中文摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-11页 |
1 前言 | 第11-23页 |
·植物抗旱相关基因 | 第11-17页 |
·干旱胁迫下相关功能基因 | 第11-14页 |
·渗透物质相关基因 | 第11-13页 |
·活性氧清除相关基因 | 第13-14页 |
·生物大分子保护及膜结构相关的基因 | 第14页 |
·干旱胁迫下相关调节基因 | 第14-17页 |
·植物对干旱胁迫的应答反应过程 | 第17-18页 |
·干旱胁迫信号的感知与传导 | 第17-18页 |
·旱胁迫信号应答基因的表达与调控 | 第18页 |
·转录组研究概况 | 第18-21页 |
·转录组研究的方法 | 第19-20页 |
·非模式生物转录组研究 | 第20-21页 |
·转录组水平的抗逆性研究 | 第21页 |
·白沙蒿概述 | 第21-22页 |
·研究的目的与意义 | 第22-23页 |
2 白沙蒿RNA的制备及其转录组测序 | 第23-28页 |
·试验材料 | 第23页 |
·试验方法 | 第23-24页 |
·白沙蒿干旱胁迫梯度处理以及取样方法 | 第23页 |
·RNA的提取及质量检测 | 第23-24页 |
·RNA文库的构建以及文库质控 | 第24页 |
·转录组测序 | 第24页 |
·测序结果的初步处理 | 第24页 |
·结果分析 | 第24-27页 |
·白沙蒿测序RNA质量检测结果分析 | 第24-26页 |
·测序数据输出结果分析 | 第26-27页 |
·讨论 | 第27-28页 |
3 白沙蒿转录组测序数据组装与功能注释 | 第28-41页 |
·试验材料 | 第28页 |
·试验方法 | 第28-29页 |
·转录组序列组装 | 第28页 |
·Unigene注释与功能分类 | 第28-29页 |
·结果与分析 | 第29-39页 |
·转录组数据de novo组装结果 | 第29-30页 |
·组装结果的比对注释 | 第30-31页 |
·Unigene功能注释结果 | 第31-39页 |
·GO注释结果 | 第32-33页 |
·COG注释结果 | 第33-34页 |
·KEGG通路注释结果 | 第34-39页 |
·讨论 | 第39-41页 |
4 差异表达基因分析和富集分析 | 第41-54页 |
·试验材料 | 第41页 |
·试验方法 | 第41-42页 |
·基因表达量注释 | 第41页 |
·差异表达基因的筛选 | 第41-42页 |
·结果与分析 | 第42-51页 |
·差异表达基因的筛选结果 | 第42-44页 |
·差异表达基因功能筛选和富集分析 | 第44-50页 |
·差异表达基因GO功能富集 | 第44-47页 |
·差异表达基因KEGG功能富集 | 第47-50页 |
·白沙蒿与干旱相关的功能基因 | 第50-51页 |
·白沙蒿与干旱相关的转录因子 | 第51页 |
·讨论 | 第51-54页 |
·白沙蒿在应对干旱胁迫下的转录组分析 | 第51-52页 |
·白沙蒿在干旱胁迫下与功能基因相关的分析 | 第52-53页 |
·白沙蒿在干旱胁迫下与转录因子相关的基因分析 | 第53-54页 |
5 基于转录组信息的白沙蒿SSR分子标记的鉴定与初步验证 | 第54-61页 |
·试验材料 | 第54页 |
·试验方法 | 第54-57页 |
·SSR位点的识别及引物的设计 | 第54页 |
·SSR片段的筛选 | 第54-55页 |
·SSR反应体系与扩增程序 | 第55页 |
·聚丙烯酰胺凝胶电泳及染色相关液体的配制 | 第55-57页 |
·产物的检测 | 第57页 |
·结果与分析 | 第57-59页 |
·SSR位点分布特征 | 第57-58页 |
·引物设计结果以及Unigene筛选结果 | 第58-59页 |
·SSR位点PCR扩增结果 | 第59页 |
·讨论 | 第59-61页 |
6 主要结论与展望 | 第61-63页 |
·主要结论 | 第61-62页 |
·展望 | 第62-63页 |
参考文献 | 第63-74页 |
致谢 | 第74-75页 |
作者简介 | 第75页 |