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小鼠精子形成期动态发育的转录组学研究

摘要第1-9页
Abstract第9-16页
第一章 文献综述第16-26页
   ·精子形成期基因转录表达的研究进展第16-22页
     ·精子形成过程中形态学及染色体结构的变化第16-17页
     ·精子 RNA 研究进展第17-19页
     ·成熟精子中 RNA 的可能功能第19-20页
     ·精子 RNA 的调控第20-22页
   ·激光捕获显微切割技术(LCM)分离小鼠睾丸各类精子细胞第22-24页
   ·高通量测序第24-25页
   ·展望第25页
   ·本研究的目的意义第25-26页
第二章 实验材料第26-29页
   ·小鼠精子细胞样品来源第26页
   ·主要试剂第26页
   ·仪器设备第26页
   ·主要计算机硬件第26-27页
   ·计算机软件及数据库网址第27页
   ·主要溶液配制第27-29页
第三章 实验方法第29-34页
   ·成熟精子的收集第29页
   ·采用 LCM 技术捕获圆形精子细胞和长形精子细胞第29-30页
     ·睾丸采集第29页
     ·睾丸切片制备和染色第29-30页
     ·激光显微切割技术分离圆形精子细胞和长形精子细胞第30页
   ·总 RNA 提取第30-31页
     ·成熟精子细胞总 RNA 提取第30页
     ·圆形精子细胞和长形精子细胞总 RNA 提取第30页
     ·精子总 RNA 的质量评估第30-31页
   ·样品总 RNA 线性扩增及质量检测第31页
   ·转录组测序文库构建第31页
   ·生物信息学分析流程第31-34页
     ·Reads 数据匹配第32页
     ·基因表达水平的标准化第32-33页
     ·样品间的基因差异表达分析第33页
     ·新转录本分析第33页
     ·可变剪接分析第33页
     ·GO 功能注释和富集分析第33页
     ·差异基因代谢通路富集分析第33-34页
第四章 实验结果第34-55页
   ·小鼠成熟精子收集第34页
   ·圆形精子细胞和长形精子细胞的捕获第34-36页
   ·圆形、长形和成熟精子细胞总 RNA 提取及鉴定第36-39页
     ·精子总 RNA 纯度检测及定量分析结果第36-37页
     ·精子总 RNA 完整性及基因组 DNA 污染检测结果第37页
     ·测样品总 RNA 线性扩增及质量检测第37-39页
   ·数据分析第39-55页
     ·数据过滤第39-40页
     ·clean reads 在小鼠基因组上的匹配统计第40-44页
     ·精子细胞变形期间的可变剪接第44-46页
     ·精子形成期 3 个阶段差异基因表达分析第46-53页
     ·精子细胞中转录因子第53-55页
第五章 讨论第55-60页
   ·冰冻切片制作及激光显微切割捕获圆形和长形精子细胞过程的相关探讨第55-56页
   ·精子总 RNA 提取相关讨论分析第56页
   ·精子总 RNA 线性扩增相关讨论分析第56页
   ·测序数据分析与讨论第56-59页
   ·展望第59-60页
第六章 全文结论第60-61页
参考文献第61-68页
致谢第68-69页
作者简历第69页

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