| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 引言 | 第14-16页 |
| 1 植物异源多倍体基因表达变化研究进展 | 第16-24页 |
| 1.1 多倍体植物基因表达变化特点 | 第16-19页 |
| 1.1.1 多倍体植物基因表达沉默 | 第16-17页 |
| 1.1.2 多倍体植物基因表达激活 | 第17页 |
| 1.1.3 多倍体植物非加性基因表达 | 第17-18页 |
| 1.1.4 多倍体植物中的偏向表达 | 第18-19页 |
| 1.2 多倍体植物基因表达变化的分子机制 | 第19-20页 |
| 1.3 植物异源多倍体及其优势 | 第20-21页 |
| 1.3.1 植物异源多倍体与杂种优势 | 第20-21页 |
| 1.3.2 植物异源多倍体与抗性优势 | 第21页 |
| 1.4 林木多倍体基因表达变化研究 | 第21页 |
| 1.5 问题与展望 | 第21-24页 |
| 2 青杨三倍体群体与亲本之间的基因表达变化 | 第24-40页 |
| 2.1 材料与方法 | 第24-30页 |
| 2.1.1 实验材料及其来源 | 第24-26页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第26-28页 |
| 2.1.3 实验材料准备 | 第28页 |
| 2.1.4 RNA提取、eDNA文库构建和转录组测序 | 第28页 |
| 2.1.5 RNA-Seq数据分析:mapping和差异表达分析 | 第28页 |
| 2.1.6 GO功能分析注释 | 第28-29页 |
| 2.1.7 Pathway显著性富集分析 | 第29页 |
| 2.1.8 中亲值的设定 | 第29-30页 |
| 2.2 结果与分析 | 第30-40页 |
| 2.2.1 RNA-Seq数据的mapping结果 | 第30-31页 |
| 2.2.2 异源三倍体及二倍体子代与亲本的基因表达差异 | 第31-34页 |
| 2.2.3 三倍体和二倍体群体的亲本表达显性 | 第34-39页 |
| 2.2.4 三倍体和二倍体群体的超亲基因表达模式 | 第39-40页 |
| 3 杂合性不同的青杨三倍体群体间的基因表达差异 | 第40-52页 |
| 3.1 材料与方法 | 第40-41页 |
| 3.1.1 实验材料及来源 | 第40页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第40-41页 |
| 3.2 结果与分析 | 第41-50页 |
| 3.2.1 青杨三倍体群体间的差异表达基因筛选 | 第41-42页 |
| 3.2.2 Triploid-F与triploid-S之间差异基因的GO注释 | 第42-43页 |
| 3.2.3 Triploid-F 与 triploid-S 之间的差异基因 Pathway 分析 | 第43-44页 |
| 3.2.4 Triploid-F与triploid-P之间差异表达基因的GO注释 | 第44-46页 |
| 3.2.5 Triploid-F与triploid-P之间差异基因的Pathway注释 | 第46-47页 |
| 3.2.6 Triploid-F分别与triploid-S和triploid-P差异基因的交集 | 第47-48页 |
| 3.2.7 基因共表达网络(Co-expression network)分析高生长相关的基因 | 第48-50页 |
| 3.3 小结 | 第50-52页 |
| 4 青杨三倍体群体与二倍体群体基因表达差异研究 | 第52-60页 |
| 4.1 材料与方法 | 第52-53页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第52页 |
| 4.1.2 实验方法 | 第52-53页 |
| 4.2 结果与分析 | 第53-59页 |
| 4.2.1 青杨三倍体群体与二倍体群体差异表达基因统计 | 第53页 |
| 4.2.2 与二倍体相比,比较三个多倍体群体基因表达变异程度 | 第53-54页 |
| 4.2.3 Triploid-F与二倍体之间的差异基因注释 | 第54-56页 |
| 4.2.4 Triploid-S与二倍体之间的差异基因注释 | 第56-57页 |
| 4.2.5 Triploid-P与二倍体之间的差异基因注释 | 第57页 |
| 4.2.6 三倍体与二倍体群体存在共同差异的基因 | 第57-59页 |
| 4.3 小结 | 第59-60页 |
| 5 青杨三倍体高生长突出的植株与亲本之间的基因表达差异 | 第60-76页 |
| 5.1 材料与方法 | 第60-61页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第60-61页 |
| 5.1.2 实验方法 | 第61页 |
| 5.2结果与分析 | 第61-74页 |
| 5.2.1 RNA-Seq数据的mapping结果 | 第61-62页 |
| 5.2.2 青杨高生长突出的三倍体与亲本之间的基因表达差异 | 第62-63页 |
| 5.2.3 青杨高生长突出的植株与父本之间差异基因的交集及GO注释 | 第63-67页 |
| 5.2.4 青杨高生长突出的植株与母本之间差异基因的交集及GO注释 | 第67-68页 |
| 5.2.5 青杨三倍体高生长突出的植株与亲本之间转录因子相关基因 | 第68页 |
| 5.2.6 青杨高生长植株与亲本之间的非加性基因表达及GO注释 | 第68-70页 |
| 5.2.7 青杨高生长突出的三倍体植株超亲表达分析 | 第70-74页 |
| 5.3 小结 | 第74-76页 |
| 6三倍体群体中高生长突出和较差的植株间基因表达差异 | 第76-84页 |
| 6.1 材料和方法 | 第76-77页 |
| 6.1.1 实验材料 | 第76-77页 |
| 6.1.2 实验方法 | 第77页 |
| 6.2 结果与分析 | 第77-83页 |
| 6.2.1 高生长突出和高生长较差植株间的基因表达差异 | 第77-78页 |
| 6.2.2 三倍体中高生长突出和较差植株间共有差异表达基因 | 第78-81页 |
| 6.2.3 二倍体高生长突出和较差与三倍体高生长突出和较差植株间差异基因的交集 | 第81-83页 |
| 6.3 小结 | 第83-84页 |
| 7 讨论 | 第84-90页 |
| 7.1 亲本偏向表达和非加性表达与多倍体杂种优势相关 | 第84-85页 |
| 7.2 不同杂合性三倍体群体的基因表达规律 | 第85-86页 |
| 7.3 杂合性不同的青杨三倍体群体与二倍体群体基因表达差异 | 第86-87页 |
| 7.4 表观调控在多倍体杂种优势中起重要作用 | 第87-88页 |
| 7.5 转录因子基因在多倍体高生突出植株形成中的重要作用 | 第88-90页 |
| 8 结论与展望 | 第90-96页 |
| 8.1 结论 | 第90-92页 |
| 8.2 展望 | 第92-96页 |
| 参考文献 | 第96-104页 |
| 作者简介 | 第104-106页 |
| 导师简介 | 第106-108页 |
| 获得成果目录 | 第108-110页 |
| 致谢 | 第110页 |
