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小菜蛾免疫虫生真菌侵染动力学的DGE分析及其Toll基因功能研究

摘要第3-6页
Abstract第6-8页
1 前言第16-23页
    1.1 昆虫的免疫系统第16-17页
    1.2 Toll信号途径和Imd信号途径第17-19页
    1.3 Toll受体的研究进展第19-20页
    1.4 玫烟色棒束孢的研究进展第20-21页
    1.5 DGE测序的研究进展第21-22页
    1.6 小菜蛾的研究第22页
    1.7 本论文的研究目的与意义第22-23页
        1.7.1 本论文的研究目的第22-23页
        1.7.2 本论文的研究意义第23页
2 实验材料第23-29页
    2.1 供试昆虫和动物第23页
    2.2 质粒与菌株第23页
    2.3 主要仪器设备第23-24页
    2.4 主要试剂药品第24页
    2.5 主要培养基第24-25页
    2.6 主要试剂的配制第25-26页
    2.7 原生质体制备相关溶液的配制第26页
    2.8 SDS-PAGE相关溶液的配制第26-27页
    2.9 蛋白纯化相关溶液的配制第27-28页
    2.10 Western Blot相关溶液的配制第28页
    2.11 酶联免疫(ELISA)相关溶液的配制第28页
    2.12 其他缓冲液第28-29页
3 实验方法第29-51页
    3.1 小菜蛾DGE的测序方法第29-30页
        3.1.1 实验流程第29-30页
        3.1.2 标准信息分析流程第30页
    3.2 小菜蛾Toll基因的克隆与序列分析第30-39页
        3.2.1 小菜蛾总RNA的提取和检测第30-32页
        3.2.2 小菜蛾Toll基因CDS序列的扩增第32-36页
            3.2.2.1 cDNA的合成第32-33页
            3.2.2.2 引物设计第33页
            3.2.2.3 PCR反应第33页
            3.2.2.4 PCR产物回收第33-34页
            3.2.2.5 大肠杆菌感受态细胞的制备第34页
            3.2.2.6 PCR产物与pMD18-T载体连接反应第34页
            3.2.2.7 细菌的转化第34-35页
            3.2.2.8 重组质粒的小量提取第35页
            3.2.2.9 重组质粒的酶切鉴定第35-36页
            3.2.2.10 序列比对和分析第36页
        3.2.3 小菜蛾Toll基因全长的获得第36-39页
            3.2.3.1 cDNA 3’和 5’末端的合成第36-37页
            3.2.3.2 RACE引物的设计与合成第37页
            3.2.3.3 RACE PCR第37-38页
            3.2.3.4 小菜蛾Toll基因全序列的拼接和生物信息学分析第38-39页
    3.3 小菜蛾Toll基因的原核表达与多克隆抗体制备第39-45页
        3.3.1 小菜蛾Toll基因的原核表达第39-43页
            3.3.1.1 小菜蛾Toll基因表达片段的PCR扩增第39页
            3.3.1.2 质粒的双酶切和回收第39-40页
            3.3.1.3 pGEX4T-1 与Toll基因表达片段的连接第40页
            3.3.1.4 原核表达第40-41页
            3.3.1.5 Western blot检验第41-42页
            3.3.1.6 蛋白的纯化第42-43页
        3.3.2 多克隆抗体的制备第43-45页
            3.3.2.1 多克隆抗体的制备和纯化第43-44页
            3.3.2.2 抗体滴度的测定第44页
            3.3.2.3 多克隆抗体的Western blot检测第44-45页
    3.4 真菌孢子对小菜蛾的致病力第45-46页
        3.4.1 真菌孢子悬浮液的配制第45页
        3.4.2 处理与收集样品第45-46页
    3.5 真菌孢子对小菜蛾Toll基因表达的诱导第46-47页
    3.6 小菜蛾Toll基因的RNAi第47-51页
        3.6.1 RNAi靶标片段的选择第47页
        3.6.2 dsRNA表达载体的构建第47-49页
        3.6.3 原生质体的制备第49页
        3.6.4 原生质体的纯化第49页
        3.6.5 原生质体的转化第49-50页
        3.6.6 重组菌株的筛选第50页
        3.6.7 RNAi的实施第50-51页
4 结果和分析第51-81页
    4.1 DGE数据质量评估第51-55页
        4.1.1 玫烟色棒束孢毒力测定第51页
        4.1.2 DGE测序评估第51-55页
            4.1.2.1 样品与参考基因比对的统计结果第51-52页
            4.1.2.2 测序质量评估第52页
            4.1.2.3 测序饱和度分析第52-53页
            4.1.2.4 测序随机性分析第53-54页
            4.1.2.5 基因覆盖度统计第54-55页
    4.2 DGE数据分析第55-58页
        4.2.1 相关性分析第55页
        4.2.2 差异基因分析第55-56页
        4.2.3 免疫相关基因差异分析第56-58页
    4.3 小菜蛾Toll基因序列的克隆第58-62页
        4.3.1 小菜蛾总RNA的提取第58-59页
        4.3.2 Toll2、Toll5、Toll 11 基因的ORF扩增第59-60页
        4.3.3 Toll 2、Toll 5、Toll 11 基因 5’和 3’端序列的扩增第60-62页
            4.3.3.1 Toll 2 基因 5’和 3’端序列的扩增第60-61页
            4.3.3.2 Toll 5 基因 5’和 3’端序列的扩增第61页
            4.3.3.3 Toll 11 基因 5’和 3’端序列的扩增第61-62页
    4.4 Toll 2、Toll 5、Toll 11 基因全长序列的拼接和分析第62-70页
        4.4.1 Toll 2 基因全长序列的拼接和分析第62页
        4.4.2 Toll 5 基因全长序列的拼接和分析第62-63页
        4.4.3 Toll 11 基因全长序列的拼接和分析第63-70页
    4.5 不同真菌孢子侵染小菜蛾不同时间后对Toll基因表达量的影响第70-75页
        4.5.1 玫烟色棒束孢孢子悬浮液处理小菜蛾第70-72页
        4.5.2 白僵菌孢子悬浮液处理小菜蛾第72-73页
        4.5.3 绿僵菌孢子悬浮液处理小菜蛾第73-75页
    4.6 Toll 2 基因RNAi第75-77页
        4.6.1 Toll 2 基因dsRNA的合成第75-76页
        4.6.2 Toll 2 基因dsRNA表达质粒的转染第76-77页
            4.6.2.1 原生质体的制备与纯化第76页
            4.6.2.2 Toll2基因的转染第76-77页
        4.6.3 RNAi的实施第77页
    4.7 Toll 2 基因原核表达及抗血清的制备第77-81页
        4.7.1 Toll 2 基因表达片段的扩增第77-78页
        4.7.2 Toll 2 表达载体的构建第78页
        4.7.3 Toll 2 的蛋白表达第78-79页
        4.7.4 抗血清纯化第79-81页
5 结论与讨论第81-87页
    5.1 结论第81-82页
    5.2 讨论第82-85页
    5.3 展望第85-86页
    5.4 本研究的创新点第86-87页
致谢第87-88页
基金第88-89页
参考文献第89-93页
附录Ⅰ pMD18-T Vector map第93-94页
附录Ⅱ pGEX-4T-1 map第94-95页
附录Ⅲ pSilent-1 map第95-96页
附录Ⅳ 引物第96-99页
附录Ⅴ 硕士期间发表论文第99页

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