摘要 | 第1-12页 |
Abstract | 第12-14页 |
1. 前言 | 第14-34页 |
·淀粉-蔗糖代谢关键酶研究进展 | 第14-21页 |
·蔗糖的作用及其代谢关键酶 | 第14-16页 |
·SuSy研究进展 | 第16-19页 |
·INV研究进展 | 第19-21页 |
·百合总RNA的提取方法及影响因素 | 第21-24页 |
·RNA提取方法概述 | 第22-23页 |
·百合RNA提取 | 第23-24页 |
·RNA-seq技术 | 第24-30页 |
·转录组测序技术概述 | 第24-26页 |
·植物转录组测序研究进展 | 第26-30页 |
·内参基因的筛选 | 第30-32页 |
·内参基因概述 | 第30-31页 |
·内参基因筛选研究动态 | 第31-32页 |
·研究思路与技术路线 | 第32-34页 |
·研究思路 | 第32-33页 |
·技术路线 | 第33-34页 |
2 百合鳞茎总RNA高效提取体系的建立 | 第34-45页 |
·材料与方法 | 第34-37页 |
·植物材料 | 第34页 |
·主要试剂 | 第34-35页 |
·外源RNase的去除 | 第35页 |
·试验方法 | 第35-37页 |
·结果与分析 | 第37-42页 |
·改良SDS法提取RNA的凝胶电泳分析 | 第37-41页 |
·TRIzol法提取RNA效果 | 第41页 |
·RT-PCR扩增效果 | 第41-42页 |
·CTAB法提取百合鳞茎不同部位RNA效果 | 第42页 |
·讨论 | 第42-45页 |
·防止RNase污染、RNA降解的措施 | 第42-43页 |
·提取方法的选择 | 第43-45页 |
3 基于Illumina平台的百合小鳞茎形成与发育转录组学研究 | 第45-55页 |
·材料与方法 | 第45-46页 |
·材料 | 第45页 |
·试剂 | 第45页 |
·RNA提取、cDNA文库构建、测序及组装 | 第45-46页 |
·基因功能注释 | 第46页 |
·SSR分析 | 第46页 |
·unigene预测编码蛋白区CDS | 第46页 |
·结果与分析 | 第46-53页 |
·小鳞茎形成与发育过程分析 | 第46-47页 |
·测序和组装结果 | 第47页 |
·基因注释和功能分类 | 第47-52页 |
·SSR分析结果 | 第52页 |
·编码区预测和蛋白序列翻译 | 第52-53页 |
·讨论 | 第53-55页 |
4 百合qRT-PCR内参基因的筛选 | 第55-67页 |
·材料与方法 | 第55-57页 |
·材料 | 第55页 |
·试剂 | 第55-56页 |
·RNA提取及cDNA合成 | 第56页 |
·候选内参基因引物设计 | 第56页 |
·内参基因的qRT-PCR分析 | 第56-57页 |
·表达稳定性分析 | 第57页 |
·结果与分析 | 第57-65页 |
·引物特异性分析 | 第57-58页 |
·引物的扩增效率分析 | 第58-59页 |
·内参基因的表达稳定性分析 | 第59-65页 |
·讨论 | 第65-67页 |
5 百合小鳞茎发育不同阶段表达谱构建及特征分析 | 第67-81页 |
·材料与方法 | 第67-69页 |
·材料 | 第67页 |
·试剂 | 第67页 |
·RNA提取、cDNA文库构建、测序及组装 | 第67-68页 |
·基因差异表达分析 | 第68页 |
·差异表达基因功能分析 | 第68页 |
·淀粉和蔗糖含量测定 | 第68页 |
·淀粉-蔗糖代谢关键酶基因的qRT-PCR分析 | 第68-69页 |
·结果与分析 | 第69-78页 |
·差异表达基因的分布 | 第69-70页 |
·不同样品间的差异表达基因比较 | 第70页 |
·差异表达基因的GO分析 | 第70-72页 |
·差异表达基因的通路分析 | 第72-73页 |
·淀粉-蔗糖代谢相关基因功能富集分析 | 第73-75页 |
·淀粉和蔗糖含量测定结果 | 第75页 |
·淀粉-蔗糖代谢相关酶的qRT-PCR检测 | 第75-78页 |
·讨论 | 第78-81页 |
·百合小鳞茎发育不同阶段表达谱 | 第78-79页 |
·淀粉-蔗糖代谢作用 | 第79页 |
·小鳞茎形成与发育过程中的基因表达 | 第79-81页 |
6 SuSy与INV基因的载体构建 | 第81-98页 |
·材料与方法 | 第81-92页 |
·主要试剂 | 第81页 |
·试验所用的菌株与载体 | 第81-82页 |
·SuSy3过表达载体的构建 | 第82-84页 |
·SuSy3 RNAi载体的构建 | 第84-86页 |
·S1、S2和SAI过表达载体的构建 | 第86-88页 |
·S1、S2及SAIRNAi载体的构建 | 第88-92页 |
·结果与分析 | 第92-97页 |
·SuSy3过表达载体的构建 | 第92-93页 |
·SuSy3 RNAi载体的构建 | 第93-94页 |
·S1、S2、SAI过表达载体的构建 | 第94-96页 |
·S1、S2及SAIRNAi载体的构建 | 第96-97页 |
·讨论 | 第97-98页 |
全文总结 | 第98-101页 |
主要创新点 | 第101-102页 |
参考文献 | 第102-128页 |
附录 | 第128-129页 |
致谢 | 第129-130页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第130-131页 |
附件 | 第131页 |