摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-19页 |
1.1 课题研究背景及意义 | 第10-11页 |
1.2 国内外研究现状 | 第11-18页 |
1.2.1 中尺度建模技术 | 第11-14页 |
1.2.2 纳米药物 | 第14-16页 |
1.2.3 分子模拟技术 | 第16-18页 |
1.3 本文主要工作 | 第18-19页 |
第二章 耗散粒子动力学技术 | 第19-25页 |
2.1 耗散粒子动力学计算 | 第19-21页 |
2.2 离子型表面活性剂胶束的计算 | 第21-22页 |
2.3 脂质分子的相行为计算 | 第22-24页 |
2.4 本章小结 | 第24-25页 |
第三章 分子动力学模拟技术 | 第25-46页 |
3.1 分子动力学模拟基本理论 | 第26-39页 |
3.1.1 运动方程的数值解法 | 第26-31页 |
3.1.2 力场 | 第31-37页 |
3.1.3 周期性边界条件与最近镜像 | 第37-39页 |
3.2 粗粒化模拟技术 | 第39-43页 |
3.2.1 粗粒化建模思想 | 第39-41页 |
3.2.2 特定粗粒化模型 | 第41-42页 |
3.2.3 积分步程的选取 | 第42-43页 |
3.3 模拟软件LAMMPS及MATERIALS STUDIO | 第43-45页 |
3.4 本章小结 | 第45-46页 |
第四章 活性分子对脂质膜穿透性影响的分子动力学仿真模拟方案 | 第46-54页 |
4.1 分子动力学模拟模型的建立 | 第46-49页 |
4.1.1 粗粒化模型的建立 | 第46-47页 |
4.1.2 脂质生物膜模型的建立 | 第47-49页 |
4.2 粒子之间相互作用势 | 第49-51页 |
4.3 系统运动方程与仿真算法步骤 | 第51-52页 |
4.4 初始化参数及速度标度 | 第52-53页 |
4.5 本章小结 | 第53-54页 |
第五章 脂质生物膜模拟系统的结构优化 | 第54-63页 |
5.1 10%含量活性分子的结构最优化 | 第54-56页 |
5.2 30%含量活性分子的结构最优化 | 第56-57页 |
5.3 50%含量活性分子的结构最优化 | 第57-59页 |
5.4 80%含量活性分子的结构最优化 | 第59-62页 |
5.5 本章小结 | 第62-63页 |
第六章 活性分子对脂质膜穿透性的影响 | 第63-76页 |
6.1 活性分子(配体链)绑定力分析 | 第63-65页 |
6.2 水分子的聚合程度分析 | 第65-69页 |
6.3 不同含量活性分子对脂质生物膜结构影响分析 | 第69-71页 |
6.4 水分子的均方位移分析 | 第71-74页 |
6.5 本章小结 | 第74-76页 |
第七章 总结与展望 | 第76-78页 |
7.1 本文总结 | 第76-77页 |
7.2 展望 | 第77-78页 |
致谢 | 第78-79页 |
参考文献 | 第79-83页 |
攻读硕士学位期间取得的成果 | 第83-84页 |
附录 | 第84-87页 |