摘要 | 第1-9页 |
Abstract | 第9-16页 |
第一章 文献综述 | 第16-26页 |
·精子形成期基因转录表达的研究进展 | 第16-22页 |
·精子形成过程中形态学及染色体结构的变化 | 第16-17页 |
·精子 RNA 研究进展 | 第17-19页 |
·成熟精子中 RNA 的可能功能 | 第19-20页 |
·精子 RNA 的调控 | 第20-22页 |
·激光捕获显微切割技术(LCM)分离小鼠睾丸各类精子细胞 | 第22-24页 |
·高通量测序 | 第24-25页 |
·展望 | 第25页 |
·本研究的目的意义 | 第25-26页 |
第二章 实验材料 | 第26-29页 |
·小鼠精子细胞样品来源 | 第26页 |
·主要试剂 | 第26页 |
·仪器设备 | 第26页 |
·主要计算机硬件 | 第26-27页 |
·计算机软件及数据库网址 | 第27页 |
·主要溶液配制 | 第27-29页 |
第三章 实验方法 | 第29-34页 |
·成熟精子的收集 | 第29页 |
·采用 LCM 技术捕获圆形精子细胞和长形精子细胞 | 第29-30页 |
·睾丸采集 | 第29页 |
·睾丸切片制备和染色 | 第29-30页 |
·激光显微切割技术分离圆形精子细胞和长形精子细胞 | 第30页 |
·总 RNA 提取 | 第30-31页 |
·成熟精子细胞总 RNA 提取 | 第30页 |
·圆形精子细胞和长形精子细胞总 RNA 提取 | 第30页 |
·精子总 RNA 的质量评估 | 第30-31页 |
·样品总 RNA 线性扩增及质量检测 | 第31页 |
·转录组测序文库构建 | 第31页 |
·生物信息学分析流程 | 第31-34页 |
·Reads 数据匹配 | 第32页 |
·基因表达水平的标准化 | 第32-33页 |
·样品间的基因差异表达分析 | 第33页 |
·新转录本分析 | 第33页 |
·可变剪接分析 | 第33页 |
·GO 功能注释和富集分析 | 第33页 |
·差异基因代谢通路富集分析 | 第33-34页 |
第四章 实验结果 | 第34-55页 |
·小鼠成熟精子收集 | 第34页 |
·圆形精子细胞和长形精子细胞的捕获 | 第34-36页 |
·圆形、长形和成熟精子细胞总 RNA 提取及鉴定 | 第36-39页 |
·精子总 RNA 纯度检测及定量分析结果 | 第36-37页 |
·精子总 RNA 完整性及基因组 DNA 污染检测结果 | 第37页 |
·测样品总 RNA 线性扩增及质量检测 | 第37-39页 |
·数据分析 | 第39-55页 |
·数据过滤 | 第39-40页 |
·clean reads 在小鼠基因组上的匹配统计 | 第40-44页 |
·精子细胞变形期间的可变剪接 | 第44-46页 |
·精子形成期 3 个阶段差异基因表达分析 | 第46-53页 |
·精子细胞中转录因子 | 第53-55页 |
第五章 讨论 | 第55-60页 |
·冰冻切片制作及激光显微切割捕获圆形和长形精子细胞过程的相关探讨 | 第55-56页 |
·精子总 RNA 提取相关讨论分析 | 第56页 |
·精子总 RNA 线性扩增相关讨论分析 | 第56页 |
·测序数据分析与讨论 | 第56-59页 |
·展望 | 第59-60页 |
第六章 全文结论 | 第60-61页 |
参考文献 | 第61-68页 |
致谢 | 第68-69页 |
作者简历 | 第69页 |