| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-22页 |
| ·蛋白质对接研究的背景、意义 | 第9-10页 |
| ·分子对接方法的关键步骤 | 第10-13页 |
| ·全空间搜索 | 第10-11页 |
| ·打分排序 | 第11-12页 |
| ·结构优化 | 第12-13页 |
| ·研究现状 | 第13-20页 |
| ·国外研究现状 | 第13-19页 |
| ·国内研究现状 | 第19页 |
| ·存在问题 | 第19-20页 |
| ·本文的研究内容和所做的工作 | 第20页 |
| ·论文的结构安排 | 第20-22页 |
| 第2章 蛋白质对接方法的理论研究 | 第22-30页 |
| ·分子对接的理论基础 | 第22-23页 |
| ·分子对接方法的分类 | 第23页 |
| ·分子间结合机制 | 第23-24页 |
| ·蛋白质分子间相互作用的热力学过程 | 第24-25页 |
| ·分子动力学 | 第25-26页 |
| ·分子对接中常用的三种算法 | 第26-29页 |
| ·遗传算法(Genetic Algorithm，GA) | 第26-27页 |
| ·蒙特卡洛方法(Monte Carlo，MC) | 第27-28页 |
| ·模拟退火(Simulated Annealing) | 第28-29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第3章 蛋白质三维模型的研究 | 第30-45页 |
| ·蛋白质结构数据库 | 第30-33页 |
| ·蛋白质三维结构模型 | 第33-38页 |
| ·全原子模型 | 第33-34页 |
| ·HP格点模型 | 第34-36页 |
| ·非格模型 | 第36-38页 |
| ·受体和配体数据模型的建立 | 第38-44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 第4章 蛋白质对接算法的研究 | 第45-53页 |
| ·基于网格的全空间搜索算法 | 第45-49页 |
| ·过滤函数与打分函数 | 第49-52页 |
| ·结果讨论 | 第52页 |
| ·本章小结 | 第52-53页 |
| 结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-57页 |
| 攻读硕士期间发表的文章和取得的科研成果 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 个人简历 | 第59页 |