中文摘要 | 第9-11页 |
第一章 文献综述 | 第11-47页 |
1 植物抗病反应的分子生物学研究 | 第11-15页 |
1.1 抗病机制模型 | 第11-12页 |
1.2 抗病基因的研究进展 | 第12-14页 |
1.3 信号传导与防卫基因 | 第14-15页 |
1.3.1 信号传导 | 第14-15页 |
1.3.2 防卫基因 | 第15页 |
2 小麦白粉病抗病相关基因的研究 | 第15-18页 |
2.1 小麦白粉病抗病基因 | 第16页 |
2.2 小麦抗白粉病防卫基因的研究 | 第16-18页 |
3 EST技术及其应用 | 第18-27页 |
3.1 EST与植物EST计划 | 第18-23页 |
3.1.1 EST技术 | 第18-19页 |
3.1.2 植物基因组计划 | 第19-20页 |
3.1.3 小麦EST计划研究进展 | 第20-23页 |
3.2 EST技术的应用 | 第23-26页 |
3.3 EST技术中常遇的两个问题 | 第26-27页 |
4 功能基因组学与基因表达谱 | 第27-35页 |
4.1 功能基因组学 | 第27-28页 |
4.2 基因功能研究内容 | 第28-31页 |
4.2.1 基因功能的分类 | 第28-30页 |
4.2.2 基因表达谱 | 第30页 |
4.2.3 蛋白质组学 | 第30-31页 |
4.3 基因功能的研究方法与技术 | 第31-35页 |
4.3.1 在转录水平上的研究方法 | 第31-33页 |
4.3.2 在蛋白质水平上的研究方法 | 第33-34页 |
4.3.3 应用反求遗传学的方法 | 第34-35页 |
5 差减文库构建的几种方法 | 第35-41页 |
5.1 差减文库的构建原理 | 第35-36页 |
5.2 几种差减杂交方法 | 第36-40页 |
5.2.1 羟基磷灰石柱层析法(HAP) | 第36页 |
5.2.2 生物素标记、链亲和蛋白结合排除法 | 第36页 |
5.2.3 限制性内切酶与PCR技术相结合的差减方法 | 第36-37页 |
5.2.4 差减抑制杂交法(SSH) | 第37-39页 |
5.2.5 磁珠介导的差减法(MAST) | 第39-40页 |
5.3 构建差减文库的载体系统 | 第40-41页 |
6 生物信息学 | 第41-45页 |
6.1 生物信息学数据库 | 第42-44页 |
6.1.1 核酸与蛋白质序列数据库 | 第42-43页 |
6.1.2 生物数据库的发展特点 | 第43页 |
6.1.3 数据库的网络服务 | 第43-44页 |
6.2 生物信息学软件 | 第44-45页 |
7 研究目的与实验设计 | 第45-47页 |
7.1 目的 | 第45-46页 |
7.2 实验流程 | 第46-47页 |
第二章 白粉病菌诱导的小麦普通cDNA文库构建与EST研究 | 第47-66页 |
1 研究材料与方法 | 第47-51页 |
1.1 材料与处理 | 第47-48页 |
1.2 总RNA的提取与检测 | 第48页 |
1.3 cDNA文库构建与转化菌筛选 | 第48-49页 |
1.4 质粒的提取与纯化 | 第49-50页 |
1.5 测序与分析 | 第50页 |
1.6 反向Northern blot分析 | 第50-51页 |
1.6.1 高密度PCR点阵膜的制备 | 第50页 |
1.6.2 反转录标记探针 | 第50-51页 |
1.6.3 差减探针标记 | 第51页 |
1.6.4 杂交及检测 | 第51页 |
2 结果与分析 | 第51-62页 |
2.1 总RNA检测结果 | 第51页 |
2.2 未扩增cDNA文库的滴度与转化效率 | 第51-52页 |
2.3 EST的产生 | 第52页 |
2.4 EST分析结果 | 第52-60页 |
2.4.1 BLASTn的分析结果 | 第52-56页 |
2.4.2 BLASTx的分析结果 | 第56-60页 |
2.5 反向Northern blot结果 | 第60-62页 |
3 讨论 | 第62-66页 |
3.1 文库构建 | 第63页 |
3.2 文库的转化 | 第63-64页 |
3.3 与抗病相关的代谢途径 | 第64-65页 |
3.4 EST技术用于植物抗病机制研究的评价 | 第65-66页 |
第三章 白粉病菌诱导小麦抑制差减文库的构建与文库质量分析 | 第66-76页 |
1 材料与方法 | 第67-70页 |
1.1 材料与处理 | 第67页 |
1.2 总RNA提取与mRNA分离与纯化 | 第67-69页 |
1.3.1 cDNA第一链的合成 | 第67-68页 |
1.3.2 cDNA第二链的合成 | 第68页 |
1.3.3 双链cDNA RsaⅠ酶切与连接接头 | 第68-69页 |
1.3.4 二次差减杂交反应 | 第69页 |
1.3.5 二次PCR扩增反应和差减效率分析 | 第69页 |
1.4 差减cDNA文库的构建 | 第69页 |
1.5 质粒提取 | 第69-70页 |
2 结果与讨论 | 第70-75页 |
2.1 文库构建样品的总RNA与mRNA浓度与质量检测结果 | 第70-72页 |
2.2 差减杂交后两次PCR产物的分析 | 第72-73页 |
2.3 差减文库的滴度 | 第73页 |
2.4 差减文库的插入片段大小 | 第73-75页 |
3 小结 | 第75-76页 |
第四章 基于抑制差减杂交文库的小麦抗白粉病相关基因表达谱研究 | 第76-110页 |
1 材料与方法 | 第77-79页 |
1.1 SSH文库构建 | 第78页 |
1.1.1 材料与处理 | 第78页 |
1.1.2 总RNA提取与mRNA分离与纯化 | 第78页 |
1.1.3 抑制差减杂交、差减cDNA文库的构建 | 第78页 |
1.2 质粒提取与测序 | 第78页 |
1.2.1 质粒提取 | 第78页 |
1.2.2 测序 | 第78页 |
1.3 序列分析 | 第78页 |
1.4 差示筛选差减cDNA文库 | 第78-79页 |
1.4.1 PCR产物点阵列杂交膜制备 | 第78-79页 |
1.4.2 制备差示筛选探针 | 第79页 |
1.4 杂交及结果检测分析 | 第79页 |
2 结果 | 第79-100页 |
2.1 EST获得与分析 | 第79-92页 |
2.2 差示筛选差减cDNA文库结果 | 第92-100页 |
3 讨论 | 第100-110页 |
3.1 白粉病菌接种初期抗病反应相关过程 | 第100-105页 |
3.1.1 抗病信号传导途径 | 第101-103页 |
3.1.2 防卫反应基因 | 第103-104页 |
3.1.3 细胞保护机制与其它 | 第104-105页 |
3.2 SSH文库在抗病基因表达谱研究中的优越性 | 第105-107页 |
3.3 基于SSH文库的EST测序量 | 第107-108页 |
3.4 差示筛选时的探针标记方法 | 第108-109页 |
3.5 功能已知基因的确定 | 第109-110页 |
第五章 生物信息学在EST研究中的应用 | 第110-129页 |
1 建立数据库与开发相关软件 | 第111-115页 |
1.1 建立数据库 | 第111页 |
1.2 相关软件开发 | 第111-115页 |
1.2.1 多序列相同性比较软件—SEQEDIT | 第111-113页 |
1.2.2 序列同源比较的批提交软件—blasetW2 | 第113-115页 |
1.2.3 序列格式转换软件—SEQTOOL | 第115页 |
2 未知功能EST的同源比较分析 | 第115页 |
3 目的EST片段的拼接与电子延伸 | 第115-126页 |
3.1 过氧化氢酶(catalase)基因的拼接 | 第116-123页 |
3.2 未知功能EST的电子拼接与延长 | 第123-126页 |
4 R基因同源分析 | 第126-128页 |
5 小结 | 第128-129页 |
第六章 总结 | 第129-135页 |
1 抗病相关基因表达谱构建的技术体系 | 第129-131页 |
1.1 抗病相关cDNA文库构建方法 | 第129页 |
1.2 EST技术 | 第129-130页 |
1.3 高密度点阵杂交检测技术 | 第130页 |
1.4 其它 | 第130-131页 |
2 抗病基因表达谱研究合理的技术路线 | 第131页 |
3 建立抗病相关基因表达谱与抗病机制初探 | 第131-133页 |
3.1 抗病相关基因表达谱 | 第131-132页 |
3.2 白粉病抗病机制初探 | 第132-133页 |
3.2.1 信号传导途径 | 第132页 |
3.2.2 SAR表达基因 | 第132-133页 |
3.2.3 细胞保护机制 | 第133页 |
3.2.4 其它 | 第133页 |
3.3 抗病EST研究对育种工作的启示 | 第133页 |
4 生物信息学分析方法在EST分析中的应用 | 第133-134页 |
4.1 建立数据库与开发软件 | 第133-134页 |
4.2 寻找抗病相关新基因 | 第134页 |
4.3 基于计算机的序列拼接与延伸 | 第134页 |
5 完成ITEC协议任务 | 第134-135页 |
参考文献 | 第135-151页 |
英文摘要 | 第151页 |