蛋白质折叠的分子体积计算及处理
| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4页 |
| 第1章 绪论 | 第7-16页 |
| 1.1 论文研究思想 | 第7-8页 |
| 1.2 论文研究方法 | 第8-9页 |
| 1.3 蛋白质折叠的研究概述 | 第9-15页 |
| 1.3.1 第二遗传密码 | 第10-12页 |
| 1.3.2 热力学原理 | 第12-13页 |
| 1.3.3 蛋白质结构的预测 | 第13-15页 |
| 1.4 论文组织结构 | 第15-16页 |
| 第2章 氨基酸、蛋白质分子结构分析 | 第16-28页 |
| 2.1 氨基酸结构分析 | 第16-22页 |
| 2.1.1 蛋白质的结构单元 | 第16-19页 |
| 2.1.2 氨基酸的疏水性，化学作用和几何结构 | 第19-21页 |
| 2.1.3 氢键 | 第21-22页 |
| 2.2 蛋白质分子结构分析 | 第22-26页 |
| 2.2.1 蛋白质分子图 | 第22-23页 |
| 2.2.2 分子在空间中的键角，键长，二面角 | 第23-25页 |
| 2.2.3 蛋白质的疏水部分 | 第25-26页 |
| 2.3 蛋白质分子模型与表面模型 | 第26-28页 |
| 2.3.1 飘带模型与棍状模型 | 第26-27页 |
| 2.3.2 蛋白质分子的表面模型 | 第27-28页 |
| 第3章 实验原理分析 | 第28-41页 |
| 3.1 分子构象分析 | 第28-31页 |
| 3.2 分子表面 | 第31-32页 |
| 3.3 改变分子构象 | 第32-33页 |
| 3.4 吉布斯自由能 G(X) | 第33页 |
| 3.5 G(X)导数的求法 | 第33-35页 |
| 3.6 通过梯度计算使得 G(X)最小 | 第35-41页 |
| 第4章 实验计算与分析 | 第41-60页 |
| 4.1 实验设计 | 第41页 |
| 4.2 实验计算模块设计 | 第41-50页 |
| 4.2.1 蛋白质基本参数计算模块 | 第41-44页 |
| 4.2.2 凸面，凹面，马鞍面梯度计算模块 | 第44-50页 |
| 4.3 实验程序简述 | 第50-54页 |
| 4.3.1 显示颜色设置 | 第51-52页 |
| 4.3.2 多面体的计算 | 第52页 |
| 4.3.3 体积和面积的计算 | 第52页 |
| 4.3.4 呈现蛋白质分子 | 第52-54页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第54-59页 |
| 4.4.1 实验误差估计 | 第54-56页 |
| 4.4.2 实验图像显示 | 第56-57页 |
| 4.4.3 实验性能及优化 | 第57页 |
| 4.4.4 与非理论蛋白质折叠方法比较 | 第57-59页 |
| 4.5 实验总结 | 第59-60页 |
| 第5章 总结与展望 | 第60-62页 |
| 5.1 总结 | 第60页 |
| 5.2 展望 | 第60-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-65页 |
