| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 英文缩略词 | 第11-12页 |
| 文献综述 miRNA与初情期启动 | 第12-19页 |
| 1 影响初情期启动的基因 | 第12-14页 |
| 1.1 Kiss1/GPR54系统与初情期 | 第12-13页 |
| 1.2 Lin28B与初情期 | 第13页 |
| 1.3 Leptin系统与初情期 | 第13页 |
| 1.4 GABA系统与初情期 | 第13-14页 |
| 2 miRNA与初情期调控研究进展 | 第14-19页 |
| 2.1 miRNA的生物学特征 | 第14页 |
| 2.2 miRNA的发现和鉴定 | 第14-15页 |
| 2.3 miRNA的生物学合成 | 第15页 |
| 2.4 miRNA的作用机制 | 第15-16页 |
| 2.5 miRNA调控初情期基因的表达 | 第16-19页 |
| 2.5.1 miRNA与Lin28基因 | 第16-17页 |
| 2.5.2 miRNA与Kiss1基因 | 第17页 |
| 2.5.3 miRNA与初情期激素分泌调控 | 第17-19页 |
| 引言 | 第19-20页 |
| 1 材料与方法 | 第20-32页 |
| 1.1 试验动物 | 第20页 |
| 1.2 主要仪器、试剂与耗材 | 第20-21页 |
| 1.2.1 主要仪器 | 第20-21页 |
| 1.2.2 主要试剂耗材 | 第21页 |
| 1.3 试验方法和流程 | 第21-32页 |
| 1.3.1 溶液的配制 | 第21页 |
| 1.3.2 组织样品的采集与处理 | 第21-22页 |
| 1.3.3 山羊卵巢的HE染色 | 第22-24页 |
| 1.3.4 卵巢总RNA的提取 | 第24页 |
| 1.3.5 卵巢总RNA质量检测 | 第24-25页 |
| 1.3.6 文库构建和上机测序 | 第25-26页 |
| 1.3.7 Raw reads的数据评估与处理 | 第26页 |
| 1.3.8 sRNA的长度筛选 | 第26页 |
| 1.3.9 公共和特有序列的分析 | 第26-27页 |
| 1.3.10 参考序列的比对分析 | 第27页 |
| 1.3.11 已知miRNA的分析 | 第27页 |
| 1.3.12 ncRNA的分析 | 第27页 |
| 1.3.13 重复序列的比对 | 第27页 |
| 1.3.14 外显子、内含子的比对 | 第27页 |
| 1.3.15 新miRNA的预测 | 第27-28页 |
| 1.3.16 sRNA文库的注释 | 第28页 |
| 1.3.17 miRNA碱基编辑的分析 | 第28页 |
| 1.3.18 miRNA家族的分析 | 第28页 |
| 1.3.19 靶基因的预测 | 第28页 |
| 1.3.20 miRNA表达水平的分析 | 第28页 |
| 1.3.21 差异miRNA的筛选 | 第28-29页 |
| 1.3.22 差异miRNA的聚类分析 | 第29页 |
| 1.3.23 差异miRNA的维恩图 | 第29页 |
| 1.3.24 差异miRNA靶基因的GO富集分析 | 第29页 |
| 1.3.25 差异miRNA靶基因的KEGG富集分析 | 第29-30页 |
| 1.3.26 miRNA测序结果的qRT-PCR的定量验证 | 第30-31页 |
| 1.3.27 结果分析 | 第31-32页 |
| 2 结果与分析 | 第32-65页 |
| 2.1 初情期山羊卵巢的选取 | 第32页 |
| 2.2 卵巢的HE染色观察 | 第32-33页 |
| 2.3 总RNA的质量检测 | 第33-35页 |
| 2.4 测序文库质量的处理 | 第35-36页 |
| 2.5 sRNA序列长度的分析统计 | 第36页 |
| 2.6 公共及特有序列的分析 | 第36-39页 |
| 2.7 已知miRNA的分析 | 第39-45页 |
| 2.8 ncRNA的比对分析 | 第45页 |
| 2.9 重复序列的比对 | 第45-48页 |
| 2.10 外显子、内含子的比对 | 第48页 |
| 2.11 新miRNA的预测 | 第48-55页 |
| 2.12 sRNA分类注释 | 第55-56页 |
| 2.13 miRNA家族的分析 | 第56-58页 |
| 2.14 miRNA表达水平的分析 | 第58-59页 |
| 2.15 差异miRNA的筛选 | 第59-62页 |
| 2.16 差异miRNA的聚类分析 | 第62页 |
| 2.17 差异miRNA靶基因的富集分析 | 第62-64页 |
| 2.17.1 GO富集分析 | 第62页 |
| 2.17.2 KEGG富集分析 | 第62-64页 |
| 2.18 qRT-PCR验证结果 | 第64-65页 |
| 3 讨论 | 第65-70页 |
| 3.1 试验材料的选择 | 第65页 |
| 3.2 山羊miRNA转录分析 | 第65-66页 |
| 3.3 数据分析补充说明 | 第66页 |
| 3.4 miRNA表达谱及差异miRNA表达分析 | 第66-68页 |
| 3.5 miRNA靶基因预测及GO、KEGG富集分析 | 第68-69页 |
| 3.6 qRT-PCR定量结果验证 | 第69-70页 |
| 4 结论 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 作者简介 | 第78页 |
