| 摘要 | 第2-4页 |
| abstract | 第4-5页 |
| 引言 | 第8-11页 |
| 第一部分 铜绿假单胞菌CRISPR系统的生物信息学分析 | 第11-29页 |
| 1.材料和方法 | 第11-13页 |
| 1.1 研究对象及菌株基因组序列的来源与收集 | 第11页 |
| 1.2 铜绿假单胞菌基因组中CRISPR系统的鉴定 | 第11页 |
| 1.3 铜绿假单胞菌CRISPR系统的分型 | 第11-12页 |
| 1.4 cas基因序列的比较与分析 | 第12页 |
| 1.5 重复序列的分析 | 第12页 |
| 1.6 间隔序列的同源性分析 | 第12页 |
| 1.7 前导序列的预测与分析 | 第12页 |
| 1.8 铜绿假单胞菌的MLST分型 | 第12-13页 |
| 1.9 CRISPR系统与耐药基因分析 | 第13页 |
| 2.结果 | 第13-26页 |
| 2.1 铜绿假单胞菌基因组CRISPR系统的数量及分布 | 第13页 |
| 2.2 铜绿假单胞菌基因组中CRISPR系统的基因结构与分型 | 第13-19页 |
| 2.3 cas基因序列的生物信息学分析 | 第19-21页 |
| 2.4 重复序列的序列及二级结构分析 | 第21-22页 |
| 2.5 间隔序列的比较分析 | 第22-24页 |
| 2.6 前导序列的预测 | 第24页 |
| 2.7 MLST分型与CRISPR类型的关系 | 第24-25页 |
| 2.8 铜绿假单胞菌耐药基因分析 | 第25-26页 |
| 3 讨论 | 第26-29页 |
| 第二部分 铜绿假单胞菌临床分离株CRISPR基因座和cas1基因的分析与研究 | 第29-39页 |
| 1 材料 | 第29-30页 |
| 1.1 菌株 | 第29页 |
| 1.2 主要试剂 | 第29页 |
| 1.3 主要仪器 | 第29-30页 |
| 2 方法 | 第30-32页 |
| 2.1 铜绿假单胞菌基因组DNA提取 | 第30-31页 |
| 2.2 引物设计 | 第31页 |
| 2.3 CRISPR基因座和cas1基因的PCR扩增 | 第31-32页 |
| 2.4 PACRISPR基因座测序 | 第32页 |
| 2.5 PACRISPR基因座的鉴定 | 第32页 |
| 2.6 CRISPR基因座中间隔序列的分析 | 第32页 |
| 2.7 CRISPR基因座中重复序列的分析 | 第32页 |
| 2.8 PA耐药与CRISPR之间关系的分析 | 第32页 |
| 3 结果 | 第32-37页 |
| 3.1 铜绿假单胞菌cas1基因的PCR扩增 | 第32-33页 |
| 3.2 铜绿假单胞菌CRISPR基因座的PCR扩增 | 第33-34页 |
| 3.3 CRISPR基因座基因测序分析 | 第34-35页 |
| 3.4 CRISPR基因座中间隔序列的分析 | 第35页 |
| 3.5 铜绿假单胞菌抗生素耐药与CRISPR系统之间相关性的分析 | 第35-37页 |
| 4 讨论 | 第37-39页 |
| 结论 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-43页 |
| 综述：细菌 CRISPR 系统基因结构的研究进展 | 第43-57页 |
| 综述参考文献 | 第53-57页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
