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HP-PRRSV HuN4株感染仔猪发病过程中蛋白质分子演化网络的系统生物学研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-14页
第一章 PRRSV 致病机制的研究进展第14-26页
   ·PRRSV 的生物学及基因组结构特征第14-15页
   ·PRRSV 的抗原性差异和不断变异第15页
   ·PRRSV 感染宿主细胞第15-21页
     ·PRRSV 的易感细胞第15-16页
     ·PRRSV 易感细胞上受体或辅助因子第16页
     ·硫酸肝素第16-17页
     ·唾液酸粘附素第17-18页
     ·CD163第18-20页
     ·细胞蛋白酶第20页
     ·其它可能的调节子第20页
     ·PRRSV 感染细胞的初步模型第20-21页
   ·持续性感染第21-22页
   ·混合感染和继发感染第22-23页
   ·抗体依赖性增强作用第23页
   ·引发细胞凋亡第23-25页
   ·PRRSV 感染的免疫抑制第25-26页
第二章 蛋白质组学及其在猪主要病毒病研究中的应用第26-34页
   ·蛋白质组学概述第26页
   ·蛋白质组学研究的基本技术第26-29页
     ·蛋白样品制备第26-27页
     ·蛋白分离技术第27页
     ·斑点识别和图像分析第27-28页
     ·蛋白鉴定技术第28页
     ·生物信息分析第28-29页
     ·蛋白相互作用研究第29页
   ·猪主要病毒病的蛋白质组学研究第29-31页
     ·病毒粒子的蛋白质组研究第29-30页
     ·病毒感染诱导宿主细胞和组织蛋白质组变化第30页
     ·病毒感染诱导宿主血浆/血清蛋白质组变化第30-31页
   ·蛋白质组学在猪主要病毒性疾病中的应用第31-32页
     ·猪瘟病毒(CSFV)感染猪的蛋白质组学研究第31页
     ·猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染猪的蛋白质组学研究第31-32页
     ·圆环病毒 2 型(PCV2)感染猪的蛋白质组学研究第32页
     ·其它病毒感染猪的蛋白质组学研究第32页
   ·蛋白质组学上升到系统生物学的必要性第32-33页
   ·本研究的目的和意义第33-34页
第三章 HP‐PRRSV HuN4 株感染仔猪肺脏的蛋白质组学研究第34-48页
   ·实验材料第34-35页
     ·实验动物、病毒和主要试剂第34页
     ·主要仪器第34页
     ·溶液配制第34-35页
   ·实验方法第35-38页
     ·动物实验和取材第35页
     ·样品制备第35页
     ·二维凝胶电泳第35-37页
     ·凝胶染色第37页
     ·图像扫描和分析第37页
     ·胶内酶解和质谱分析第37页
     ·差异蛋白的功能分析第37-38页
   ·结果与分析第38-43页
     ·动物实验的临床观察第38页
     ·肺脏蛋白质的 2DE 结果第38-39页
     ·差异蛋白的分析结果第39-42页
     ·差异蛋白的质谱鉴定结果第42-43页
     ·差异蛋白的功能注释第43页
   ·讨论第43-47页
   ·小结第47-48页
第四章 HP‐PRRSV HuN4 株感染仔猪颌下淋巴结的蛋白质组学研究第48-62页
   ·实验材料第48页
     ·实验动物、病毒和主要试剂第48页
     ·主要仪器第48页
     ·溶液配制第48页
   ·实验方法第48-51页
     ·动物实验和取材第48页
     ·样品制备第48-49页
     ·二维凝胶电泳第49-50页
     ·凝胶扫描第50页
     ·图像分析第50-51页
     ·胶内酶解和质谱分析第51页
     ·差异蛋白的功能分析第51页
   ·结果与分析第51-58页
     ·动物实验的临床观察第51-52页
     ·差异蛋白的分析结果第52-56页
     ·差异蛋白的质谱鉴定结果第56-58页
     ·差异蛋白的功能注释第58页
   ·讨论第58-61页
   ·小结第61-62页
第五章 HP‐PRRSV HuN4 株感染仔猪血清蛋白质组学的研究第62-86页
   ·实验材料第62-63页
     ·实验动物、病毒和主要试剂第62页
     ·主要仪器第62-63页
     ·溶液配制第63页
   ·实验方法第63-69页
     ·动物实验和取材第63-64页
     ·血清的抗体检查第64页
     ·病毒载量检测第64页
     ·DIGE 样品标记第64-65页
     ·二维凝胶电泳第65页
     ·凝胶扫描第65页
     ·图像分析第65页
     ·胶内酶解和质谱分析第65-66页
     ·差异蛋白的功能分析第66页
     ·差异蛋白的实验验证第66-69页
   ·结果与分析第69-82页
     ·动物临床观察、抗体反应和病毒血症检测第69-70页
     ·差异蛋白的分析结果第70-74页
     ·差异蛋白的质谱鉴定结果第74-77页
     ·差异蛋白的 Western Blot 验证第77-81页
     ·ELISA 试剂盒证明触珠蛋白的上升第81-82页
     ·差异蛋白的功能注释第82页
   ·讨论第82-85页
   ·小结第85-86页
第六章 HP‐PRRSV HuN4 株感染仔猪蛋白质组学差异蛋白点的生物信息学分析第86-97页
   ·实验材料第86页
   ·实验方法第86-87页
     ·差异蛋白的 GO 注释分类第86页
     ·差异蛋白的信号通路分析第86页
     ·差异蛋白的相互作用网络分析第86-87页
   ·结果与分析第87-93页
     ·差异蛋白的 GO 注释分类结果第87-90页
     ·差异蛋白的信号通路分析结果第90-91页
     ·差异蛋白的相互作用网络分析结果第91-93页
   ·讨论第93-96页
   ·小结第96-97页
结论第97-98页
参考文献第98-114页
附录第114-121页
 附录 1 溶液配置第114-116页
 附录 2 2D Clean‐Up Kit 试剂盒操作说明第116-117页
 附录 3 2D Quant Kit 试剂盒操作说明第117-118页
 附录 4 南京医科大学酶解和质谱过程第118-119页
 附录 5 CyDye DIGE 荧光最小标记试剂盒操作说明第119-120页
 附录 6 上海中科新生物技术有限公司酶解和质谱过程第120-121页
主要缩略词和中英文对照表第121-124页
致谢第124-127页
作者简历第127页

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