升金湖越冬白头鹤（Grus monacha）肠道微生物菌群结构及其时间变化
| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 引言 | 第9-21页 |
| 1 肠道微生物研究概况 | 第9-14页 |
| 1.1 肠道微生物的组成特点 | 第9-11页 |
| 1.2 肠道菌落区系形成 | 第11页 |
| 1.3 肠道微生物对宿主生命活动的影响 | 第11-13页 |
| 1.4 鸟类肠道微生物的研究进展 | 第13-14页 |
| 2 肠道微生物研究方法 | 第14-18页 |
| 2.1 样品的采集 | 第14-15页 |
| 2.2 肠道菌群的检测 | 第15-18页 |
| 3 白头鹤研究现状 | 第18-19页 |
| 4 本研究目的意义和主要内容 | 第19-21页 |
| 4.1 研究目标和意义 | 第19-20页 |
| 4.2 研究内容 | 第20-21页 |
| 第二章 材料和方法 | 第21-29页 |
| 1 样品的采集与保存 | 第21-22页 |
| 2 实验方法 | 第22-29页 |
| 2.1 本研究采用的主要以及常用试剂 | 第22页 |
| 2.2 白头鹤的鉴定 | 第22-24页 |
| 2.3 粪便中细菌基因组DNA的提取 | 第24-25页 |
| 2.4 DNA提取样品PCR扩增检测 | 第25-26页 |
| 2.5 高通量测序 | 第26页 |
| 2.6 生物信息学分析 | 第26-29页 |
| 第三章 研究结果 | 第29-50页 |
| 1 基因组DNA模板PCR扩增检测 | 第29-30页 |
| 2 Illumina MiSeq测序序列数据统计 | 第30-31页 |
| 3 基于OTU水平对样品进行初步分析 | 第31-32页 |
| 4 白头鹤肠道微生物测序深度及多样性分析 | 第32-35页 |
| 5 越冬白头鹤肠道微生物组成 | 第35-42页 |
| 5.1 门级阶元的肠道微生物菌群组成分析 | 第35-36页 |
| 5.2 科级水平肠道微生物菌群组成分析 | 第36-37页 |
| 5.3 属级水平肠道微生物菌群组成分析 | 第37-39页 |
| 5.4 肠道核心微生物菌群组成分析 | 第39-42页 |
| 6 不同越冬时期肠道微生物菌群结构差异性 | 第42-50页 |
| 6.1 Alpha多样性分析 | 第42-44页 |
| 6.2 主坐标分析 | 第44页 |
| 6.3 微生物菌群组成分析 | 第44-50页 |
| 第四章 讨论 | 第50-55页 |
| 1 肠道微生物菌群结构特点 | 第50-53页 |
| 1.1 菌群多样性 | 第50页 |
| 1.2 菌群组成特点 | 第50-51页 |
| 1.3 肠道核心微生物菌群组成特点 | 第51-52页 |
| 1.4 肠道病原菌 | 第52-53页 |
| 2 越冬阶段肠道微生物菌群结构差异性 | 第53-55页 |
| 第五章 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-67页 |
| 致谢 | 第67-69页 |
| 攻读学位期间发表的论文 | 第69页 |
