| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 1. 前言 | 第11-31页 |
| ·深海热液生态系统研究进展 | 第11-17页 |
| ·深海热液生态系统的发现 | 第11-13页 |
| ·深海热液在全球的分部 | 第13页 |
| ·热液系统的分类 | 第13-15页 |
| ·瓜伊马斯海盆热液口系统的特殊性 | 第15-17页 |
| ·嗜热、超嗜热微生物研究进展 | 第17-19页 |
| ·Thermococcales 简介 | 第19-21页 |
| ·嗜压微生物研究进展 | 第21-24页 |
| ·第一株严格嗜压超嗜热古菌Pyrococcus yayanossi CH1 | 第24-25页 |
| ·第二代测序技术 | 第25-28页 |
| ·本研究的思路、目的、意义及研究中存在的困难 | 第28-31页 |
| 2. 瓜伊马斯热液口可培养Thermococcles 的多样性研究 | 第31-54页 |
| ·材料与方法 | 第31-40页 |
| ·样品采集 | 第31-33页 |
| ·培养基与试剂 | 第33-35页 |
| ·引物与软件 | 第35-36页 |
| ·实验仪器 | 第36-37页 |
| ·实验方法 | 第37-40页 |
| ·结果与分析 | 第40-52页 |
| ·超嗜热微生物的富集、分离 | 第40-42页 |
| ·RAPD 初步分型 | 第42-43页 |
| ·超嗜热微生物的分子鉴定及多样性分析 | 第43-46页 |
| ·Thermococcales 中新基因标记的筛选、评估 | 第46-47页 |
| ·基因组比较筛选新基因标记 | 第47-52页 |
| ·总结与讨论 | 第52-54页 |
| 3. Pyrococcus yayanossi CH1 的基因组注释 | 第54-86页 |
| ·材料与方法 | 第54-58页 |
| ·材料 | 第54-55页 |
| ·CH1 培养方法 | 第55-56页 |
| ·CH1 总RNA 提取 | 第56-58页 |
| ·结果与分析 | 第58-83页 |
| ·基因组测序及gap-closure | 第58-60页 |
| ·CH1 基因组基本特征 | 第60-61页 |
| ·基因组注释 | 第61-63页 |
| ·近缘 Pyrococcus 基因组比较、分析 | 第63-69页 |
| ·4 株Pyrococcus 基因功能对比 | 第69-74页 |
| ·4 株Pyrococcus 共有基因及特异基因分析 | 第74-78页 |
| ·CH1 代谢途径分析 | 第78-83页 |
| ·转录组工作 | 第83页 |
| ·总结与讨论 | 第83-86页 |
| 4. 思考与展望 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 个人简历 | 第98页 |
| 攻读硕士期间发表的学术论文 | 第98页 |
