| 摘要 | 第9-12页 |
| ABSTRACT | 第12-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-28页 |
| 1.1 转座子的概述 | 第16-17页 |
| 1.2 LINE反转录转座子的结构 | 第17-18页 |
| 1.3 LINE反转录转座子的分类 | 第18-19页 |
| 1.4 LINE反转录转座子的转座机制 | 第19-20页 |
| 1.5 LINE反转录转座子的特征 | 第20-22页 |
| 1.5.1 广泛存在于植物基因组中 | 第20-21页 |
| 1.5.2 高异质性 | 第21-22页 |
| 1.6 LINE反转录转座子的功能 | 第22-26页 |
| 1.6.1 转座导致基因组扩增 | 第22-23页 |
| 1.6.2 引起基因组的不稳定 | 第23页 |
| 1.6.3 影响基因的表达 | 第23-26页 |
| 1.7 桑树LINE反转录转座子研究进展 | 第26-28页 |
| 第二章 引言 | 第28-30页 |
| 2.1 研究背景及意义 | 第28页 |
| 2.2 主要研究内容 | 第28-29页 |
| 2.3 技术路线 | 第29-30页 |
| 第三章 桑树基因组中LINE反转录转座子逆转座酶片段的克隆及特征分析 | 第30-46页 |
| 3.1 材料 | 第30-32页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第30页 |
| 3.1.2 引物 | 第30-31页 |
| 3.1.3 试剂及主要溶液配置方法 | 第31-32页 |
| 3.1.4 主要仪器 | 第32页 |
| 3.2 实验方法 | 第32-35页 |
| 3.2.1 桑树叶片总DNA的提取及检测 | 第32-33页 |
| 3.2.2 目的片段的克隆及序列验证 | 第33-35页 |
| 3.2.3 序列分析 | 第35页 |
| 3.3 结果与分析 | 第35-44页 |
| 3.3.1 桑树LINE反转录转座子RT序列的克隆 | 第35-36页 |
| 3.3.2 桑树LINE反转录转座子RT序列的特征分析 | 第36-42页 |
| 3.3.3 桑树LINE反转录转座子RT序列的进化分析 | 第42-44页 |
| 3.4 小结与讨论 | 第44-46页 |
| 3.4.1 桑树LINE反转录转座子RT序列的克隆 | 第44页 |
| 3.4.2 桑树LINE反转录转座子RT序列的异质性 | 第44-45页 |
| 3.4.3 LINE反转录转座子在桑树基因组中的进化 | 第45-46页 |
| 第四章 桑树LINE反转录转座子在染色体的分布 | 第46-52页 |
| 4.1 材料 | 第46-47页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第46页 |
| 4.1.2 试剂及主要溶液配置方法 | 第46-47页 |
| 4.2 实验方法 | 第47-49页 |
| 4.2.1 去壁低渗法制备染色体玻片 | 第47页 |
| 4.2.2 探针的制备 | 第47-48页 |
| 4.2.3 荧光原位杂交 | 第48-49页 |
| 4.3 结果与分析 | 第49-51页 |
| 4.3.1 探针的制备 | 第50页 |
| 4.3.2 桑树LINE RT序列在染色体上的分布 | 第50-51页 |
| 4.4 小结与讨论 | 第51-52页 |
| 第五章 桑树基因组LINE反转录转座子的特征分析 | 第52-64页 |
| 5.1 材料 | 第52页 |
| 5.1.1 数据来源 | 第52页 |
| 5.2 方法 | 第52-53页 |
| 5.2.1 氨基酸序列分析 | 第52-53页 |
| 5.2.2 桑树LINE反转录转座子插入基因偏好性分析 | 第53页 |
| 5.2.3 LINE相关基因的分析 | 第53页 |
| 5.3 结果与分析 | 第53-61页 |
| 5.3.1 桑树LI和RTE序列的结构特征 | 第53-54页 |
| 5.3.2 桑树基因组中的LI和RTE氨基酸序列分析 | 第54-58页 |
| 5.3.3 桑树基因组中的LI和RTE插入基因区域偏好性分析 | 第58-60页 |
| 5.3.4 插入基因内部的LINE相关基因的功能注释及pathway分析 | 第60-61页 |
| 5.4 小结与讨论 | 第61-64页 |
| 5.4.1 桑树LINE的结构特征 | 第61-62页 |
| 5.4.2 桑树LINE的序列分析 | 第62页 |
| 5.4.3 桑树LINE与基因的关系 | 第62-64页 |
| 第六章 桑树基因组LINE相关基因分析 | 第64-76页 |
| 6.1 材料 | 第64页 |
| 6.1.1 实验材料 | 第64页 |
| 6.1.2 数据来源 | 第64页 |
| 6.1.3 试剂及主要溶液配置方法 | 第64页 |
| 6.1.4 主要仪器 | 第64页 |
| 6.2 实验方法 | 第64-67页 |
| 6.2.1 桑树有LINE插入的选择性剪切基因的筛选 | 第64-65页 |
| 6.2.2 预测的由LINE插入形成的选择性剪切基因的基本信息 | 第65页 |
| 6.2.3 预测的由LINE插入形成的选择性剪切基因的验证 | 第65-67页 |
| 6.3 结果与分析 | 第67-74页 |
| 6.3.1 桑树LINE插入形成的选择性剪切相关基因的筛选 | 第67-68页 |
| 6.3.2 桑树LINE选择性剪接相关基因的基本信息 | 第68-70页 |
| 6.3.3 桑树LINE选择性剪切相关基因的验证 | 第70-74页 |
| 6.4 小结与讨论 | 第74-76页 |
| 第七章 综合与讨论 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-86页 |
| 附录 | 第86-94页 |
| 在读期间发表论文及参加课题 | 第94-96页 |
| 致谢 | 第96页 |
