| 致谢 | 第1-6页 |
| 中文摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 第1章 多重耐药鲍曼不动杆菌MDR-ZJ06全基因组测序及序列分析 | 第13-45页 |
| ·前言 | 第13-14页 |
| ·材料与方法 | 第14-22页 |
| ·材料 | 第14-15页 |
| ·菌株来源 | 第14页 |
| ·仪器与试剂 | 第14-15页 |
| ·方法 | 第15-22页 |
| ·MLST分析 | 第15-17页 |
| ·药敏实验 | 第17页 |
| ·基因组DNA提取 | 第17-18页 |
| ·基于焦磷酸测序技术的高通量测序(454平台) | 第18页 |
| ·基因组注释和分析 | 第18-21页 |
| ·基因组系统进化分析 | 第21页 |
| ·荧光定量分析 | 第21页 |
| ·序列递交 | 第21-22页 |
| ·结果与讨论 | 第22-40页 |
| ·结果 | 第22-37页 |
| ·药敏结果 | 第22-23页 |
| ·鲍曼不动杆菌MDR-ZJ06的ST型分析 | 第23页 |
| ·基因组拼接及注释 | 第23-26页 |
| ·基因组进化比较分析 | 第26-29页 |
| ·基因组上最大的耐药岛分析 | 第29-31页 |
| ·碳青霉烯酶基因bla_(OXA-23)及其基因环境 | 第31-32页 |
| ·质粒pZJ06及其编码的甲基化酶基因armA | 第32-34页 |
| ·基因组上其它耐药元件 | 第34-37页 |
| ·讨论 | 第37-40页 |
| 第1章 参考文献 | 第40-45页 |
| 第2章 多重耐药鲍曼不动杆菌“耐药岛”AbaGI | 第45-65页 |
| ·前言 | 第45-46页 |
| ·材料与方法 | 第46-53页 |
| ·材料 | 第46-47页 |
| ·菌株来源 | 第46页 |
| ·仪器与试剂 | 第46-47页 |
| ·方法 | 第47-53页 |
| ·耐药岛的比较基因组学分析 | 第47-48页 |
| ·MLST分型 | 第48页 |
| ·“耐药岛”AbaGI的筛查 | 第48-49页 |
| ·药敏实验及药敏结果的比较 | 第49-50页 |
| ·“耐药岛”AbaGI基因片段克隆表达验证实验 | 第50-53页 |
| ·结果与讨论 | 第53-62页 |
| ·结果 | 第53-61页 |
| ·鲍曼不动杆菌基因组进化关系分析 | 第53页 |
| ·比较基因组学分析 | 第53-55页 |
| ·新发现耐药岛AbaGI特征分析 | 第55-56页 |
| ·验证菌株的挑选 | 第56-58页 |
| ·两组验证菌株药敏结果的比较 | 第58-60页 |
| ·克隆验证结果 | 第60-61页 |
| ·讨论 | 第61-62页 |
| 第2章 参考文献 | 第62-65页 |
| 第3章 综述鲍曼不动杆菌基因组与耐药性 | 第65-95页 |
| ·鲍曼不动杆菌的生物学特性 | 第65页 |
| ·鲍曼不动杆菌的耐药特点及耐药机制 | 第65-71页 |
| ·鲍曼不动杆菌耐药的分子基础 | 第65-66页 |
| ·鲍曼不动杆菌的耐药机制 | 第66-69页 |
| ·多重耐药鲍曼不动杆菌分子流行病学现状 | 第69-71页 |
| ·耐药基因组的研究意义及全基因组测序的现状 | 第71-74页 |
| ·耐药岛的分析和演变 | 第74-81页 |
| ·耐药岛的检测 | 第74-78页 |
| ·AbaR型耐药岛的结构和演变 | 第78-81页 |
| 第3章 参考文献 | 第81-95页 |
| 作者简历及攻读博士学位期间主要的研究成果 | 第95页 |