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水稻气孔性状相关基因的克隆与SNP多态性分析

摘要第13-14页
Abstract第14-15页
第一章 文献综述第16-25页
    1.1 气孔的发育第16页
    1.2 转录因子对气孔发育的调控第16-18页
        1.2.1 bHLH转录因子第16-17页
        1.2.2 MYB转录因子第17页
        1.2.3 Dof转录因子第17-18页
    1.3 气孔发育的负调控因子及受体第18-19页
    1.4 环境对气孔发育的影响及其调控机制第19-20页
        1.4.1 植物气孔响应CO2浓度变化的分子机制第19-20页
        1.4.2 响应光信号的气孔发育因子第20页
        1.4.3 激素对气孔发育的影响第20页
    1.5 基因克隆技术第20-22页
        1.5.1 基因芯片技术第21页
        1.5.2 功能克隆第21页
        1.5.3 定位克隆第21-22页
        1.5.4 同源序列法第22页
    1.6 比较基因组学第22-24页
        1.6.1 比较基因组学研究方法第22-23页
        1.6.2 比较基因组学的应用第23-24页
    1.7 转基因技术第24页
    1.8 本研究的目的意义第24-25页
第二章 CA1和CA4基因的鉴定第25-40页
    2.1 材料与方法第25-30页
        2.1.1 植物材料第25页
        2.1.2 质粒与菌株第25页
        2.1.3 酶与其他试剂第25页
        2.1.4 溶液和培养基配制第25页
        2.1.5 仪器及生物学软件第25-26页
        2.1.6 水稻总RNA的提取第26页
        2.1.7 反转录合成第一链cDNA的方法步骤第26-27页
        2.1.8 水稻CA1和CA4基因的PCR反应体系与程序第27页
        2.1.9 PCR产物胶回收方法与步骤第27-28页
        2.1.10 TA克隆的方法与步骤第28-29页
        2.1.11 阳性克隆筛选的方法第29-30页
        2.1.12 序列测定及分析第30页
    2.2 粳籼稻总RNA的提取第30页
    2.3 CA1和CA4基因的克隆与序列分析第30-34页
        2.3.1 CA1基因的克隆与序列分析第31-32页
        2.3.2 CA4基因的克隆与序列分析第32-34页
    2.4 CA1和CA4基因的SNP位点分析第34-37页
        2.4.1 CA1基因的SNP位点分析第34-35页
        2.4.2 CA4基因的SNP位点分析第35-37页
    2.5 CA1和CA4基因的分子进化分析第37-38页
        2.5.1 水稻CA1基因的分子进化分析第37-38页
        2.5.2 水稻CA4基因的分子进化分析第38页
    2.6 结论与讨论第38-40页
第三章 水稻FLP基因的鉴定第40-48页
    3.1 材料与方法第40-41页
        3.1.1 植物材料第40页
        3.1.2 质粒与菌株第40页
        3.1.3 酶与其他试剂第40页
        3.1.4 溶液和培养基配制第40页
        3.1.5 仪器及生物学软件第40页
        3.1.6 水稻总RNA的提取第40页
        3.1.7 反转录合成第一链cDNA的方法步骤第40页
        3.1.8 水稻FLP基因的PCR反应体系与程序第40页
        3.1.9 PCR产物胶回收方法与步骤第40-41页
        3.1.10 TA克隆的方法与步骤第41页
        3.1.11 FLP 基因菌落 PCR 反应体系与程序第41页
        3.1.12 序列测定及分析第41页
    3.2 水稻FLP基因的克隆及序列分析第41-44页
        3.2.1 水稻FLP基因的克隆第41-42页
        3.2.2 水稻FLP基因的序列分析第42-44页
    3.3 水稻FLP基因的SNP位点分析第44-46页
    3.4 水稻FLP基因的分子进化分析第46页
    3.5 结论与讨论第46-48页
第四章 水稻STO、TMM和SDD1基因的鉴定第48-68页
    4.1 材料与方法第48-50页
        4.1.1 植物材料第48页
        4.1.2 质粒与菌株第48页
        4.1.3 酶与其他试剂第48页
        4.1.4 溶液和培养基配制第48页
        4.1.5 仪器及生物学软件第48页
        4.1.6 水稻总RNA的提取第48页
        4.1.7 反转录合成第一链cDNA的方法步骤第48页
        4.1.8 水稻STO、TMM和SDD1基因的PCR反应体系与程序第48-49页
        4.1.9 PCR产物胶回收方法与步骤第49-50页
        4.1.10 TA克隆的方法与步骤第50页
        4.1.11 STO、TMM 和 SDD1 基因菌落 PCR 反应体系与程序第50页
        4.1.12 序列测定及分析第50页
    4.2 水稻STO、TMM和SDD1基因的克隆与序列分析第50-58页
        4.2.1 水稻STO基因的克隆与序列分析第50-51页
        4.2.2 水稻TMM基因的克隆与序列分析第51-54页
        4.2.3 水稻SDD1基因的克隆与序列分析第54-58页
    4.3 水稻STO、TMM和SDD1基因SNP位点的分析第58-63页
        4.3.1 STO基因的SNP位点的分析第58-59页
        4.3.2 TMM基因的SNP位点的分析第59-62页
        4.3.3 SDD1基因的SNP位点的分析第62-63页
    4.4 水稻STO、TMM和SDD1基因分子进化分析第63-66页
        4.4.1 STO基因的分子进化分析第63-64页
        4.4.2 TMM基因的分子进化分析第64-65页
        4.4.3 SDD1基因的分子进化分析第65-66页
    4.5 结果与讨论第66-68页
第五章 气孔性状基因过表达功能验证第68-78页
    5.1 材料与方法第68-71页
        5.1.1 植物材料第68页
        5.1.2 载体与菌株第68页
        5.1.3 酶与试剂第68页
        5.1.4 仪器第68页
        5.1.5 植物表达、酶切反应及转基因植株鉴定第68-71页
        5.1.6 荧光定量PCR第71页
    5.2 转基因植株的获得第71-72页
    5.3 转基因植株的检测第72-74页
        5.3.1 转OsSTO基因植株的检测第72-73页
        5.3.2 转OsTMM基因植株的检测第73页
        5.3.3 转OsSDD1基因植株的检测第73-74页
    5.4 转基因植株的气孔差异分析第74-76页
        5.4.1 转基因植株基因表达的检测第74页
        5.4.2 转基因植株气孔性状调查第74-76页
    5.5 结论与讨论第76-78页
参考文献第78-82页
致谢第82-83页
攻读学位论文期间发表文章第83-84页

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