致谢 | 第6-7页 |
摘要 | 第7-9页 |
ABSTRACT | 第9-10页 |
第一章 引言 | 第14-32页 |
1.1 前体mRNA的可变剪接 | 第14-18页 |
1.1.1 可变剪接的方式 | 第15-16页 |
1.1.2 可变剪接的系统进化 | 第16-18页 |
1.2 可变剪接的意义 | 第18-22页 |
1.2.1 可变剪接改变蛋白质的功能 | 第18-19页 |
1.2.2 可变剪接与疾病 | 第19-22页 |
1.3 可变剪接的调控 | 第22-29页 |
1.3.1 顺式作用调控 | 第23-26页 |
1.3.2 反式作用调控 | 第26-29页 |
1.4 互斥可变剪接的调控机制 | 第29-32页 |
1.4.1 空间位阻模型 | 第30页 |
1.4.2 剪接小体不相容模型 | 第30页 |
1.4.3 NMD偶联降解模型 | 第30-31页 |
1.4.4 RNA二级结构的竞争性调控模型 | 第31-32页 |
第二章 材料与方法 | 第32-42页 |
2.1 实验材料与试剂 | 第32-33页 |
2.1.1 实验材料 | 第32页 |
2.1.2 常用试剂配制方法 | 第32-33页 |
2.2 实验方法 | 第33-42页 |
2.2.1 基因组提取 | 第33-34页 |
2.2.2 引物设计 | 第34页 |
2.2.3 目的片段的获取 | 第34页 |
2.2.4 平末端PCR产物加A | 第34-35页 |
2.2.5 目的片段的回收与纯化 | 第35页 |
2.2.6 PCR产物连接PMD19-T载体 | 第35页 |
2.2.7 感受态细胞的制备 | 第35-36页 |
2.2.8 连接产物转化大肠杆菌 | 第36页 |
2.2.9 单菌落的扩大培养 | 第36页 |
2.2.10 质粒DNA提取 | 第36页 |
2.2.11 阳性质粒酶切鉴定与测序 | 第36-37页 |
2.2.12 表达载体的构建及鉴定 | 第37页 |
2.2.13 去内毒素质粒制备及浓度测定 | 第37-38页 |
2.2.14 昆虫细胞培养 | 第38-39页 |
2.2.15 表达载体转染昆虫细胞 | 第39页 |
2.2.16 昆虫细胞总RNA的提取 | 第39-40页 |
2.2.17 cDNA模板的制备 | 第40-41页 |
2.2.18 序列比对及RNA二级结构预测 | 第41页 |
2.2.19 迷你基因转染结果的检测与分析 | 第41-42页 |
第三章 Dscam外显子17互斥可变剪接的调控机制研究 | 第42-71页 |
3.1 研究背景和立项依据 | 第42-46页 |
3.1.1 DSCAM的生物学功能 | 第43页 |
3.1.2 Dscam互斥可变剪接调控机制的研究进展 | 第43-46页 |
3.2 实验结果与分析 | 第46-67页 |
3.2.1 调控Dscam可变外显子17.1和17.2互斥的机制研究 | 第46-50页 |
3.2.2 调控非果蝇物种Dscam可变外显子17.1和17.2选择的机制研究 | 第50-61页 |
3.2.3 调控果蝇Dscam外显子17互斥可变剪接的机制研究 | 第61-67页 |
3.3 讨论 | 第67-71页 |
3.3.1 调控Dscam外显子17互斥可变剪接的机制模型 | 第67-69页 |
3.3.2 逐步复杂的可变剪接调控机制 | 第69-71页 |
第四章 双向RNA二级结构调控serpent互斥可变剪接的机制研究 | 第71-103页 |
4.1 研究背景和立项依据 | 第71-72页 |
4.2 实验结果与分析 | 第72-98页 |
4.2.1 serpent外显子4中双向RNA二级结构的发现 | 第72-77页 |
4.2.2 上游RNA二级结构调控可变外显子4.2的选择 | 第77-78页 |
4.2.3 下游RNA二级结构调控可变外显子4.1的选择 | 第78-81页 |
4.2.4 双向RNA二级结构提高互斥可变剪接的保真性 | 第81-84页 |
4.2.5 双向RNA二级结构对可变外显子选择的精细调控 | 第84-85页 |
4.2.6 可变外显子4的选择依赖于双向RNA二级结构的竞争 | 第85-89页 |
4.2.7 剪接位点信号强度对外显子4可变剪接的影响 | 第89-91页 |
4.2.8 上、下游的RNA二级结构呈现不同的靠近激活模式 | 第91-93页 |
4.2.9 双向RNA二级结构调控互斥可变剪接的拓展进化机制 | 第93-95页 |
4.2.10 双向RNA二级结构在Dscam互斥可变剪接中的作用 | 第95-98页 |
4.3 讨论 | 第98-103页 |
第五章 结论及展望 | 第103-106页 |
5.1 结论 | 第103-104页 |
5.2 创新点 | 第104页 |
5.3 建议与展望 | 第104-106页 |
参考文献 | 第106-120页 |
附录 | 第120-127页 |
作者简历 | 第127页 |