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植物miRNA预测的初步研究

摘要第1-5页
Abstract第5-7页
目录第7-9页
第1章 绪论第9-11页
   ·论文选题第9页
   ·文献综述第9页
   ·研究现状第9-10页
   ·论文结构第10-11页
第2章 MIRNA 研究现状及背景第11-24页
   ·动植物 MIRNA 的简单比较第11页
   ·MIRNA 的研究进展第11-12页
   ·MIRNA 的合成第12-16页
   ·MIRNA 的功能第16-19页
   ·MIRNA 的作用机理差异第19页
   ·利用生物信息学研究 MIRNA 及其实验鉴定第19-23页
     ·植物 miRNA 及其靶基因的生物信息学研究第19-20页
     ·动物 miRNA 及其靶基因的生物信息学研究第20-22页
     ·miRNA的实验鉴定第22-23页
   ·MIRNA 研究工具及其限制第23-24页
第3章 MIRNA 特征提取方法分析第24-31页
   ·植物 MIRNA 靶标的识别与鉴定第24页
   ·互补性特征第24-25页
   ·保守性特征第25-27页
     ·植物成熟 miRNA 的保守性第26页
     ·成熟 miRNA 的核心保守性第26-27页
   ·结构特征第27-28页
     ·可结合性靶位点第27页
     ·植物 miRNA 前体二级结构的稳定性第27-28页
   ·MIRNA 长度特征第28-29页
     ·植物前体 miRNA 的最小自由能的概率分布差异来源第28-29页
     ·miRNA前体位点切除长度第29页
   ·其他特征总结第29-31页
第4章 MIRNA 预测工具分析第31-44页
   ·植物 MIRNA 常用靶基因预测工具和算法第31-38页
     ·PatScan第31页
     ·miRU第31-32页
     ·psRNATarget第32-34页
     ·miRNAassist第34页
     ·植物 miRNA 预测工具的比较第34-38页
   ·动物 MIRNA 常用靶基因预测工具和算法第38-41页
     ·miRanda第38-39页
     ·PicTar第39-41页
   ·动植物 MIRNA 预测工具的比较第41-43页
   ·结论第43-44页
第5章 详细设计第44-53页
   ·初始化及输入输出第44-47页
   ·植物 MIRNA 预测特征第47-50页
     ·碱基的元素比例特征第48-49页
     ·连续的碱基配对特征第49页
     ·数字化碱基配对特征第49-50页
   ·构建神经网络模型第50-51页
   ·软件运行结果及评估第51-53页
第6章 前景与展望第53-54页
参考文献第54-57页
作者简介及在学期间所取得的科研成果第57-58页
致谢第58页

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