| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-29页 |
| ·超分子化学概述 | 第13-17页 |
| ·分子识别及其影响因素 | 第13-14页 |
| ·超分子催化 | 第14-15页 |
| ·超分子自组装 | 第15-16页 |
| ·分子器件 | 第16-17页 |
| ·主体分子──杯芳烃简介 | 第17-22页 |
| ·杯芳烃的结构及性质 | 第17-18页 |
| ·杯芳烃的分子识别与包合 | 第18-20页 |
| ·杯芳烃的及其包合物的应用及前景 | 第20-22页 |
| ·其它重要主体分子简介 | 第22-25页 |
| ·冠醚 | 第22-24页 |
| ·环糊精 | 第24-25页 |
| ·分子反应器对客体分子发生化学反应的影响 | 第25-27页 |
| ·客体分子在分子反应器中的取向 | 第25-26页 |
| ·分子反应器中的客体分子与外界的交换 | 第26-27页 |
| ·本文的研究内容及意义 | 第27-29页 |
| 第二章 模型构建及计算方法 | 第29-30页 |
| 第三章 分子结构优化 | 第30-39页 |
| ·分子反应器的结构优化 | 第30-33页 |
| ·使用分子动力学OPLS方法优化 | 第30-31页 |
| ·使用分子动力学AMBER方法优化 | 第31页 |
| ·使用分子动力学MM+方法优化 | 第31-32页 |
| ·使用半经验PM3方法优化 | 第32-33页 |
| ·客体分子的结构优化 | 第33-39页 |
| ·反应物3-环丁烯砜的结构优化 | 第33-35页 |
| ·产物丁二烯的结构优化 | 第35-38页 |
| ·产物二氧化硫的结构优化 | 第38-39页 |
| 第四章 能量分析 | 第39-64页 |
| ·分子反应器与小分子的相对构型 | 第39-40页 |
| ·小分子与分子反应器的相对方向 | 第40页 |
| ·小分子在分子反应器中的垂直高度 | 第40页 |
| ·小分子沿自身纵轴的旋转 | 第40页 |
| ·各典型反应通道的反应过渡态、内享反应坐标和反应活化能 | 第40-61页 |
| ·自由状态下小分子的分解反应 | 第40-43页 |
| ·小分子与分子反应器同向平行的U模型 | 第43-46页 |
| ·小分子与分子反应器反向平行的D1模型 | 第46-48页 |
| ·小分子与分子反应器同向倾斜的V1模型 | 第48-50页 |
| ·小分子与分子反应器反向倾斜的V2模型 | 第50-52页 |
| ·小分子相对倾斜时倾斜角度的影响 | 第52-56页 |
| ·小分子在分子反应器垂直方向上的浮动 | 第56-59页 |
| ·小分子沿自身纵轴的旋转 | 第59-60页 |
| ·活化能计算结果分析 | 第60-61页 |
| ·相互作用能及变形能 | 第61-64页 |
| 第五章 分子动态模拟 | 第64-67页 |
| 第六章 结论 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-74页 |
| 攻读硕士学位期间发表及已接收的论文 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 作者和导师简介 | 第76页 |