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基于转录组数据的甘蓝型油菜自交不亲和相关基因的挖掘

摘要第6-7页
ABSTRACT第7页
缩略语表第8-9页
1 前言第9-22页
    1.1 自交不亲和性的概述第9-10页
    1.2 自交不亲和的分类第10-13页
    1.3 自交不亲和的分子机理第13-16页
    1.4 花粉与柱头的识别反应第16-19页
    1.5 甘蓝型油菜自交不亲和性的研究和应用第19-21页
    1.6 研究目的和意义第21-22页
2 材料与方法第22-31页
    2.1 实验材料第22页
        2.1.1 植物材料第22页
        2.1.2 载体和菌株第22页
    2.2 研究方法第22-30页
        2.2.1 油菜柱头总RNA的抽提及检测第22-23页
        2.2.2 RT-PCR及Real time-PCR第23-24页
            2.2.2.1 cDNA第一条链合成第23页
            2.2.2.2 RT-PCR 反应第23页
            2.2.2.3 Real-time PCR第23-24页
        2.2.3 PCR反应及片段的克隆,测序第24-26页
            2.2.3.1 PCR反应体系及片段回收第24-25页
            2.2.3.2 E. coli感受态细胞制备第25页
            2.2.3.3 片段连接转化第25-26页
            2.2.3.4 重组子的筛选与测序第26页
        2.2.4 干涉载体构建第26-27页
        2.2.5 农杆菌介导的油菜遗传转化第27-29页
        2.2.6 油菜DNA提取第29页
        2.2.7 花粉萌发观察第29-30页
    2.3 转录组测序第30-31页
        2.3.1 cDNA文库构建和Solexa/Illumina测序第30页
        2.3.2 转录组数据处理第30页
        2.3.3 DEGs的分析与注释第30-31页
3 结果与分析第31-53页
    3.1 转录组的分析及挖掘第31-48页
        3.1.1 ‘Westar’的授粉特性第31-32页
        3.1.2 转录组的数据的处理及比对的结果第32页
        3.1.3 基因的差异表达分析第32-34页
        3.1.4 差异表达基因的GO注释与富集分析第34-48页
            3.1.4.1 差异表达基因的GO注释第34-38页
            3.1.4.2 差异表达基因的富集分析第38-40页
            3.1.4.3 蛋白激酶类基因和泛素化相关基因的鉴定及分析第40-41页
            3.1.4.4 转录因子的鉴定及分析第41-43页
            3.1.4.5 柱头优势表达基因的鉴定及分析第43-45页
            3.1.4.6 CPRs相关基因的鉴定及分析第45-48页
    3.2 QRT-PCR对转录组数据进行验证第48-49页
    3.3 CPK34基因功能的初步研究第49-53页
        3.3.1 候选基因干涉载体的构建第49-50页
        3.3.2 转基因植株花粉管萌发的荧光观察实验第50-52页
        3.3.3 转基因植株结籽情况第52-53页
4 讨论第53-60页
    4.1 亲和/不亲和的反应存在一些共同的生物过程第53页
    4.2 泛素化相关基因可能参与花粉与柱头不亲和反应第53-54页
    4.3 蛋白激酶类基因可能参与花粉与柱头不亲和反应第54-55页
    4.4 转录因子可能在花粉与柱头识别反应中发挥重要作用第55-56页
    4.5 花粉与柱头识别反应和病原体与植物的抗病反应第56-57页
    4.6 CPK34在花粉与柱头自交不亲和识别反应中的作用第57-58页
    4.7 总结与展望第58-60页
参考文献第60-69页
致谢第69页

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