| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 缩略词清单 | 第11-12页 |
| 1 绪论 | 第12-22页 |
| ·引言 | 第12-13页 |
| ·国内外相关研究 | 第13-18页 |
| ·A phenome-genome network | 第13-14页 |
| ·Gene Expression Atlas | 第14-15页 |
| ·Human Disease Network | 第15-16页 |
| ·iCOD | 第16-18页 |
| ·LMMA方法 | 第18页 |
| ·研究目标和任务 | 第18-22页 |
| ·本论文解决的关键问题 | 第18-19页 |
| ·研究目标与任务 | 第19页 |
| ·论文内容安排 | 第19-22页 |
| 2 结直肠癌临床-组学知识获取方法及实现 | 第22-36页 |
| ·数据源及方法概述 | 第22-26页 |
| ·数据源介绍 | 第22-24页 |
| ·方法概述及数据预处理 | 第24-26页 |
| ·基于UMLS的结直肠癌临床概念提取 | 第26-28页 |
| ·基于统计学分析的结直肠癌临床-组学关系挖掘 | 第28-34页 |
| ·差异表达基因筛选方法概述 | 第29-31页 |
| ·结直肠癌临床-组学关系挖掘方法 | 第31-34页 |
| ·基于文献挖掘的结直肠癌基因提取 | 第34-35页 |
| ·小结 | 第35-36页 |
| 3 结直肠癌临床-组学知识获取结果分析与整合 | 第36-54页 |
| ·利用UMLS语义类型分析结直肠癌临床知识 | 第36-38页 |
| ·利用KEGG分析结直肠癌组学知识 | 第38-42页 |
| ·KEGG简介 | 第39页 |
| ·结直肠癌相关基因Pathway分析 | 第39-42页 |
| ·利用Gephi可视化分析结直肠癌临床-组学关系 | 第42-51页 |
| ·Gephi简介 | 第43-44页 |
| ·结直肠癌临床-组学关系可视化分析 | 第44-51页 |
| ·结直肠癌临床-组学知识库构建 | 第51-53页 |
| ·小结 | 第53-54页 |
| 4 结直肠癌临床-组学知识共享平台设计与实现 | 第54-61页 |
| ·结直肠癌临床-组学知识共享平台设计 | 第54-55页 |
| ·结直肠癌临床-组学知识共享平台实现 | 第55-60页 |
| ·首页 | 第55-56页 |
| ·结直肠癌临床知识库 | 第56-57页 |
| ·结直肠癌组学知识库 | 第57-58页 |
| ·结直肠癌临床-组学关系知识库 | 第58-60页 |
| ·小结 | 第60-61页 |
| 5 总结与展望 | 第61-63页 |
| ·总结 | 第61-62页 |
| ·展望 | 第62-63页 |
| 作者简介 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-68页 |