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新发肠道致病菌检测基因芯片的研制及初步应用

1 引言第1-25页
   ·肠道致病菌快速检测技术研究的意义和必要性第11-12页
     ·肠出血性大肠杆菌 O157:H7 和霍乱弧菌 O139 是最危险的食源性病原菌第11-12页
     ·早期、快速、特异的检测是有效防治霍乱弧菌 O139 和肠出血性大肠杆菌O157:H7 等食源性病原体感染的关键第12页
   ·相关领域国内外研究现状和发展趋势第12-14页
     ·产毒性霍乱弧菌检测方法第12页
     ·肠出血性大肠杆菌 O157:H7 检测方法第12-13页
     ·现代分子诊断技术是病原微生物检测发展的主导方向第13-14页
   ·霍乱弧菌 O139 研究历史第14-16页
     ·霍乱弧菌 O139 流行病学和致病性第14页
     ·霍乱弧菌 O139 培养特性和生化特征第14页
     ·霍乱弧菌 O139 的分子生物学研究第14-16页
   ·肠出血性大肠杆菌 O157:H7 研究历史第16-20页
     ·肠出血性大肠杆菌O157:H7 培养特性和生化特征第16-17页
     ·肠出血性大肠杆菌O157:H7 流行病学第17页
     ·肠出血性大肠杆菌O157:H7 的分子生物学研究第17-20页
   ·基因芯片(Genechip)技术的研究进展第20-22页
     ·生物芯片的分类第20-21页
     ·基因芯片的制备第21页
     ·探针的杂交与检测第21-22页
     ·cDNA 芯片与寡核苷酸芯片第22页
   ·研究目的和内容第22-25页
2 研究一寡核苷酸芯片制备工艺条件的确定第25-38页
   ·材料与方法第25-28页
     ·材料第25页
     ·载玻片表面的化学处理第25-26页
     ·荧光标记 PCR 产物的制备第26-27页
     ·寡核苷酸的合成第27页
     ·芯片的制备第27页
     ·芯片的杂交与洗涤第27页
     ·芯片的信号扫描与数据分析第27-28页
   ·结果第28-34页
     ·荧光标记 PCR 产物的制备第28页
     ·不同长度寡核苷酸探针对杂交信号强度的影响第28-30页
     ·探针末端连接不同长度 PEG 连接臂对杂交信号强度的影响第30-31页
     ·探针末端不同修饰对杂交信号强度的影响第31-33页
     ·不同基片对杂交信号强度的影响第33页
     ·芯片的重复性第33-34页
   ·讨论与小结第34-38页
     ·探针与片基化学结合方式对探针固定量和芯片检测灵敏度的影响第35-36页
     ·探针连接臂对芯片检测灵敏度的影响第36页
     ·探针长度对芯片杂交信号强度的影响第36-38页
3 研究二肠出血性大肠杆菌O157:H7 和霍乱弧菌 O139 寡核苷酸检测芯片的制备第38-71页
   ·实验一目的基因的 PCR 检测及序列鉴定第38-45页
     ·材料与方法第38-40页
     ·结果第40-45页
     ·讨论与小结第45页
   ·实验二多重不对称 PCR 反应体系的优化第45-52页
     ·材料与方法第46页
     ·结果第46-51页
     ·讨论与小结第51-52页
   ·实验三探针筛选和芯片制备第52-71页
     ·材料与方法第53-59页
     ·结果第59-69页
     ·讨论和小结第69-71页
4 研究三杂交反应体系的优化第71-79页
   ·材料与方法第71-72页
     ·材料第71页
     ·主要试剂第71页
     ·探针设计第71页
     ·引物设计第71页
     ·寡核苷酸的合成第71页
     ·寡核苷酸含量测定(分光光度法)第71-72页
     ·寡核苷酸芯片的制备第72页
     ·寡核苷酸芯片的阵列示意图第72页
     ·PCR 反应第72页
     ·杂交和信号检测第72页
   ·结果第72-77页
     ·PCR 产物进行未变性与变性处理对杂交结果的影响第72-73页
     ·杂交时间对杂交结果的影响第73-74页
     ·杂交温度对杂交结果的影响第74-75页
     ·杂交液成分对杂交结果的影响第75-77页
   ·讨论与小结第77-79页
5 研究四肠出血性大肠杆菌 O157:H7 和霍乱弧菌 O139 病原体检测芯片的性能评价第79-86页
   ·材料与方法第79-80页
     ·菌株及临床标本第79页
     ·主要试剂第79页
     ·探针序列第79页
     ·引物设计第79页
     ·寡核苷酸芯片的制备第79页
     ·寡核苷酸芯片的阵列示意图第79-80页
     ·PCR 反应第80页
     ·芯片的杂交与洗涤第80页
     ·芯片的扫描与信号检测第80页
   ·结果第80-84页
     ·基因芯片检测的灵敏度第80-81页
     ·基因芯片检测的特异性第81-83页
     ·临床样本检测第83-84页
   ·讨论与小结第84-86页
6 全文总结第86-88页
7 结论第88-89页
致谢第89-90页
参考文献第90-99页
作者简介第99页

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