| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-19页 |
| 1.1 植物内生菌 | 第11页 |
| 1.2 植物内生菌来源 | 第11-13页 |
| 1.3 植物内生菌的研究进展 | 第13页 |
| 1.4 石斛与石斛碱 | 第13-14页 |
| 1.5 石斛属内生菌 | 第14-15页 |
| 1.6 根际微生物与植物内生菌 | 第15-16页 |
| 1.7 高通量测序技术 | 第16页 |
| 1.8 研究目的及意义 | 第16-18页 |
| 1.9 研究技术路线 | 第18-19页 |
| 第二章 材料与方法 | 第19-27页 |
| 2.1 材料 | 第19-22页 |
| 2.1.1 样品采集 | 第19页 |
| 2.1.2 仪器 | 第19-20页 |
| 2.1.2.1 含 0.05%甲酸的甲醇溶液 | 第20页 |
| 2.1.2.2 内标溶液 | 第20页 |
| 2.1.2.3 对照品溶液 | 第20页 |
| 2.1.3 试剂 | 第20-21页 |
| 2.1.4 试剂盒 | 第21页 |
| 2.1.5 溶液及培养基的配制 | 第21-22页 |
| 2.1.5.1 植物总DNA提取 | 第21-22页 |
| 2.1.5.2 土壤总DNA提取所需溶液 | 第22页 |
| 2.2 方法 | 第22-27页 |
| 2.2.1 金钗石斛的组织培养 | 第22页 |
| 2.2.2 植物内生菌总DNA的提取 | 第22-24页 |
| 2.2.1.1 表面消毒 | 第22-23页 |
| 2.2.1.2 内生菌DNA提取 | 第23-24页 |
| 2.2.3 土壤总DNA的提取 | 第24页 |
| 2.2.3.1 试剂盒提取 | 第24页 |
| 2.2.3.2 预洗处理的聚乙烯吡咯烷酮（PVP）法 | 第24页 |
| 2.2.4 高通量测序 | 第24-25页 |
| 2.2.4.1 引物及PCR | 第24页 |
| 2.2.4.2 PCR产物检测和和纯化 | 第24页 |
| 2.2.4.3 文库构建和上机测序 | 第24-25页 |
| 2.2.4.4 数据分析 | 第25页 |
| 2.2.4.5 多样性分析 | 第25页 |
| 2.2.4.6 统计分析 | 第25页 |
| 2.2.5 气相色谱内标法测定石斛碱的含量 | 第25-26页 |
| 2.2.5.1 色谱条件 | 第25-26页 |
| 2.2.5.2 供试品溶液的制备 | 第26页 |
| 2.2.5.3 校正因子测定 | 第26页 |
| 2.2.5.4 石斛碱含量测定 | 第26页 |
| 2.2.6 相关性和主成分分析 | 第26-27页 |
| 第三章 结果与分析 | 第27-82页 |
| 3.1 金钗石斛内生细菌多样性 | 第27-31页 |
| 3.1.1 金钗石斛种子内生细菌多样性 | 第27-28页 |
| 3.1.1.1 OTU分析 | 第27页 |
| 3.1.1.2 物种分布情况 | 第27-28页 |
| 3.1.1.3 物种多样性分析 | 第28页 |
| 3.1.2 金钗石斛组培苗不同组织内生细菌多样性 | 第28-30页 |
| 3.1.2.1 OTU分析 | 第28-29页 |
| 3.1.2.2 物种分布情况 | 第29页 |
| 3.1.2.3 物种多样性分析 | 第29-30页 |
| 3.1.3 仿野生金钗石斛不同组织内生细菌多样性 | 第30-31页 |
| 3.1.3.1 OTU分析 | 第30页 |
| 3.1.3.2 物种分布情况 | 第30-31页 |
| 3.1.3.3 物种多样性分析 | 第31页 |
| 3.2 金钗石斛内生真菌多样性 | 第31-36页 |
| 3.2.1 金钗石斛种子内生真菌多样性 | 第31-33页 |
| 3.2.1.1 OTU分析 | 第31-32页 |
| 3.2.1.2 物种分布情况 | 第32页 |
| 3.2.1.3 物种多样性分析 | 第32-33页 |
| 3.2.2 金钗石斛组培苗不同组织内生真菌多样性 | 第33-34页 |
| 3.2.2.1 OTU分析 | 第33页 |
| 3.2.2.2 物种分布情况 | 第33-34页 |
| 3.2.2.3 物种多样性分析 | 第34页 |
| 3.2.3 仿野生金钗石斛不同组织内生真菌多样性 | 第34-36页 |
| 3.2.3.1 OTU分析 | 第34-35页 |
| 3.2.3.2 物种分布情况 | 第35-36页 |
| 3.2.3.3 物种多样性分析 | 第36页 |
| 3.3 金钗石斛根际土壤细菌多样性 | 第36-37页 |
| 3.3.1 OTU分析 | 第36页 |
| 3.3.2 物种分布情况 | 第36-37页 |
| 3.3.3 物种多样性分析 | 第37页 |
| 3.4 金钗石斛根际土壤真菌多样性 | 第37-39页 |
| 3.4.1 OTU分析 | 第37-38页 |
| 3.4.2 物种分布情况 | 第38页 |
| 3.4.3 物种多样性分析 | 第38-39页 |
| 3.5 不同月份仿野生金钗石斛中石斛碱含量测定 | 第39页 |
| 3.5.1 校正因子测定 | 第39页 |
| 3.5.2 仿野生金钗石斛中石斛碱含量 | 第39页 |
| 3.6 仿野生金钗石斛内生菌与石斛碱含量相关性分析 | 第39-82页 |
| 3.6.1 仿野生金钗石斛内生细菌与石斛碱的相关性分析 | 第39-61页 |
| 3.6.1.1 不同月份根部内生细菌与石斛碱的相关性分析 | 第39-47页 |
| 3.6.1.2 不同月份茎部内生细菌与石斛碱的相关性分析 | 第47-54页 |
| 3.6.1.3 不同月份叶部内生细菌与石斛碱的相关性分析 | 第54-61页 |
| 3.6.2 仿野生金钗石斛内生真菌与石斛碱的相关性分析 | 第61-82页 |
| 3.6.2.1 不同月份根部内生真菌与石斛碱的相关性分析 | 第61-68页 |
| 3.6.2.2 不同月份茎部内生真菌与石斛碱的相关性分析 | 第68-74页 |
| 3.6.2.3 不同月份叶部内生真菌与石斛碱的相关性分析 | 第74-82页 |
| 第四章 讨论 | 第82-105页 |
| 4.1 金钗石斛内生菌多样性 | 第82-84页 |
| 4.1.1 金钗石斛种子内生菌多样性 | 第82页 |
| 4.1.2 金钗石斛组培苗内生菌多样性 | 第82-83页 |
| 4.1.3 仿野生金钗石斛内生菌多样性 | 第83-84页 |
| 4.1.4 内生菌的组织器官特异性 | 第84页 |
| 4.2 金钗石斛种子及组培苗内生菌多样性比较 | 第84-91页 |
| 4.2.1 金钗石斛种子与组培苗内生细菌多样性比较 | 第84-87页 |
| 4.2.1.1 物种分布情况对比 | 第84-85页 |
| 4.2.1.2 内生细菌群落结构多样性 | 第85-87页 |
| 4.2.1.3 内生细菌Beta多样性指数比较 | 第87页 |
| 4.2.2 金钗石斛种子与组培苗内生真菌多样性比较 | 第87-90页 |
| 4.2.2.1 物种分布情况 | 第87-88页 |
| 4.2.2.2 内生真菌群落结构多样性 | 第88-90页 |
| 4.2.2.3 内生真菌Beta多样性指数比较 | 第90页 |
| 4.2.3 种子萌发分化为组培苗后内生菌的定植 | 第90-91页 |
| 4.3 仿野生金钗石斛与组培苗内生菌多样性比较 | 第91-96页 |
| 4.3.1 仿野生金钗石斛与组培苗内生细菌多样性比较 | 第91-93页 |
| 4.3.1.1 物种分布情况 | 第91-92页 |
| 4.3.1.2 内生细菌群落结构多样性 | 第92-93页 |
| 4.3.2 仿野生金钗石斛与组培苗内生真菌多样性比较 | 第93-95页 |
| 4.3.2.1 物种分布情况 | 第93-94页 |
| 4.3.2.2 内生真菌群落结构多样性 | 第94-95页 |
| 4.3.3 仿野生金钗石斛与组培苗内生菌多样性比较 | 第95-96页 |
| 4.4 仿野生金钗石斛、组培苗内生菌与根际土壤微生物多样性比较 | 第96-101页 |
| 4.4.1 仿野生金钗石斛、组培苗内生细菌及根际土壤细菌多样性比较 | 第96-98页 |
| 4.4.2 仿野生金钗石斛、组培苗内生真菌及根际土壤真菌的多样性 | 第98-99页 |
| 4.4.3 仿野生金钗石斛、组培苗内生菌及根际土壤微生物多样性比较 | 第99-101页 |
| 4.5 金钗石斛内生菌的来源 | 第101-104页 |
| 4.5.1 内生菌的垂直传播 | 第101页 |
| 4.5.2 内生菌的水平传播 | 第101-104页 |
| 4.6 金钗石斛内生菌与石斛碱相关性 | 第104-105页 |
| 4.6.1 石斛属植物中石斛碱含量的比较 | 第104页 |
| 4.6.2 金钗石斛内生菌与石斛碱含量的相关性 | 第104-105页 |
| 第五章 小结 | 第105-108页 |
| 5.1 金钗石斛种子内生菌多样性 | 第105页 |
| 5.2 金钗石斛组培苗不同组织内生菌多样性 | 第105-106页 |
| 5.3 仿野生金钗石斛不同组织内生菌多样性 | 第106页 |
| 5.4 仿野生金钗石斛根际土壤微生物多样性 | 第106-107页 |
| 5.5 不同月份金钗石斛石斛碱的含量 | 第107页 |
| 5.6 金钗石斛内生菌与石斛碱含量的相关性 | 第107-108页 |
| 参考文献 | 第108-119页 |
| 致谢 | 第119-120页 |
| 攻读硕士研究生期间发表的学术论文 | 第120页 |
