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太平洋鳕发育早期干扰素通路相关基因的克隆分析及表达规律的研究

摘要第1-5页
Abstract第5-14页
第一章 前言综述第14-22页
   ·太平洋鳕研究综述第14-15页
     ·太平洋鳕生物学简介第14页
     ·太平洋鳕增养殖前景及国内外研究现状第14-15页
   ·鱼类干扰素系统的研究进展第15-20页
     ·鱼类干扰素系统研究意义及研究进展第15-16页
     ·鱼类干扰素的信号通路第16-20页
       ·TLR3研究进展第17页
       ·MDA5研究进展第17-18页
       ·ATG5研究进展第18页
       ·IPS1研究进展第18-19页
       ·IRF3研究进展第19页
       ·IRF7研究进展第19-20页
   ·研究目的及意义第20-22页
第二章 太平洋鳕TLR3的克隆与表达分析第22-34页
   ·材料与方法第22-28页
     ·材料第22-23页
       ·实验动物第22页
       ·主要药品、试剂盒和菌株第22-23页
       ·主要仪器设备第23页
       ·主要溶液的配置第23页
     ·实验方法第23-28页
       ·太平洋鳕各组织总RNA的提取第23-24页
       ·反转录反应第24页
       ·太平洋鳕TLR3基因cDNA的扩增第24-25页
       ·PCR产物的回收与纯化第25页
       ·目的片段与pMD18-T载体的连接第25-26页
       ·热击法转化大肠杆菌DH5α 感受态细胞第26页
       ·PCR法鉴定阳性克隆第26页
       ·核酸序列测定第26页
       ·质粒提取第26-27页
       ·计算标准品质粒拷贝数第27页
       ·太平洋鳕TLR3基因绝对荧光定量第27页
       ·绝对荧光定量PCR检测TLR3基因在太平洋鳕不同组织中的表达差异第27页
       ·生物信息学分析第27-28页
   ·结果第28-33页
     ·总RNA的提取第28页
     ·太平洋鳕TLR3基因cDNA序列及氨基酸序列推导和分析第28-30页
     ·标准品质粒的制备及拷贝数计算第30页
     ·太平洋鳕TLR3基因绝对定量反应体系的建立第30-32页
     ·TLR3基因在太平洋鳕不同组织中的表达差异第32-33页
   ·讨论第33-34页
第三章 太平洋鳕MDA5的克隆与表达分析第34-42页
   ·材料与方法第34-36页
     ·材料第34页
       ·实验动物第34页
       ·主要药品、试剂盒和菌株第34页
       ·主要仪器设备第34页
       ·主要溶液的配置第34页
     ·实验方法第34-36页
       ·太平洋鳕各组织总RNA的提取第34页
       ·反转录反应第34页
       ·太平洋鳕MDA5基因cDNA的扩增第34-35页
       ·PCR产物的回收与纯化第35页
       ·目的片段与pMD18-T载体的连接第35页
       ·热击法转化大肠杆菌DH5α 感受态细胞第35页
       ·PCR法鉴定阳性克隆第35-36页
       ·核酸序列测定第36页
       ·质粒提取第36页
       ·计算标准品质粒拷贝数第36页
       ·太平洋鳕MDA5基因绝对荧光定量第36页
       ·绝对荧光定量PCR检测MDA5基因在太平洋鳕不同组织中的表达差异第36页
       ·生物信息学分析第36页
   ·结果第36-41页
     ·总RNA的提取第36页
     ·太平洋鳕MDA5基因cDNA序列及氨基酸序列推导和分析第36-38页
     ·标准品质粒的制备及拷贝数计算第38页
     ·太平洋鳕MDA5基因绝对定量反应体系的建立第38-40页
     ·MDA5基因在太平洋鳕不同组织中的表达差异第40-41页
   ·讨论第41-42页
第四章 太平洋鳕ATG5的克隆与表达分析第42-53页
   ·材料与方法第42-45页
     ·材料第42页
       ·实验动物第42页
       ·主要药品、试剂盒和菌株第42页
       ·主要仪器设备第42页
       ·主要溶液的配置第42页
     ·实验方法第42-45页
       ·太平洋鳕各组织总RNA的提取第42-43页
       ·反转录反应第43页
       ·太平洋鳕ATG5基因cDNA的扩增第43-44页
       ·PCR产物的回收与纯化第44页
       ·目的片段与pMD18-T载体的连接第44页
       ·热击法转化大肠杆菌DH5α 感受态细胞第44页
       ·PCR法鉴定阳性克隆第44页
       ·核酸序列测定第44页
       ·质粒提取第44页
       ·计算标准品质粒拷贝数第44页
       ·太平洋鳕ATG5基因绝对荧光定量第44页
       ·绝对荧光定量PCR检测ATG5基因在太平洋鳕不同组织中的表达差异第44页
       ·生物信息学分析第44-45页
   ·结果第45-51页
     ·总RNA的提取第45页
     ·太平洋鳕ATG5基因cDNA序列及氨基酸序列推导和分析第45-46页
     ·太平洋鳕ATG5基因氨基酸序列物种间比较第46-47页
     ·脊椎动物ATG5基因系统发育树的构建第47-48页
     ·标准品质粒的制备及拷贝数计算第48-49页
     ·太平洋鳕ATG5基因绝对定量反应体系的建立第49-50页
     ·ATG5基因在太平洋鳕不同组织中的表达差异第50-51页
   ·讨论第51-53页
第五章 太平洋鳕IPS1的克隆与表达分析第53-60页
   ·材料与方法第53-55页
     ·材料第53页
       ·实验动物第53页
       ·主要药品、试剂盒和菌株第53页
       ·主要仪器设备第53页
       ·主要溶液的配置第53页
     ·实验方法第53-55页
       ·太平洋鳕各组织总RNA的提取第53页
       ·反转录反应第53页
       ·太平洋鳕IPS1基因cDNA的扩增第53-54页
       ·PCR产物的回收与纯化第54页
       ·目的片段与pMD18-T载体的连接第54页
       ·热击法转化大肠杆菌DH5α 感受态细胞第54页
       ·PCR法鉴定阳性克隆第54页
       ·核酸序列测定第54页
       ·质粒提取第54-55页
       ·计算标准品质粒拷贝数第55页
       ·太平洋鳕MDA5基因绝对荧光定量第55页
       ·绝对荧光定量PCR检测IPS1基因在太平洋鳕不同组织中的表达差异第55页
       ·生物信息学分析第55页
   ·结果第55-59页
     ·总RNA的提取第55页
     ·太平洋鳕IPS1基因cDNA序列及氨基酸序列推导和分析第55-56页
     ·标准品质粒的制备及拷贝数计算第56页
     ·太平洋鳕IPS1基因绝对定量反应体系的建立第56-58页
     ·IPS1基因在太平洋鳕不同组织中的表达差异第58-59页
   ·讨论第59-60页
第六章 太平洋鳕IRF3的克隆与表达分析第60-70页
   ·材料与方法第60-62页
     ·材料第60页
       ·实验动物第60页
       ·主要药品、试剂盒和菌株第60页
       ·主要仪器设备第60页
       ·主要溶液的配置第60页
     ·实验方法第60-62页
       ·太平洋鳕各组织总RNA的提取第60页
       ·反转录反应第60-61页
       ·太平洋鳕IRF3基因cDNA的扩增第61页
       ·PCR产物的回收与纯化第61页
       ·目的片段与pMD18-T载体的连接第61页
       ·热击法转化大肠杆菌DH5α 感受态细胞第61页
       ·PCR法鉴定阳性克隆第61页
       ·核酸序列测定第61-62页
       ·质粒提取第62页
       ·计算标准品质粒拷贝数第62页
       ·太平洋鳕IRF3基因绝对荧光定量第62页
       ·绝对荧光定量PCR检测IRF3基因在太平洋鳕不同组织中的表达差异第62页
       ·生物信息学分析第62页
   ·结果第62-68页
     ·总RNA的提取第62页
     ·太平洋鳕IRF3基因cDNA序列及氨基酸序列推导和分析第62-63页
     ·太平洋鳕IRF3基因氨基酸序列物种间比较第63-64页
     ·脊椎动物IRF3基因系统发育树的构建第64-66页
     ·标准品质粒的制备及拷贝数计算第66页
     ·太平洋鳕IRF3基因绝对定量反应体系的建立第66-68页
     ·IRF3基因在太平洋鳕不同组织中的表达差异第68页
   ·讨论第68-70页
第七章 太平洋鳕IRF7的克隆与表达分析第70-82页
   ·材料与方法第70-72页
     ·材料第70页
       ·实验动物第70页
       ·主要药品、试剂盒和菌株第70页
       ·主要仪器设备第70页
       ·主要溶液的配置第70页
     ·实验方法第70-72页
       ·太平洋鳕各组织总RNA的提取第70页
       ·反转录反应第70-71页
       ·太平洋鳕IRF7基因cDNA的扩增第71页
       ·PCR产物的回收与纯化第71页
       ·目的片段与pMD18-T载体的连接第71页
       ·热击法转化大肠杆菌DH5α 感受态细胞第71页
       ·PCR法鉴定阳性克隆第71页
       ·核酸序列测定第71-72页
       ·质粒提取第72页
       ·计算标准品质粒拷贝数第72页
       ·太平洋鳕IRF7基因绝对荧光定量第72页
       ·绝对荧光定量PCR检测IRF7基因在太平洋鳕不同组织中的表达差异第72页
       ·生物信息学分析第72页
   ·结果第72-80页
     ·总RNA的提取第72页
     ·太平洋鳕IRF7基因cDNA序列及氨基酸序列推导和分析第72-73页
     ·太平洋鳕IRF7基因氨基酸序列物种间比较第73-75页
     ·脊椎动物IRF7基因系统发育树的构建第75-77页
     ·标准品质粒的制备及拷贝数计算第77-78页
     ·太平洋鳕IRF7基因绝对定量反应体系的建立第78-79页
     ·IRF7基因在太平洋鳕不同组织中的表达差异第79-80页
   ·讨论第80-82页
第八章 太平洋鳕仔鱼期干扰素各相关基因表达规律的研究第82-89页
   ·材料与方法第82-84页
     ·材料第82页
       ·实验动物第82页
       ·主要仪器设备第82页
       ·主要溶液的配置第82页
     ·实验方法第82-84页
       ·太平洋鳕各组织总RNA的提取第82-83页
       ·反转录反应第83页
       ·质粒提取第83页
       ·计算标准品质粒拷贝数第83页
       ·太平洋鳕干扰素系统基因绝对荧光定量第83页
       ·绝对荧光定量PCR检测干扰素系统相关基因在太平洋鳕仔鱼期不同日龄中的表达差异第83页
       ·生物信息学分析第83-84页
   ·结果第84-88页
     ·总RNA的提取第84页
     ·标准品质粒的制备及拷贝数计算第84页
     ·太平洋鳕干扰素系统相关基因绝对定量反应体系的建立第84页
     ·TR3基因在太平洋鳕仔鱼期不同日龄中的表达规律第84-85页
     ·MDA5基因在太平洋鳕仔鱼期不同日龄中的表达规律第85-86页
     ·IPS1基因在太平洋鳕仔鱼期不同日龄中的表达规律第86页
     ·IRF3基因在太平洋鳕仔鱼期不同日龄中的表达规律第86-87页
     ·IRF7基因在太平洋鳕仔鱼期不同日龄中的表达规律第87-88页
   ·讨论第88-89页
第九章 太平洋鳕干扰素相关基因在太平洋鳕仔鱼应答Poly(I:C)的表达规律第89-102页
   ·材料与方法第89-91页
     ·材料第89-90页
       ·实验动物第89页
       ·主要药品、试剂盒和菌株第89页
       ·主要仪器设备第89-90页
       ·主要溶液的配置第90页
     ·实验方法第90-91页
       ·太平洋鳕各组织总RNA的提取第90页
       ·反转录反应第90页
       ·相对荧光定量PCR检测干扰素系统相关基因在太平洋鳕2日龄和12日龄仔鱼的处理组和空白对照组中的表达差异第90-91页
       ·生物信息学分析第91页
   ·结果第91-99页
     ·总 RNA 的提取第91-92页
     ·太平洋鳕TLR3在PolyIC处理后的表达规律第92-93页
     ·太平洋鳕MDA5在PolyIC处理后的表达规律第93-95页
     ·太平洋鳕ATG5在PolyIC处理后的表达规律第95-96页
     ·太平洋鳕IPS1在PolyIC处理后的表达规律第96-97页
     ·太平洋鳕IRF3在PolyIC处理后的表达规律第97-98页
     ·太平洋鳕IRF7在PolyIC处理后的表达规律第98-99页
   ·讨论第99-102页
参考文献第102-113页
攻读学位期间发表的论文目录第113-116页
致谢第116页

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