| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-30页 |
| 1.1 芸薹属作物黄籽性状的遗传及基因定位 | 第13-18页 |
| 1.1.1 白菜黄籽性状的遗传与基因定位 | 第13-14页 |
| 1.1.2 甘蓝型油菜黄籽性状的遗传与基因定位 | 第14-16页 |
| 1.1.3 芥菜型油菜黄籽性状的遗传与基因定位 | 第16-17页 |
| 1.1.4 埃塞俄比亚芥菜黄籽性状的遗传与基因定位 | 第17页 |
| 1.1.5 芥蓝黄籽性状的遗传与基因定位 | 第17-18页 |
| 1.2 芸薹属作物种皮颜色基因鉴定及其研究进展 | 第18-20页 |
| 1.2.1 白菜种皮颜色候选基因的鉴定及研究进展 | 第18-19页 |
| 1.2.2 甘蓝型油菜种皮颜色候选基因的鉴定及研究进展 | 第19-20页 |
| 1.2.3 芥菜型油菜种皮颜色候选基因的鉴定及研究进展 | 第20页 |
| 1.3 拟南芥种皮颜色形成机理的研究进展 | 第20-25页 |
| 1.3.1 影响拟南芥种皮颜色的主要物质-类黄酮 | 第21页 |
| 1.3.2 类黄酮生物合成通路 | 第21-22页 |
| 1.3.3 MBW复合物调控类黄酮基因的研究进展 | 第22-23页 |
| 1.3.4 MBW复合物的功能及其DNA结合位点 | 第23-25页 |
| 1.4 转录组学在芸薹属作物研究中的应用 | 第25-27页 |
| 1.4.1 转录组学在白菜研究中的应用 | 第25-26页 |
| 1.4.2 转录组学在甘蓝型油菜研究中的应用 | 第26-27页 |
| 1.4.3 转录组学在芥菜型油菜研究中的应用 | 第27页 |
| 1.5 本研究的选题与思路 | 第27-30页 |
| 1.5.1 研究目的 | 第27-28页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第28页 |
| 1.5.3 本研究的技术路线 | 第28-30页 |
| 第二章 白菜黄籽性状的遗传分析与候选基因的精细定位 | 第30-40页 |
| 2.1 材料与方法 | 第31-34页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第31页 |
| 2.1.2 主要试验试剂与仪器 | 第31-32页 |
| 2.1.3 DNA制备及检测 | 第32页 |
| 2.1.4 SSR引物设计 | 第32-33页 |
| 2.1.5 SSR分子标记筛选 | 第33页 |
| 2.1.6 PCR扩增 | 第33页 |
| 2.1.7 遗传模型分析 | 第33页 |
| 2.1.8 构建遗传图谱 | 第33-34页 |
| 2.2 结果与分析 | 第34-38页 |
| 2.2.1 白菜种皮颜色遗传规律 | 第34页 |
| 2.2.2 与种皮颜色基因Brsc-ye连锁的SSR分子标记的筛选及初步连锁分析 | 第34-35页 |
| 2.2.3 白菜种皮颜色基因Brsc-ye精细遗传图谱的构建 | 第35-38页 |
| 2.2.4 白菜种皮颜色基因 Brsc-ye 的物理区间位置 | 第38页 |
| 2.3 讨论 | 第38-40页 |
| 第三章 白菜黄籽基因的克隆与分析 | 第40-53页 |
| 3.1 材料与方法 | 第40-43页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第40页 |
| 3.1.2 主要试验仪器与试剂 | 第40-41页 |
| 3.1.3 DNA制备及检测 | 第41页 |
| 3.1.4 总RNA提取及cDNA合成 | 第41页 |
| 3.1.5 全基因组重测序 | 第41-42页 |
| 3.1.6 候选基因预测 | 第42页 |
| 3.1.7 共分离标记的开发以及TTG1序列分析 | 第42页 |
| 3.1.8 基因表达分析 | 第42-43页 |
| 3.2 结果与分析 | 第43-52页 |
| 3.2.1 全基因组重测序分析 | 第43页 |
| 3.2.2 黄籽种皮颜色候选基因的鉴定 | 第43-44页 |
| 3.2.3 候选基因序列的克隆与分析 | 第44-46页 |
| 3.2.4 共分离标记的开发 | 第46-47页 |
| 3.2.5 不同来源TTG1氨基酸序列比较分析 | 第47-49页 |
| 3.2.6 候选基因BrTTG1的时空表达分析 | 第49-51页 |
| 3.2.7 参与类黄酮生物合成相关基因的表达 | 第51-52页 |
| 3.3 讨论 | 第52-53页 |
| 第四章 白菜黄色种子发育过程中的组织学和LC-MS/MS分析 | 第53-65页 |
| 4.1 材料与方法 | 第53-55页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第53页 |
| 4.1.2 主要试验试剂与仪器 | 第53-54页 |
| 4.1.3 不同发育时期种子的收集及固定 | 第54页 |
| 4.1.4 种皮DMACA染色 | 第54页 |
| 4.1.5 石蜡切片的制作、TBO 染色和切片观察 | 第54页 |
| 4.1.6 类黄酮类物质的提取 | 第54-55页 |
| 4.1.7 类黄酮类物质的LC-MS/MS分析 | 第55页 |
| 4.2 结果与分析 | 第55-64页 |
| 4.2.1 不同发育时期种子种皮颜色变化及种皮DMACA染色 | 第55-56页 |
| 4.2.2 不同发育时期种子切片TBO染色观察 | 第56-57页 |
| 4.2.3 不同发育时期种子色素成分的LC-MS/MS分析 | 第57-64页 |
| 4.3 讨论 | 第64-65页 |
| 第五章 白菜黄籽形成过程中的转录组学分析 | 第65-103页 |
| 5.1 材料与方法 | 第65-69页 |
| 5.1.1 试验材料 | 第65页 |
| 5.1.2 主要试验试剂与仪器 | 第65-66页 |
| 5.1.3 RNA提取 | 第66页 |
| 5.1.4 转录组文库构建 | 第66-67页 |
| 5.1.5 测序数据的组装和注释 | 第67页 |
| 5.1.6 RT-PCR验证转录组数据 | 第67-68页 |
| 5.1.7 差异表达基因的筛选与分析 | 第68页 |
| 5.1.8 差异表达基因的聚类分析 | 第68-69页 |
| 5.1.9 加权基因共表达网络共表达分析 | 第69页 |
| 5.2 结果与分析 | 第69-99页 |
| 5.2.1 RNA提取及质量检测 | 第69页 |
| 5.2.2 转录组测序与组装结果 | 第69-72页 |
| 5.2.3 转录组数据的RT-PCR分析 | 第72-74页 |
| 5.2.4 差异表达基因分析及功能富集 | 第74-86页 |
| 5.2.5 与种皮颜色形成相关的DEGs分析 | 第86-96页 |
| 5.2.6 与种皮颜色形成相关的DEGs与TTG1的共表达网络WGCNA分析 | 第96-97页 |
| 5.2.7 白菜黄色种皮色素形成的基因网络分析 | 第97-99页 |
| 5.3 讨论 | 第99-103页 |
| 第六章 结论、创新点与展望 | 第103-106页 |
| 6.1 结论 | 第103-104页 |
| 6.2 创新点 | 第104页 |
| 6.3 展望 | 第104-106页 |
| 参考文献 | 第106-119页 |
| 附录 | 第119-138页 |
| 缩略词 | 第138-140页 |
| 致谢 | 第140-141页 |
| 作者简介 | 第141-142页 |
