支持得分矩阵的近似查询处理技术研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-22页 |
| ·研究背景 | 第10-18页 |
| ·生物信息学 | 第10-12页 |
| ·生物序列数据 | 第12-16页 |
| ·生物序列数据分析和挖掘 | 第16-18页 |
| ·问题的提出 | 第18-19页 |
| ·研究内容及主要贡献 | 第19-20页 |
| ·组织结构 | 第20-22页 |
| 第2章 问题定义及研究现状 | 第22-28页 |
| ·基本概念 | 第22-25页 |
| ·问题定义 | 第25-27页 |
| ·研究现状 | 第27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 第3章 查询预处理 | 第28-34页 |
| ·得分矩阵的形式转换 | 第28页 |
| ·阈值的设定 | 第28-33页 |
| ·本章小结 | 第33-34页 |
| 第4章 在线的近似查询算法 | 第34-48页 |
| ·顺序前瞻算法 | 第34-37页 |
| ·过滤原理 | 第37-41页 |
| ·前瞻过滤算法 | 第41-45页 |
| ·过滤窗口的选定 | 第41-42页 |
| ·过滤自动机的构造 | 第42-43页 |
| ·过滤算法 | 第43-45页 |
| ·多矩阵的前瞻过滤算法 | 第45-46页 |
| ·本章小结 | 第46-48页 |
| 第5章 基于后缀树的近似查询算法 | 第48-56页 |
| ·后缀树的构建 | 第48-49页 |
| ·基于后缀树的顺序前瞻算法 | 第49-52页 |
| ·基于后缀树的多矩阵查询算法 | 第52-54页 |
| ·本章小结 | 第54-56页 |
| 第6章 实验与分析 | 第56-66页 |
| ·实验环境 | 第56页 |
| ·在线的近似查询处理的实验与分析 | 第56-62页 |
| ·不同算法的性能比较 | 第57页 |
| ·得分矩阵长度对查询时间的影响 | 第57-59页 |
| ·得分矩阵个数对查询时间的影响 | 第59-60页 |
| ·过滤窗口长度对查询时间的影响 | 第60-61页 |
| ·p-value对查询的影响 | 第61-62页 |
| ·基于后缀树的查询处理的实验与分析 | 第62-64页 |
| ·得分矩阵长度对查询时间的影响 | 第63页 |
| ·序列大小对查询时间的影响 | 第63-64页 |
| ·本章小结 | 第64-66页 |
| 第7章 总结与展望 | 第66-68页 |
| ·总结 | 第66-67页 |
| ·展望 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-72页 |
| 致谢 | 第72-74页 |
| 攻硕期间发表的论文及参与的项目 | 第74页 |