| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-17页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第9-10页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第10-14页 |
| 1.2.1 基因共表达网络的构建方法 | 第10-12页 |
| 1.2.2 基因共表达网络分析的主要方法 | 第12-13页 |
| 1.2.3 基因共表达网络的研究成果 | 第13-14页 |
| 1.3 本文主要研究内容 | 第14-15页 |
| 1.4 论文结构安排 | 第15-17页 |
| 第2章 基于网络稠密度的模糊聚类模型研究 | 第17-27页 |
| 2.1 重叠模块发现方法 | 第17-19页 |
| 2.2 模糊聚类算法 | 第19-20页 |
| 2.3 基于稠密度的模糊聚类模型 | 第20-24页 |
| 2.3.1 FCBD模型的构建 | 第21-22页 |
| 2.3.2 FCBD模型的求解过程 | 第22-24页 |
| 2.4 FCBD模型有效性评估 | 第24-26页 |
| 2.5 本章小结 | 第26-27页 |
| 第3章 基于权重网络稠密度模糊聚类算法的基因共表达网络分析 | 第27-39页 |
| 3.1 基因共表达网络的基本概念 | 第27-30页 |
| 3.1.1 基因共表达 | 第27-28页 |
| 3.1.2 基因共表达网络及表示方法 | 第28-29页 |
| 3.1.3 基因共表达网络的构建分析流程 | 第29-30页 |
| 3.2 模糊聚类在基因共表达数据中的应用 | 第30页 |
| 3.3 基于FCBD模型改进的WFCBD算法 | 第30-34页 |
| 3.3.1 WFCBD算法的提出 | 第31-32页 |
| 3.3.2 基于基因共表达网络的WFCBD算法实现 | 第32-34页 |
| 3.4 WFCBD算法效果评估 | 第34-38页 |
| 3.4.1 数据集生成 | 第34页 |
| 3.4.2 评价指标选择 | 第34-36页 |
| 3.4.3 实验结果分析 | 第36-38页 |
| 3.5 本章小结 | 第38-39页 |
| 第4章 大豆基因共表达网络的构建与分析 | 第39-62页 |
| 4.1 数据来源与预处理 | 第39-41页 |
| 4.2 构建大豆基因共表达网络 | 第41-47页 |
| 4.2.1 大豆基因的共表达情况 | 第42-46页 |
| 4.2.2 网络构建 | 第46-47页 |
| 4.3 大豆基因共表达网络的聚类与分析 | 第47-52页 |
| 4.4 大豆基因共表达网络的生物学解释与分析 | 第52-58页 |
| 4.4.1 各模块的生物学意义 | 第52-57页 |
| 4.4.2 重叠基因分析 | 第57-58页 |
| 4.5 基于生物学解释的算法评估 | 第58-61页 |
| 4.6 本章小结 | 第61-62页 |
| 第5章 总结和展望 | 第62-64页 |
| 5.1 本文工作总结 | 第62-63页 |
| 5.2 后续工作展望 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-71页 |
| 攻读硕士学位期间获得与学位论文相关的科研成果目录 | 第71页 |