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基于宏基因组技术探究甲藻水华生消过程中微生物群落特征及功能代谢变化

摘要第6-9页
Abstract第9-12页
第1章 综述第13-33页
    1.1 三峡库区与甲藻水华第13-16页
        1.1.1 三峡工程简介第13-14页
        1.1.2 三峡工程蓄水对水环境的影响第14页
        1.1.3 三峡库区甲藻水华现状第14-16页
    1.2 甲藻及其水华形成机制第16-21页
        1.2.1 甲藻第16-18页
        1.2.2 甲藻水华形成机制第18-21页
    1.3 水华与微生物第21-24页
        1.3.1 水生微生物与水华的潜在联系第21-23页
        1.3.2 藻菌关系研究现状及存在问题第23-24页
    1.4 环境微生物研究方法第24-29页
        1.4.1 传统微生物研究方法第24-25页
        1.4.2 微生物研究的分子生物学技术第25-28页
        1.4.3 宏基因组技术第28-29页
    1.5 研究目的及意义第29-30页
    1.6 研究内容第30-33页
        1.6.1 水华期间浮游藻类群落结构变化第30页
        1.6.2 水华期间水体微生物群落结构变化第30页
        1.6.3 水华期间微生物群落功能作用第30页
        1.6.4 甲藻水华与微生物群落的关系第30-33页
第2章 材料与方法第33-43页
    2.1 汝溪河概况第33-34页
    2.2 采样设置第34-35页
    2.3 样品的采集和测定第35-37页
        2.3.1 水体理化指标的测定第35页
        2.3.2 浮游藻类采集、定性以及定量分析第35-36页
        2.3.3 水体微生物采集和计数第36页
        2.3.4 水体微生物DNA的获得第36-37页
    2.4 宏基因组分析第37-40页
        2.4.1 测序数据处理第37-38页
        2.4.2 组装第38-39页
        2.4.3 基因预测第39页
        2.4.4 物种注释第39页
        2.4.5 功能注释第39-40页
    2.5 野外验证水体微生物次级代谢物的动态变化第40-42页
        2.5.1 多糖测定第40页
        2.5.2 碳水化合物酶测定第40-42页
    2.6 数据分析第42-43页
第3章 水华期间浮游藻类群落结构变化第43-49页
    3.1 前言第43页
    3.2 结果分析第43-46页
        3.2.1 水华期间浮游藻类物种组成第43-44页
        3.2.2 水华期间浮游藻类生物量变化第44-45页
        3.2.3 水环境物理指标特征第45-46页
        3.2.4 水环境营养指标特征第46页
    3.3 讨论第46-49页
第4章 水华期间微生物群落结构变化第49-59页
    4.1 前言第49页
    4.2 结果与分析第49-53页
        4.2.1 水华期间微生物(细菌)总数第49-50页
        4.2.2 微生物群落结构变化第50-53页
    4.3 讨论第53-59页
第5章 水华期间微生物群落功能和代谢第59-77页
    5.1 前言第59页
    5.2 结果与分析第59-74页
        5.2.1 微生物群落功能——eggNOG功能模块的注释第59-61页
        5.2.2 微生物群落功能——KEGG功能模块的注释第61-63页
        5.2.3 微生物群落代谢分析——C代谢第63-66页
        5.2.4 微生物群落代谢分析——N代谢第66-69页
        5.2.5 微生物群落代谢分析——P代谢第69-71页
        5.2.6 微生物群落代谢分析——CAZy代谢第71-72页
        5.2.7 微生物群落代谢分析——碳水化合物验证第72-74页
    5.3 讨论第74-77页
第6章 甲藻水华与微生物群落关系第77-83页
    6.1 前言第77页
    6.2 结果与分析第77-81页
        6.2.1 微生物群落与环境理化因子的典范对应分析第77-79页
        6.2.2 微生物群落在甲藻水华过程中的生态变化第79-81页
    6.3 讨论第81-83页
第7章 结论与展望第83-87页
    7.1 引言第83页
    7.2 水华期间浮游植物群落动态及相应环境因子的变化第83页
    7.3 水华期间微生物群落结构变化第83-84页
    7.4 水华不同时期微生物群落的功能和代谢变化第84页
    7.5 甲藻水华与微生物群落的关系第84-85页
    7.6 不足与展望第85-87页
参考文献第87-109页
致谢第109-111页
硕士期间学术情况第111页

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