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RNA二级结构调控Dscam和serpent互斥可变剪接的机制研究

致谢第6-7页
摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
第一章 引言第14-32页
    1.1 前体mRNA的可变剪接第14-18页
        1.1.1 可变剪接的方式第15-16页
        1.1.2 可变剪接的系统进化第16-18页
    1.2 可变剪接的意义第18-22页
        1.2.1 可变剪接改变蛋白质的功能第18-19页
        1.2.2 可变剪接与疾病第19-22页
    1.3 可变剪接的调控第22-29页
        1.3.1 顺式作用调控第23-26页
        1.3.2 反式作用调控第26-29页
    1.4 互斥可变剪接的调控机制第29-32页
        1.4.1 空间位阻模型第30页
        1.4.2 剪接小体不相容模型第30页
        1.4.3 NMD偶联降解模型第30-31页
        1.4.4 RNA二级结构的竞争性调控模型第31-32页
第二章 材料与方法第32-42页
    2.1 实验材料与试剂第32-33页
        2.1.1 实验材料第32页
        2.1.2 常用试剂配制方法第32-33页
    2.2 实验方法第33-42页
        2.2.1 基因组提取第33-34页
        2.2.2 引物设计第34页
        2.2.3 目的片段的获取第34页
        2.2.4 平末端PCR产物加A第34-35页
        2.2.5 目的片段的回收与纯化第35页
        2.2.6 PCR产物连接PMD19-T载体第35页
        2.2.7 感受态细胞的制备第35-36页
        2.2.8 连接产物转化大肠杆菌第36页
        2.2.9 单菌落的扩大培养第36页
        2.2.10 质粒DNA提取第36页
        2.2.11 阳性质粒酶切鉴定与测序第36-37页
        2.2.12 表达载体的构建及鉴定第37页
        2.2.13 去内毒素质粒制备及浓度测定第37-38页
        2.2.14 昆虫细胞培养第38-39页
        2.2.15 表达载体转染昆虫细胞第39页
        2.2.16 昆虫细胞总RNA的提取第39-40页
        2.2.17 cDNA模板的制备第40-41页
        2.2.18 序列比对及RNA二级结构预测第41页
        2.2.19 迷你基因转染结果的检测与分析第41-42页
第三章 Dscam外显子17互斥可变剪接的调控机制研究第42-71页
    3.1 研究背景和立项依据第42-46页
        3.1.1 DSCAM的生物学功能第43页
        3.1.2 Dscam互斥可变剪接调控机制的研究进展第43-46页
    3.2 实验结果与分析第46-67页
        3.2.1 调控Dscam可变外显子17.1和17.2互斥的机制研究第46-50页
        3.2.2 调控非果蝇物种Dscam可变外显子17.1和17.2选择的机制研究第50-61页
        3.2.3 调控果蝇Dscam外显子17互斥可变剪接的机制研究第61-67页
    3.3 讨论第67-71页
        3.3.1 调控Dscam外显子17互斥可变剪接的机制模型第67-69页
        3.3.2 逐步复杂的可变剪接调控机制第69-71页
第四章 双向RNA二级结构调控serpent互斥可变剪接的机制研究第71-103页
    4.1 研究背景和立项依据第71-72页
    4.2 实验结果与分析第72-98页
        4.2.1 serpent外显子4中双向RNA二级结构的发现第72-77页
        4.2.2 上游RNA二级结构调控可变外显子4.2的选择第77-78页
        4.2.3 下游RNA二级结构调控可变外显子4.1的选择第78-81页
        4.2.4 双向RNA二级结构提高互斥可变剪接的保真性第81-84页
        4.2.5 双向RNA二级结构对可变外显子选择的精细调控第84-85页
        4.2.6 可变外显子4的选择依赖于双向RNA二级结构的竞争第85-89页
        4.2.7 剪接位点信号强度对外显子4可变剪接的影响第89-91页
        4.2.8 上、下游的RNA二级结构呈现不同的靠近激活模式第91-93页
        4.2.9 双向RNA二级结构调控互斥可变剪接的拓展进化机制第93-95页
        4.2.10 双向RNA二级结构在Dscam互斥可变剪接中的作用第95-98页
    4.3 讨论第98-103页
第五章 结论及展望第103-106页
    5.1 结论第103-104页
    5.2 创新点第104页
    5.3 建议与展望第104-106页
参考文献第106-120页
附录第120-127页
作者简历第127页

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