| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第1章 绪论 | 第11-20页 |
| 1.1 增强子 | 第12-15页 |
| 1.1.1 增强子结构与功能 | 第12-14页 |
| 1.1.2 表观遗传学特征与增强子 | 第14-15页 |
| 1.2 增强子RNA | 第15-18页 |
| 1.2.1 增强子RNA的定义 | 第15-16页 |
| 1.2.2 增强子RNA的特征及其他转录单元 | 第16页 |
| 1.2.3 增强子RNA的功能 | 第16-18页 |
| 1.3 增强子转录与疾病 | 第18-19页 |
| 1.3.1 增强子RNA、R-loop和基因组稳定性 | 第18-19页 |
| 1.3.2 增强子突变 | 第19页 |
| 1.4 本课题创新点 | 第19-20页 |
| 第2章 10个组织中增强子的识别及组织特异性分析 | 第20-39页 |
| 2.1 材料与方法 | 第20-23页 |
| 2.1.1 人10个组织组蛋白修饰数据及其他数据来源 | 第20-21页 |
| 2.1.2 各个组织增强子的识别 | 第21页 |
| 2.1.3 Enh_(TS)、Enh_(UE)、Enh_(Oth)的识别 | 第21页 |
| 2.1.4 Enh_(2D-eRNA)、Enh_(1D-eRNA)、Enh_(no-eRNA)的识别 | 第21-22页 |
| 2.1.5 增强子RNA表达量分析与注释 | 第22页 |
| 2.1.6 增强子保守性与motif分析 | 第22页 |
| 2.1.7 增强子GC含量分析 | 第22页 |
| 2.1.8 组织特异性转录因子识别 | 第22页 |
| 2.1.9 增强子上转录因子结合位点识别 | 第22-23页 |
| 2.1.10 增强子靶基因表达量及特异性 | 第23页 |
| 2.1.11 增强子突变位点的识别 | 第23页 |
| 2.2 结果与分析 | 第23-39页 |
| 2.2.1 人10个组织中增强子识别 | 第23-25页 |
| 2.2.2 增强子RNA的识别及增强子分类 | 第25-27页 |
| 2.2.3 10个组织中增强子保守性分析 | 第27-28页 |
| 2.2.4 10个组织中增强子GC含量分析 | 第28-30页 |
| 2.2.5 转录因子在10个组织中增强子上的富集分析 | 第30-32页 |
| 2.2.6 10个组织中增强子突变分析 | 第32-33页 |
| 2.2.7 10个组织中增强子靶基因预测及分析 | 第33-34页 |
| 2.2.8 10个组织中增强子及其靶基因功能分析 | 第34-35页 |
| 2.2.9 组织特异性增强子-转录因子-靶基因调控网络 | 第35-38页 |
| 2.2.10 人组织特异性增强子数据库构建 | 第38-39页 |
| 第3章 A549和NHLF中增强子识别及差异分析 | 第39-45页 |
| 3.1 材料与方法 | 第39-40页 |
| 3.1.1 A549和NHLF组蛋白修饰数据及其他数据来源 | 第39页 |
| 3.1.2 A549和NHLF中增强子的识别 | 第39-40页 |
| 3.1.3 A549和NHLF中Enh_(eRNA)、 Enh_(no-eRNA)的识别 | 第40页 |
| 3.1.4 A549和NHLF中增强子靶基因及差异表达分析 | 第40页 |
| 3.2 结果与分析 | 第40-45页 |
| 3.2.1 A549和NHLF中增强子识别 | 第40-41页 |
| 3.2.2 A549和NHLF中增强子RNA的识别及增强子分类 | 第41-42页 |
| 3.2.4 A549和NHLF中靶基因及功能分析 | 第42-45页 |
| 结论 | 第45-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-54页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第54页 |
