乙型流感病毒质子通道蛋白BM2的分子动力学模拟
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-21页 |
| ·流感病毒概述 | 第9-18页 |
| ·流感病毒结构 | 第10-13页 |
| ·流感病毒的生活史及药物作用靶点 | 第13-18页 |
| ·M2 的简介 | 第18-20页 |
| ·两种M2 的结构与功能 | 第18-19页 |
| ·M2 的离子通道机理 | 第19-20页 |
| ·本章小结 | 第20-21页 |
| 第二章 分子动力学模拟概述 | 第21-33页 |
| ·分子动力学模拟 | 第21-22页 |
| ·计算原理 | 第22-23页 |
| ·力场简述与常见力场的比较 | 第23-28页 |
| ·力场的作用项 | 第24-25页 |
| ·常见力场比较 | 第25-28页 |
| ·分子动力学模拟的周期性边界条件问题 | 第28-29页 |
| ·分子动力学模拟的溶剂化模型 | 第29-30页 |
| ·显式的溶剂化模型 | 第29页 |
| ·连续溶剂模型 | 第29-30页 |
| ·分子动力学模拟系综 | 第30-31页 |
| ·常用系综分类 | 第30-31页 |
| ·系综调节 | 第31页 |
| ·分子动力学模拟软件 | 第31-32页 |
| ·本章小结 | 第32-33页 |
| 第三章 实验方法 | 第33-41页 |
| ·模拟材料来源 | 第33-34页 |
| ·乙型流感病毒 | 第33页 |
| ·细胞膜 | 第33-34页 |
| ·膜蛋白的分子动力学模拟 | 第34-36页 |
| ·定位膜蛋白 | 第34页 |
| ·准备脂双层 | 第34-35页 |
| ·将体系浸入溶剂中 | 第35-36页 |
| ·体系平衡 | 第36页 |
| ·力场的选择 | 第36-37页 |
| ·模拟细节 | 第37页 |
| ·数据分析方法 | 第37-40页 |
| ·本章小结 | 第40-41页 |
| 第四章 结果分析与讨论 | 第41-51页 |
| ·分子动力学模拟结果 | 第41-50页 |
| ·本章小结 | 第50-51页 |
| 第五章 全文总结 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 致谢 | 第58-60页 |
| 攻读硕士学位期间参与的科研项目 | 第60-63页 |
| 附件 | 第63页 |
