基于RNA-Seq的蒙古柳(Salix linearistipularis)雌雄花芽萌动期特异表达基因解析
摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
1 绪论 | 第12-17页 |
2 材料与方法 | 第17-21页 |
2.1 实验材料 | 第17页 |
2.2 实验方法 | 第17-21页 |
2.2.1 cDNA文库制备与测序 | 第17页 |
2.2.2 数据评估及组装 | 第17-18页 |
2.2.3 Unigene功能注释 | 第18页 |
2.2.4 差异表达基因分析 | 第18-19页 |
2.2.5 雌雄花芽萌动期共有基因分析策略 | 第19页 |
2.2.6 雌雄花芽特异基因分析策略 | 第19页 |
2.2.7 雌雄个体特异表达基因分析策略 | 第19-20页 |
2.2.8 实时定量PCR分析 | 第20-21页 |
3 结果与分析 | 第21-50页 |
3.1 数据组装与评估 | 第21-26页 |
3.1.1 样本相关性检验 | 第21-22页 |
3.1.2 数据组装结果 | 第22页 |
3.1.3 Unigene功能注释分析 | 第22-26页 |
3.2 雌雄花芽共有基因的解析 | 第26-35页 |
3.2.1 雌雄花芽共有基因 | 第26-28页 |
3.2.2 雌雄花芽共有基因富集分析 | 第28-35页 |
3.3 雌花芽萌动期特异表达基因解析 | 第35-40页 |
3.3.1 雌花芽萌动期特异基因 | 第35页 |
3.3.2 雌花芽萌动期特异基因富集分析 | 第35-37页 |
3.3.3 雌花芽萌动期高表达高倍数特异基因分析 | 第37-40页 |
3.4 雄花芽萌动期特异表达的基因解析 | 第40-45页 |
3.4.1 雄花芽萌动期特异基因 | 第40-41页 |
3.4.2 雄花芽萌动期特异基因富集分析 | 第41-43页 |
3.4.3 雄花芽萌动期高表达高倍数特异基因分析 | 第43-45页 |
3.5 雌雄个体特异表达基因筛选 | 第45-48页 |
3.6 实时定量PCR验证 | 第48-50页 |
结论与讨论 | 第50-52页 |
参考文献 | 第52-58页 |
附录 | 第58-66页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第66-67页 |
致谢 | 第67-68页 |