| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 1 前言 | 第9-18页 |
| 1.1 海洋石油污染 | 第9-10页 |
| 1.1.1 海洋石油污染的现状 | 第9页 |
| 1.1.2 海洋石油污染的危害 | 第9-10页 |
| 1.1.3 海洋石油污染的治理 | 第10页 |
| 1.2 石油降解菌 | 第10-17页 |
| 1.2.1 石油降解菌的研究现状 | 第10-11页 |
| 1.2.2 石油降解菌的降解性能 | 第11-14页 |
| 1.2.3 石油降解菌的基因组学 | 第14-17页 |
| 1.3 本文的研究目的及研究意义 | 第17-18页 |
| 2 菌株的分离与鉴定 | 第18-25页 |
| 2.1 实验样品 | 第18页 |
| 2.2 实验仪器 | 第18-19页 |
| 2.3 实验培养基与试剂 | 第19-21页 |
| 2.3.1 实验试剂 | 第19-20页 |
| 2.3.2 主要试剂的配制 | 第20页 |
| 2.3.3 主要培养基的配制 | 第20-21页 |
| 2.4 实验方法 | 第21-22页 |
| 2.4.1 菌株的富集与分离 | 第21页 |
| 2.4.2 菌株的形态学分析 | 第21页 |
| 2.4.3 菌株的生理生化分析 | 第21页 |
| 2.4.4 菌株的分子生物学分析 | 第21-22页 |
| 2.5 实验结果与分析 | 第22-24页 |
| 2.5.1 菌株的分离与形态 | 第22-23页 |
| 2.5.2 菌株的生理生化特征 | 第23-24页 |
| 2.5.3 菌株的分子生物学鉴定 | 第24页 |
| 2.6 本章小结 | 第24-25页 |
| 3 菌株的降解性能与生长状况 | 第25-36页 |
| 3.1 实验仪器 | 第25页 |
| 3.2 实验培养基与试剂 | 第25-26页 |
| 3.3 实验方法 | 第26-27页 |
| 3.3.1 石油烃组分变化测定 | 第26页 |
| 3.3.2 菌株的生长状况 | 第26-27页 |
| 3.3.3 菌株的降解趋势 | 第27页 |
| 3.4 实验结果与分析 | 第27-34页 |
| 3.4.1 菌株对烷烃的降解率 | 第27-28页 |
| 3.4.2 菌株对环烃的降解率 | 第28-30页 |
| 3.4.3 菌株对芳香烃的降解率 | 第30-32页 |
| 3.4.4 菌株Tust-DM21的降解趋势与效果分析 | 第32-34页 |
| 3.5 本章小结 | 第34-36页 |
| 4 菌株ACINETOBACTER SP.TUST-DM21的基因组测序及降解基因分析 | 第36-63页 |
| 4.1 实验样品 | 第36页 |
| 4.2 实验仪器 | 第36-37页 |
| 4.3 实验试剂 | 第37页 |
| 4.4 实验方法 | 第37-41页 |
| 4.4.1 细菌基因组DNA的提取 | 第37-38页 |
| 4.4.2 基因组DNA样品检测 | 第38页 |
| 4.4.3 基因组文库建立 | 第38-39页 |
| 4.4.4 全基因组测序分析 | 第39-40页 |
| 4.4.5 Acinetobacter sp. Tust-DM21的石油烃降解基因分析 | 第40页 |
| 4.4.6 Acinetobacter sp. Tust-DM21代谢途径的分析 | 第40-41页 |
| 4.5 实验结果及分析 | 第41-62页 |
| 4.5.1 细菌基因组DNA的检测 | 第41页 |
| 4.5.2 原始数据质控 | 第41-42页 |
| 4.5.3 全基因组组装及预测 | 第42页 |
| 4.5.4 基因组COG功能注释 | 第42-45页 |
| 4.5.5 基因组圈图 | 第45-46页 |
| 4.5.6 Acinetobacter sp. Tust-DM21的石油烃降解基因分析 | 第46-59页 |
| 4.5.7 Acinetobacter sp. Tust-DM21代谢途径的初步探讨 | 第59-62页 |
| 4.6 本章小结 | 第62-63页 |
| 5 结论与展望 | 第63-64页 |
| 5.1 结论 | 第63页 |
| 5.2 展望 | 第63-64页 |
| 6 参考文献 | 第64-70页 |
| 7 攻读硕士学位期间发表论文情况 | 第70-71页 |
| 8 致谢 | 第71页 |
