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荧蒽降解菌株的分离鉴定及其基因组学研究

中文摘要第1-5页
Abstract第5-10页
图目录第10-12页
表目录第12-13页
缩写对比表第13-14页
第一章 绪论第14-30页
   ·多环芳烃概述第14-16页
     ·多环芳烃的来源第14页
     ·多环芳烃的危害第14-15页
     ·修复多环芳烃化合物污染的方法第15-16页
   ·微生物降解多环芳烃污染的研究第16-26页
     ·多环芳烃降解菌的多样性第16-17页
     ·高分子量多环芳烃降解微生物的分离筛选第17-18页
     ·高分子量多环芳烃微生物降解的基因组学研究第18-22页
     ·高分子量多环芳烃微生物降解机理及降解途径研究进展第22-26页
   ·微生物降解多环芳烃的蛋白质组学研究第26-28页
   ·本研究的内容及意义第28-30页
第二章 实验材料和方法第30-52页
   ·实验材料第30-35页
     ·菌株和质粒第30页
     ·引物第30-31页
     ·主要试剂第31-32页
     ·仪器及设备第32-34页
     ·培养基的配置第34-35页
   ·实验方法第35-52页
     ·细菌基因组DNA的小量制备第35-36页
     ·碱裂解法小量制备质粒第36页
     ·DNA的琼脂糖凝胶电泳检测第36-37页
     ·琼脂糖凝胶DNA片段的纯化回收第37页
     ·DNA浓度和纯度的检测第37-38页
     ·聚合酶链式反应(PCR)体系第38页
     ·酶切和连接反应第38-39页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第39页
     ·电转化第39-40页
     ·PAHs降解菌株的分离与纯化第40页
     ·细菌形态特征观察第40页
     ·细菌生理生化特征鉴定第40-41页
     ·抗生素敏感性的测定第41页
     ·温度对降解菌株生长影响的测定第41页
     ·pH对降解菌株生长影响的测定第41-42页
     ·降解菌株生长曲线的测定第42页
     ·16S rRNA序列分析和系统发育树的构建第42页
     ·PAHs浓度对菌株生长影响的测定第42页
     ·菌株在荧葸条件下生长曲线的测定第42-43页
     ·荧蒽降解率的测定第43页
     ·鼠李糖脂的含量测定第43-44页
     ·降解酶活性测定第44-45页
     ·随机转座突变体库的构建第45-46页
     ·与荧蒽降解相关的转座突变体的筛选第46-47页
     ·随机PCR第47-48页
     ·转座子插入位点的确定第48页
     ·转座突变体生长的测定第48页
     ·设计简并引物扩增同源基因第48-49页
     ·基因敲除(Gene Knockout)的原理第49-50页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第50页
     ·二维电泳(2-DE)及质谱鉴定第50-52页
第三章 实验结果第52-79页
   ·降解菌株的分离与鉴定第52-56页
     ·菌株的形态特征和生理生化指标第52-53页
     ·16S rRNA序列比对与系统发育分析第53-54页
     ·菌株DN002最适生长条件的测定第54-56页
   ·降解菌株的降解特性研究第56-61页
     ·菌株DN002对不同PAHs的降解效果第56页
     ·菌株DN002对荧蒽的降解第56-57页
     ·表面活性剂对菌株DN002降解的影响第57-58页
     ·DN002菌株中降解相关酶蛋白活性的检测第58-61页
   ·降解菌株的基因组学研究第61-68页
     ·随机转座突变体库的构建第61页
     ·荧葸降解相关转座突变体的筛选第61-62页
     ·降解相关基因的确定第62-66页
     ·基因功能研究第66-68页
   ·降解菌株的蛋白质组学研究第68-79页
     ·SDS-PAGE结果分析第68-69页
     ·双向电泳(2-DE)结果分析第69-71页
     ·差异蛋白质点的研究第71-79页
第四章 小结与讨论第79-84页
参考文献第84-92页
致谢第92-93页
攻读硕士学位期间取得的学术成果第93页

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