基于多尺度熵的DNA序列相似性分析
摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
第1章 绪论 | 第8-13页 |
1.1 引言 | 第8页 |
1.2 研究背景及意义 | 第8-9页 |
1.3 国内外研究现状 | 第9-11页 |
1.3.1 国外研究现状 | 第10页 |
1.3.2 国内研究现状 | 第10-11页 |
1.4 论文主要工作及结构安排 | 第11-12页 |
1.5 本章小结 | 第12-13页 |
第2章 生物信息学基础 | 第13-20页 |
2.1 生物学基础知识 | 第13-16页 |
2.1.1 核酸 | 第13-14页 |
2.1.2 DNA的结构 | 第14-15页 |
2.1.3 遗传学中心法则 | 第15-16页 |
2.2 生物信息学发展简史 | 第16-17页 |
2.3 生物信息学主要研究的问题 | 第17-19页 |
2.4 本章小结 | 第19-20页 |
第3章 DNA序列的表示方法 | 第20-34页 |
3.1 基于数值的表示方法 | 第20-22页 |
3.2 基于图形的表示方法 | 第22-33页 |
3.2.1 二维图形表示方法 | 第23-31页 |
3.2.2 三维图形表示方法 | 第31-33页 |
3.3 本章小结 | 第33-34页 |
第4章 基于多尺度熵的DNA序列相似性分析 | 第34-62页 |
4.1 DNA序列相似性分析方法 | 第34-36页 |
4.1.1 序列比对方法 | 第34-35页 |
4.1.2 信息理论方法 | 第35-36页 |
4.1.3 统计特征方法 | 第36页 |
4.2 近似熵 | 第36-40页 |
4.2.1 近似熵算法的步骤及含义 | 第36-38页 |
4.2.2 近似熵算法的特性仿真 | 第38-40页 |
4.3 样本熵与互样本熵 | 第40-43页 |
4.3.1 样本熵 | 第40-41页 |
4.3.2 互样本熵 | 第41-43页 |
4.4 多尺度熵 | 第43-44页 |
4.5 实验与分析 | 第44-62页 |
4.5.1 实验数据 | 第45页 |
4.5.2 DNA序列的表示 | 第45-46页 |
4.5.3 基于互样本熵的DNA序列相似性分析 | 第46-48页 |
4.5.4 基于样本熵的DNA序列动态分析 | 第48-54页 |
4.5.5 基于多尺度熵的DNA序列相似性分析 | 第54-59页 |
4.5.6 与动态时间弯曲距离算法的比较 | 第59-62页 |
第5章 总结与展望 | 第62-64页 |
5.1 总结 | 第62-63页 |
5.2 展望 | 第63-64页 |
参考文献 | 第64-68页 |
致谢 | 第68-69页 |
攻读硕士学位期间的研究成果 | 第69页 |