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检疫性实蝇分子生物学快速鉴定技术的研究

中文摘要第1-12页
英文摘要第12-14页
前言第14-16页
第一章 检疫性实蝇(双翅目:实蝇科)分类鉴定研究概述第16-30页
 1 实蝇的识别第17-19页
   ·按实蝇属Anastrepha第18-19页
   ·小条实蝇属Ceratitis第19页
   ·绕实蝇属Rhagoletis第19页
   ·寡鬃实蝇族Dacini第19页
 2 实蝇的经济重要性第19-22页
   ·果实蝇属Bactrocera第20-21页
   ·小条实蝇属Ceratitis第21页
   ·按实蝇属Anastrepha第21页
   ·绕实蝇属Rhagoletis第21页
   ·寡鬃实蝇属Dacus第21-22页
 3 实蝇的扩散第22-24页
 4 实蝇的分类和鉴定第24-30页
   ·分类现状第24-26页
   ·实蝇的鉴定第26-30页
     ·形态学鉴定第26-27页
     ·分子生物学鉴定第27-30页
第二章 检疫性实蝇mtDNA COI 基因序列比较研第30-45页
 引言第30-32页
 1 材料与方法第32-39页
   ·实蝇标本第32页
   ·实蝇基因组DNA 提取方法第32-35页
     ·Dneasy Tissue Kit提取方法第34页
     ·基因谷动物组织DNA 提取试剂盒方法第34-35页
   ·DNA 质量检查第35-36页
   ·目标片断PCR 扩增第36-37页
     ·PCR 扩增引物和测序引物第36页
     ·PCR 扩增体系第36页
     ·PCR 扩增条件第36-37页
   ·实蝇COI 基因序列测定第37-38页
     ·PCR 产物纯化第37-38页
       ·PCR 产物直接纯化第37页
       ·琼脂糖电泳割胶纯第37-38页
     ·测序第38页
   ·基因序列比较第38-39页
 2 结果与分析第39-42页
   ·DNA 质量检查第39页
   ·检疫性实蝇mtDNA COI基因序列第39-40页
   ·检疫性实蝇同源序列比较分析第40-41页
     ·COI 基因组成第40-41页
     ·碱基替换和颠换频率第41页
   ·遗传距离第41页
   ·桔小实蝇复合种COI 基因相似度第41-42页
 3 讨论第42-45页
第三章 检疫性实蝇SYBR Green 实时荧光PCR 鉴定技术研究第45-71页
 引言第45-46页
 1 材料与方法第46-50页
   ·实蝇标本第46页
   ·基因组DNA第46-47页
   ·引物设计第47-48页
   ·SYBR Green 实时荧光PCR第48-49页
   ·溶解曲线分析Melting Curve Analysis第49页
   ·琼脂凝胶电泳分析Agarose Gel Electriphoresis第49页
   ·数据分析第49-50页
 2 结果与分析第50-67页
   ·辣椒实蝇SYBR Green实时荧光PCR鉴定方法的建立第50-54页
     ·引物lati-F1/lati-R1特异性验证第50页
     ·SYBR Green 实时荧光PCR 检测灵敏度第50-53页
     ·SYBR Green实时荧光PCR在实蝇快速鉴定上的应用第53-54页
   ·引物capa-F/capa-R SYBR Green 实时荧光PCR 鉴定地中海实蝇第54页
   ·引物bact-F/bact-R SYBR Green 实时荧光PCR 鉴定果实蝇亚属第54-63页
     ·引物docp-F第56-57页
     ·引物papa-F/papa-R SYBR Green实时荧光PCR鉴定木瓜实蝇第57-58页
     ·引物camb-F/camb-R SYBR Green 实时荧光PCR 鉴定杨桃实蝇第58-59页
     ·引物phil-F/phil-R SYBR Green 实时荧光PCR 鉴定菲律宾实蝇第59-61页
     ·引物occi-F/occi-R SYBR Green 实时荧光PCR 鉴定芒果实蝇第61-62页
     ·引物corr-L/corr-R SYBR Green 实时荧光PCR 鉴定番石榴实蝇第62-63页
   ·SYBR Green 实时荧光PCR 鉴定瓜实蝇和南瓜实蝇第63-66页
     ·亚属特异引物zeau-F/zeau-R 区分果实蝇亚属和寡鬃实蝇亚属第63-64页
     ·引物cucu -F/cucu-R SYBR Green 实时荧光PCR 鉴定瓜实蝇第64-65页
     ·引物tau-F/tau-R SYBR Green 实时荧光PCR 鉴定南瓜实蝇第65-66页
   ·SYBR Green实时荧光PCR特异引物扩增目标片段与溶解温度关系第66-67页
 3 讨论第67-71页
第四章 检疫性实蝇常规PCR 鉴定技术研究第71-84页
 引言第71-72页
 1 材料与方法第72-74页
   ·实蝇标本和DNA基因组第72页
   ·引物设计第72页
   ·常规PCR 扩增反应第72-73页
   ·琼脂糖凝胶电泳第73页
   ·PCR 产物序列分析第73-74页
 2 结果与分析第74-82页
   ·SS-PCR 鉴定辣椒实蝇第74-76页
     ·引物特异性验证第74-75页
     ·SS-PCR 方法的检测灵敏度第75页
     ·SS-PCR 在实蝇快速鉴定上的应用第75-76页
   ·SS-PCR 鉴定地中海实蝇第76-77页
   ·SS-PCR 鉴定果实蝇亚属实蝇第77-81页
     ·SS-PCR 鉴定桔小实蝇复合种第77-78页
     ·SS-PCR 鉴定木瓜实蝇第78页
     ·SS-PCR 鉴定杨桃实蝇第78-79页
     ·SS-PCR 鉴定菲律宾实蝇第79页
     ·SS-PCR 鉴定芒果实蝇第79-80页
     ·SS-PCR 鉴定番石榴实蝇第80-81页
   ·SS-PCR 鉴定Zeugodacus 亚属第81-82页
     ·SS-PCR 鉴定瓜实蝇第82页
     ·SS-PCR 鉴定南瓜实蝇第82页
   ·SS-PCR 产物测序第82页
 3 讨论第82-84页
第五章 检疫性实蝇TaqMan MGB 探针实时荧光PCR 鉴定技术研究第84-98页
 引言第84-85页
 1 材料与方法第85-87页
   ·实验材料第85页
   ·TaqMan MGB 探针和引物设计与合成第85-87页
   ·TaqMan MGB 探针实时荧光PCR 扩增反应第87页
   ·数据分析第87页
   ·琼脂糖凝胶电泳第87页
 2 结果与分析第87-98页
   ·TaqMan MGB 探针和引物特异性验证第88-93页
     ·TaqMan MGB实时荧光PCR方法验证引物lati-F2/lati-R2特异第89-90页
     ·SYBR Green 实时荧光PCR 方法验证引物lati-F2/lati-R2 特异性第90-93页
     ·TaqMan MGB 实时荧光PCR 在辣椒实蝇快速鉴定上的应用第93页
   ·TaqMan MGB 实时荧光PCR 快速鉴定地中海实蝇第93页
   ·TaqMan MGB 实时荧光PCR 快速鉴定三带实蝇第93-95页
   ·TaqMan MGB 实时荧光PCR 快速鉴定瓜实蝇第95页
  3 讨论第95-98页
第六章 检疫性实蝇mtDNA COI 基因片段克隆第98-106页
 引言第98-99页
 1 材料与方法第99-102页
   ·检疫性实蝇标本第99页
   ·目标片段常规PCR 扩增第99-100页
   ·PCR 产物纯化第100页
   ·载体连接第100页
   ·转化第100-101页
   ·重组克隆筛选―蓝/白斑筛选第101页
   ·测序第101页
   ·克隆片段SYBR Green和TaqMan MGB实时荧光PCR检测第101-102页
 2 结果与分析第102-104页
   ·检疫性实蝇mtDNA COI基因片段克隆第102页
   ·DNA 克隆片段常规PCR 检测第102-103页
   ·实蝇克隆片段在快速检疫鉴定上的应用第103-104页
 3 讨论第104-106页
总讨论第106-113页
结论第113-115页
参考文献第115-128页
附录1 SYBR Green实时荧光PCR和种特异引物PCR产物片段第128-130页
附录2 TaqMan MGB探针实时荧光PCR产物片段第130-131页
附录3 本研究建立的分子生物学方法鉴定检疫性实蝇一览表第131-132页
附录4 本研究科研项目经费资助来源第132-133页
附录5 在读期间发表论文、会议报告第133-135页
致谢第135-136页

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