.3 小结第66-68页
第五章 毛竹PeTIP4;1-1基因功能研究第68-90页
    5.1 实验材料第68-69页
        5.1.1 植物材料与处理方法第68页
        5.1.2 主要试剂及仪器第68-69页
    5.2 实验方法第69-75页
        5.2.1 毛竹总RNA提取及检测第69页
        5.2.2 cDNA第一链合成第69页
        5.2.3 基因组DNA提取第69-71页
        5.2.4 PeTIP4;1基因全长克隆第71页
        5.2.5 基因序列生物信息学分析第71页
        5.2.6 亚细胞位置分析第71-72页
        5.2.7 基因表达分析第72页
        5.2.8 启动子瞬时表达分析第72-73页
        5.2.9 拟南芥转化及转化植株鉴定第73-74页
        5.2.10 转基因拟南芥胁迫条件下参数测定第74-75页
        5.2.11 拟南芥内源基因表达量分析第75页
        5.2.12 数据统计分析第75页
    5.3 结果分析第75-88页
        5.3.1 PeTIP4;1-1基因的分子特征第75-76页
        5.3.2 PeTIP4;1-1的序列比对和聚类分析第76-79页
        5.3.3 PeTIP4;1-1基因在洋葱表皮细胞的瞬时表达分析第79页
        5.3.4 PeTIP4;1-1基因的表达模式分析第79-82页
        5.3.5 PeTIP4;1-1基因启动子瞬时表达分析第82页
        5.3.6 转PeTIP4;1-1基因植株渗透胁迫处理第82-85页
        5.3.7 相对失水率和MDA含量测定第85-86页
        5.3.8 抗氧化酶活性分析第86-87页
        5.3.9 内源胁迫相关基因表达模式分析第87-88页
    5.4 小结第88-90页
第六章 毛竹PePIP2;7基因功能研究第90-100页
    6.1 实验材料第90页
        6.1.1 植物材料与处理方法第90页
        6.1.2 主要试剂及仪器第90页
    6.2 实验方法第90-92页
        6.2.1 毛竹总RNA提取及检测第90页
        6.2.2 cDNA第一链合成第90-91页
        6.2.3 基因组DNA提取第91页
        6.2.4 PePIP2;7基因全长克隆第91页
        6.2.5 基因序列生物信息学分析第91页
        6.2.6 亚细胞位置分析第91页
        6.2.7 基因表达分析第91页
        6.2.8 拟南芥转化及转化植株鉴定第91-92页
        6.2.9 转基因拟南芥低温胁迫条件下参数测定第92页
    6.3 结果分析第92-99页
        6.3.1 PePIP2;7基因的分子特征第92-93页
        6.3.2 同源序列比对和聚类分析第93-94页
        6.3.3 PePIP2;7基因在洋葱表皮细胞的瞬时表达分析第94-95页
        6.3.4 PePIP2;7基因的表达模式分析第95-97页
        6.3.5 PePIP2;7转基因株系的获取及低温胁迫处理第97-99页
    6.4 小结第99-100页
第七章 结论与讨论第100-110页
    7.1 结论第100-101页
    7.2 讨论第101-109页
        7.2.1 毛竹PeAQPs家族基因的鉴定第101-102页
        7.2.2 毛竹PeAQPs的结构第102-103页
        7.2.3 毛竹PeAQPs的表达模式第103-105页
        7.2.4 毛竹PeAQPs基因表达与根压的关系第105-106页
        7.2.5 毛竹PeTIP4;1-1基因的功能第106-108页
        7.2.6 毛竹PePIP2;7基因的功能第108-109页
    7.3 展望第109-110页
参考文献第110-125页
在读期间的学术研究第125-127页
致谢第127页

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