基于UMLS和通路数据的潜在语义分析技术的研究与实现
| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-24页 |
| 1.1 课题研究的背景与意义 | 第9-11页 |
| 1.2 课题的研究现状及发展趋势 | 第11-20页 |
| 1.2.1 UMLS知识源数据库的组成 | 第12-17页 |
| 1.2.2 UMLS的核心算法Metamap | 第17-19页 |
| 1.2.3 生物的通路数据 | 第19-20页 |
| 1.3 潜在语义分析技术及应用 | 第20-22页 |
| 1.4 本文研究的内容 | 第22-24页 |
| 第2章 数据的获取及预处理 | 第24-30页 |
| 2.1Ⅰ型糖尿病基因数据获取 | 第24-25页 |
| 2.2 基于UMLS的基因数据扩展 | 第25-26页 |
| 2.3 文章摘要数据的获取 | 第26-27页 |
| 2.4 基于Metamap的文章摘要分解技术 | 第27-29页 |
| 2.5 本章小结 | 第29-30页 |
| 第3章Ⅰ型糖尿病候选基因定量交叉影响分析 | 第30-47页 |
| 3.1 交叉影响分析的背景介绍 | 第30-31页 |
| 3.2 定量交叉影响分析算法设计 | 第31-42页 |
| 3.2.1 潜在语义分析的主要内容 | 第31-35页 |
| 3.2.2 奇异值分解 | 第35-37页 |
| 3.2.3 奇异值分解中的减秩 | 第37-40页 |
| 3.2.4 交叉影响概率计算 | 第40-42页 |
| 3.3 实验过程及结果 | 第42-46页 |
| 3.4 本章小结 | 第46-47页 |
| 第4章 面向基因、基因组的潜在语义分析 | 第47-65页 |
| 4.1 加入通路数据 | 第47-49页 |
| 4.2 Sprinkling技术 | 第49-52页 |
| 4.3 相似性分数 | 第52-54页 |
| 4.4 面向基因的潜在语义分析实验 | 第54-60页 |
| 4.4.1 扩展矩阵中通路数据的计算方法 | 第54页 |
| 4.4.2 扩展矩阵中p值的选取 | 第54-57页 |
| 4.4.3 加入通路数据对基因排名的影响 | 第57-59页 |
| 4.4.4 加入通路数据对相似性分数的影响 | 第59-60页 |
| 4.5 面向基因组的潜在语义分析实验 | 第60-63页 |
| 4.5.1 整合基因组矩阵 | 第60-61页 |
| 4.5.2 扩展矩阵中p值的取值 | 第61-63页 |
| 4.6 本章小结 | 第63-65页 |
| 结论 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第71页 |
