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福建稻田细菌群落PCR-DGGE分析和石油烃降解基因克隆

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
引言第10-12页
1 文献综述第12-27页
   ·传统的微生物培养法第14页
   ·生物标记法(biomarker)第14-15页
   ·BIOLOG鉴定系统第15页
   ·分子生物学方法第15-19页
     ·荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization, FISH)第16-17页
     ·单链构象多态性(Single-Stranded-Conformation Polymorphism, SSCP)第17页
     ·16S rDNA的限制性片段长度多态性(RFLP)分析(ARDRA)第17页
     ·16S rDNA末端标记限制性片段长度多态性分析(T-RFLPs)第17-18页
     ·随机扩增片段多态性 DNA(Randomly amplified polymorphic DNA,RAPD)第18页
     ·变性梯度凝胶电泳(DGGE)和温度梯度凝胶电泳(TGGE)第18-19页
   ·PCR-DGGE第19-21页
     ·原理第19页
     ·应用第19-20页
     ·DGGE技术的优缺点第20-21页
   ·石油污染治理第21-27页
     ·土壤石油污染的处理方法第21-22页
     ·降解石油烃的微生物种类第22页
     ·微生物对石油烃的降解机理第22-24页
     ·影响石油生物降解的因素第24-27页
2. 福建省稻田土壤细菌群落的16S rDNA-PCR-DGGE分析第27-38页
   ·材料第27-28页
     ·土壤样品第27页
     ·试剂以及仪器第27-28页
   ·试验方法第28-33页
     ·土壤理化指标测定第28页
     ·土壤总 DNA的提取(SDS-based法)第28-29页
     ·土壤 DNA的纯化第29页
     ·对土壤总 DNA进行16S rDNA基因的套式 PCR扩增第29-32页
     ·套式 PCR反应产物的变性梯度凝胶电泳(DGGE)第32页
     ·变性梯度凝胶电泳(DGGE)后的特异条带分析第32页
     ·变性梯度凝胶电泳谱带的回收测序第32-33页
   ·结果与分析第33-38页
     ·土壤样品理化性质测定第33页
     ·SDS法提取稻田土壤总DNA第33-34页
     ·DNA纯化第34页
     ·PCR扩增第34-35页
     ·变性梯度凝胶电泳第35-38页
3、石油烃降解菌株筛选第38-50页
   ·材料第38-39页
     ·试剂第38页
     ·仪器第38页
     ·菌种来源第38页
     ·培养基第38-39页
   ·实验方法第39-44页
     ·菌株的分离筛选第39页
     ·细菌分离物分子生物学分析第39-42页
       ·PCR产物的克隆测序第42-44页
   ·结果与分析第44-50页
     ·石油烃降解菌的分离、筛选第44页
     ·具石油烃降解功能的细菌分离物的DNA提取第44页
     ·16SrDNA PCR-DGGE第44-46页
     ·石油烃降解关键基因扩增第46-47页
     ·序列测定第47-50页
   ·菌株 B9、B12、E47、G22研究第50页
4. 讨论第50-54页
   ·福建稻田土壤细菌群体结构的DGGE分析第50-51页
   ·关于降解石油烃基因的克隆与相关菌株筛选第51-52页
   ·PCR-DGGE的相关技术探讨第52-54页
5. 结语第54-55页
参考文献第55-65页
附录第65-66页
致谢第66页

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