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白沙蒿对干旱响应的转录组研究

中文摘要第1-5页
ABSTRACT第5-11页
1 前言第11-23页
   ·植物抗旱相关基因第11-17页
     ·干旱胁迫下相关功能基因第11-14页
       ·渗透物质相关基因第11-13页
       ·活性氧清除相关基因第13-14页
       ·生物大分子保护及膜结构相关的基因第14页
     ·干旱胁迫下相关调节基因第14-17页
   ·植物对干旱胁迫的应答反应过程第17-18页
     ·干旱胁迫信号的感知与传导第17-18页
     ·旱胁迫信号应答基因的表达与调控第18页
   ·转录组研究概况第18-21页
     ·转录组研究的方法第19-20页
     ·非模式生物转录组研究第20-21页
     ·转录组水平的抗逆性研究第21页
   ·白沙蒿概述第21-22页
   ·研究的目的与意义第22-23页
2 白沙蒿RNA的制备及其转录组测序第23-28页
   ·试验材料第23页
   ·试验方法第23-24页
     ·白沙蒿干旱胁迫梯度处理以及取样方法第23页
     ·RNA的提取及质量检测第23-24页
     ·RNA文库的构建以及文库质控第24页
     ·转录组测序第24页
     ·测序结果的初步处理第24页
   ·结果分析第24-27页
     ·白沙蒿测序RNA质量检测结果分析第24-26页
     ·测序数据输出结果分析第26-27页
   ·讨论第27-28页
3 白沙蒿转录组测序数据组装与功能注释第28-41页
   ·试验材料第28页
   ·试验方法第28-29页
     ·转录组序列组装第28页
     ·Unigene注释与功能分类第28-29页
   ·结果与分析第29-39页
     ·转录组数据de novo组装结果第29-30页
     ·组装结果的比对注释第30-31页
     ·Unigene功能注释结果第31-39页
       ·GO注释结果第32-33页
       ·COG注释结果第33-34页
       ·KEGG通路注释结果第34-39页
   ·讨论第39-41页
4 差异表达基因分析和富集分析第41-54页
   ·试验材料第41页
   ·试验方法第41-42页
     ·基因表达量注释第41页
     ·差异表达基因的筛选第41-42页
   ·结果与分析第42-51页
     ·差异表达基因的筛选结果第42-44页
     ·差异表达基因功能筛选和富集分析第44-50页
       ·差异表达基因GO功能富集第44-47页
       ·差异表达基因KEGG功能富集第47-50页
     ·白沙蒿与干旱相关的功能基因第50-51页
     ·白沙蒿与干旱相关的转录因子第51页
   ·讨论第51-54页
     ·白沙蒿在应对干旱胁迫下的转录组分析第51-52页
     ·白沙蒿在干旱胁迫下与功能基因相关的分析第52-53页
     ·白沙蒿在干旱胁迫下与转录因子相关的基因分析第53-54页
5 基于转录组信息的白沙蒿SSR分子标记的鉴定与初步验证第54-61页
   ·试验材料第54页
   ·试验方法第54-57页
     ·SSR位点的识别及引物的设计第54页
     ·SSR片段的筛选第54-55页
     ·SSR反应体系与扩增程序第55页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳及染色相关液体的配制第55-57页
     ·产物的检测第57页
   ·结果与分析第57-59页
     ·SSR位点分布特征第57-58页
     ·引物设计结果以及Unigene筛选结果第58-59页
     ·SSR位点PCR扩增结果第59页
   ·讨论第59-61页
6 主要结论与展望第61-63页
   ·主要结论第61-62页
   ·展望第62-63页
参考文献第63-74页
致谢第74-75页
作者简介第75页

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