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miRNA介导靶基因沉默的分析与识别

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-12页
第一章 绪论第12-16页
   ·研究目的与意义第12-13页
   ·主要研究工作第13页
     ·miRNA 介导的靶mRNA 降解水平的计算分析第13页
     ·基于支持向量机识别miRNA 的作用方式第13页
   ·研究方案与创新性第13-15页
   ·本文的结构安排第15页
   ·本章小结第15-16页
第二章 miRNA 及研究背景介绍第16-27页
   ·miRNA 的特征第16-18页
   ·miRNA 的功能第18页
   ·miRNA 靶基因的计算预测第18-21页
   ·miRNA 靶基因的实验鉴定方法第21-23页
   ·miRNA 的作用机制第23-26页
     ·miRNA 介导靶mRNA 的翻译抑制第23-24页
     ·miRNA 介导靶mRNA 的降解第24-25页
     ·miRNA 作用方式的选择第25-26页
   ·本章小结第26-27页
第三章 靶mRNA 降解水平的计算分析第27-37页
   ·数据集的构建第27-29页
     ·数据的来源第27-28页
     ·靶点的预测第28-29页
   ·特征分析第29-35页
     ·靶mRNA 的3’UTR 对靶mRNA 降解程度的影响第29-31页
     ·miRNA 结合位点所处环境对靶mRNA 降解水平的影响第31-34页
     ·miRNA-mRNA 双链特征对靶mRNA 降解水平的影响第34-35页
   ·讨论第35-36页
   ·本章小结第36-37页
第四章人类miRNA 作用方式的识别第37-69页
   ·数据集的构建第37-42页
     ·来源于TarBase 的数据第37-38页
     ·来源于miRecords 的数据第38-39页
     ·来源于两篇文献的数据第39-41页
     ·miRNA 结合位点的预测第41-42页
   ·特征提取第42-47页
   ·支持向量机理论第47-51页
     ·最优分类面第48-49页
     ·核函数第49-50页
     ·LIBSVM 简介第50-51页
   ·实验结果与讨论第51-62页
     ·SVM 的分类效果第51-52页
     ·不同子集的预测结果第52-53页
     ·不同的cutoff1、cutoff2 和cutoff3 对预测结果的影响第53-54页
     ·最具区分度的特征第54-59页
     ·不具区分度的特征第59-61页
     ·讨论第61-62页
   ·miRNA 作用方式识别的网络实现第62-68页
     ·microDoR Human 的输入第64页
     ·microDoR Human 的输出第64-68页
   ·本章小结第68-69页
第五章总结与展望第69-71页
   ·总结第69页
   ·展望第69-71页
参考文献第71-76页
致谢第76-77页
在学期间的研究成果及发表的学术论文第77页

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