| 摘要 | 第6-8页 |
| abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第14-30页 |
| 1.1 植物内生菌 | 第14-16页 |
| 1.1.1 植物内生细菌的概念 | 第14页 |
| 1.1.2 植物内生细菌的生物学意义 | 第14-16页 |
| 1.1.3 植物细菌与信号转导 | 第16页 |
| 1.2 GacS/GacA双组分信号转导系统在细菌中的调控作用 | 第16-27页 |
| 1.2.1 细菌双组分信号转导系统简述 | 第16-17页 |
| 1.2.2 GacS/GacA双组分信号转导系统 | 第17-18页 |
| 1.2.3 GacS/GacA双组分调控系统的功能 | 第18-20页 |
| 1.2.4 GacA与群体感应系统 | 第20-21页 |
| 1.2.5 Gac/Rsm/sRNAs介导的级联调控网络 | 第21-26页 |
| 1.2.6 GacA组学研究进展 | 第26-27页 |
| 1.3 研究目的、主要内容和技术路线 | 第27-30页 |
| 1.3.1 研究目的与意义 | 第28页 |
| 1.3.2 主要研究内容 | 第28-29页 |
| 1.3.3 技术路线 | 第29-30页 |
| 第二章 GacA对P.chlororaphis G5全细胞蛋白表达谱的影响 | 第30-59页 |
| 2.1 材料与试剂 | 第30-32页 |
| 2.1.1 主要试剂 | 第30页 |
| 2.1.2 主要仪器 | 第30页 |
| 2.1.3 主要溶剂及缓冲液配制 | 第30-32页 |
| 2.1.4 菌株及质粒 | 第32页 |
| 2.1.5 细菌培养条件 | 第32页 |
| 2.2 方法与步骤 | 第32-38页 |
| 2.2.1 细胞总蛋白提取 | 第32-33页 |
| 2.2.2 样品定量 | 第33页 |
| 2.2.3 细胞总蛋白的双向电泳分离 | 第33-36页 |
| 2.2.4 质谱分析 | 第36-37页 |
| 2.2.5 生物信息学分析 | 第37-38页 |
| 2.3 结果与分析 | 第38-52页 |
| 2.3.1 细胞蛋白差异蛋白组学表达谱分析 | 第38-39页 |
| 2.3.2 差异蛋白的质谱鉴定 | 第39-41页 |
| 2.3.3 差异蛋白的功能注释 | 第41-42页 |
| 2.3.4 蛋白功能归类 | 第42-51页 |
| 2.3.5 蛋白亚细胞定位 | 第51-52页 |
| 2.4 讨论 | 第52-57页 |
| 2.5 小结 | 第57-59页 |
| 第三章 GacA对P.chlororaphis G5胞外分泌蛋白表达谱的影响 | 第59-89页 |
| 3.1 材料与试剂 | 第59页 |
| 3.2 方法与步骤 | 第59-60页 |
| 3.2.1 胞外蛋白提取 | 第59页 |
| 3.2.2 细胞外分泌蛋白的双向电泳分离 | 第59页 |
| 3.2.3 质谱分析 | 第59页 |
| 3.2.4 功能蛋白相互作用网络 | 第59-60页 |
| 3.3 结果与分析 | 第60-77页 |
| 3.3.1 胞外分泌蛋白差异表达分析 | 第60-63页 |
| 3.3.2 分泌蛋白功能注释与分类 | 第63-73页 |
| 3.3.3 生物信息学分析 | 第73-75页 |
| 3.3.4 细胞和细胞外鉴定的差异蛋白比较 | 第75页 |
| 3.3.5 差异蛋白的5’-UTR序列分析 | 第75-76页 |
| 3.3.6 功能蛋白相互作用网络 | 第76-77页 |
| 3.4 讨论 | 第77-87页 |
| 3.5 小结 | 第87-89页 |
| 第四章 差异蛋白相关表型验证 | 第89-110页 |
| 4.1 试剂及材料 | 第89-90页 |
| 4.1.1 主要溶液及缓冲液配制 | 第89-90页 |
| 4.2 实验方法与步骤 | 第90-94页 |
| 4.2.1 生长曲线 | 第90页 |
| 4.2.2 gacA突变对桔黄色素吩嗪的影响 | 第90页 |
| 4.2.3 蛋白酶活性检测 | 第90页 |
| 4.2.4 HPLC法检测IAA | 第90页 |
| 4.2.5 超氧化物歧化酶SOD活性测定 | 第90-91页 |
| 4.2.6 过氧化氢酶CAT活性测定 | 第91页 |
| 4.2.7 鞭毛蛋白提取与鉴定 | 第91-92页 |
| 4.2.8 Tricine-SDS-PAGE检测脂多糖 | 第92-94页 |
| 4.3 结果与分析 | 第94-104页 |
| 4.3.1 重要差异蛋白表达图谱分析 | 第94-96页 |
| 4.3.2 GacA正调控P.chlororaphis G5吩嗪桔黄色素的产生 | 第96-97页 |
| 4.3.4 gacA突变对蛋白酶活性的影响 | 第97-98页 |
| 4.3.5 gacA突变提高SOD酶和过氧化氢酶活性 | 第98-100页 |
| 4.3.6 GacA负调控鞭毛蛋白的产生 | 第100-101页 |
| 4.3.7 GacA对脂多糖LPS的影响 | 第101-103页 |
| 4.3.8 GacA正调控IAA的产生 | 第103-104页 |
| 4.4 讨论 | 第104-109页 |
| 4.5 小结 | 第109-110页 |
| 第五章 总结与展望 | 第110-113页 |
| 参考文献 | 第113-127页 |
| 致谢 | 第127-128页 |
| 在学期间发表的论文 | 第128页 |
