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活性分子对脂质膜穿透性影响的分子动力学仿真

摘要第5-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 绪论第10-19页
    1.1 课题研究背景及意义第10-11页
    1.2 国内外研究现状第11-18页
        1.2.1 中尺度建模技术第11-14页
        1.2.2 纳米药物第14-16页
        1.2.3 分子模拟技术第16-18页
    1.3 本文主要工作第18-19页
第二章 耗散粒子动力学技术第19-25页
    2.1 耗散粒子动力学计算第19-21页
    2.2 离子型表面活性剂胶束的计算第21-22页
    2.3 脂质分子的相行为计算第22-24页
    2.4 本章小结第24-25页
第三章 分子动力学模拟技术第25-46页
    3.1 分子动力学模拟基本理论第26-39页
        3.1.1 运动方程的数值解法第26-31页
        3.1.2 力场第31-37页
        3.1.3 周期性边界条件与最近镜像第37-39页
    3.2 粗粒化模拟技术第39-43页
        3.2.1 粗粒化建模思想第39-41页
        3.2.2 特定粗粒化模型第41-42页
        3.2.3 积分步程的选取第42-43页
    3.3 模拟软件LAMMPS及MATERIALS STUDIO第43-45页
    3.4 本章小结第45-46页
第四章 活性分子对脂质膜穿透性影响的分子动力学仿真模拟方案第46-54页
    4.1 分子动力学模拟模型的建立第46-49页
        4.1.1 粗粒化模型的建立第46-47页
        4.1.2 脂质生物膜模型的建立第47-49页
    4.2 粒子之间相互作用势第49-51页
    4.3 系统运动方程与仿真算法步骤第51-52页
    4.4 初始化参数及速度标度第52-53页
    4.5 本章小结第53-54页
第五章 脂质生物膜模拟系统的结构优化第54-63页
    5.1 10%含量活性分子的结构最优化第54-56页
    5.2 30%含量活性分子的结构最优化第56-57页
    5.3 50%含量活性分子的结构最优化第57-59页
    5.4 80%含量活性分子的结构最优化第59-62页
    5.5 本章小结第62-63页
第六章 活性分子对脂质膜穿透性的影响第63-76页
    6.1 活性分子(配体链)绑定力分析第63-65页
    6.2 水分子的聚合程度分析第65-69页
    6.3 不同含量活性分子对脂质生物膜结构影响分析第69-71页
    6.4 水分子的均方位移分析第71-74页
    6.5 本章小结第74-76页
第七章 总结与展望第76-78页
    7.1 本文总结第76-77页
    7.2 展望第77-78页
致谢第78-79页
参考文献第79-83页
攻读硕士学位期间取得的成果第83-84页
附录第84-87页

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