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BrYV侵染性克隆构建、RTD互作蛋白筛选及哺乳动物病毒siRNA特征分析

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
缩略词表第11-13页
第一章 文献综述第13-42页
    1.1 植物病毒在韧皮部中进行长距离运动第13-18页
        1.1.1 病毒长距离运动的形式第14-15页
        1.1.2 与病毒长距离运动相关的病毒编码蛋白以及寄主蛋白第15-18页
    1.2 Polerovirus通读蛋白研究进展第18-27页
        1.2.1 马铃薯卷叶病毒属病毒研究概述第18-19页
        1.2.2 通读蛋白研究进展第19-27页
    1.3 哺乳动物中的抗病毒RNA干扰第27-40页
        1.3.1 RNA干扰第27-34页
        1.3.2 RNAi在哺乳动物抗病毒中的作用第34-38页
        1.3.3 哺乳动物及人类病毒编码的VSR第38-40页
    1.4 研究目的与意义第40-42页
第二章 实验材料与方法第42-63页
    2.1 实验材料第42-44页
        2.1.1 菌种第42页
        2.1.2 载体第42页
        2.1.3 病毒及抗血清第42页
        2.1.4 植物材料及培养第42-43页
        2.1.5 动物材料及培养第43页
        2.1.6 酶、化学试剂和耗材第43-44页
        2.1.7 构建克隆所用引物和测序第44页
    2.2 实验试剂的配制第44-49页
        2.2.1 常用试剂与培养基配制第44-45页
        2.2.2 具体实验试剂配制第45-49页
    2.3 实验方法第49-63页
        2.3.1 高温高压灭菌第49页
        2.3.2 重组克隆构建第49-51页
        2.3.3 His融合蛋白的原核表达与纯化第51-52页
        2.3.4 BrYV农杆菌浸润接种及检测第52-55页
        2.3.5 BrYV RTD互作蛋白筛选及互作验证第55-58页
            2.3.5.1 酵母文库扩繁第55-56页
            2.3.5.2 酵母cDNA文库筛选(共转化法)第56-57页
            2.3.5.3 酵母双杂交实验第57页
            2.3.5.4 农杆菌浸润介导的瞬时表达第57页
            2.3.5.5 激光共聚焦微镜观察第57-58页
        2.3.6 NoV感染及相关检测第58-60页
        2.3.7 IAV感染及相关检测第60-63页
第三章 BrYV PO、CP及RTD原核表达纯化及抗血清制备第63-67页
    3.1 BrYV PO、CP及RTD的原核表达纯化及抗血清制备第63-65页
    3.2 BrYV PO、CP及RTD抗血清效价检测第65-66页
    3.3 小结与讨论第66-67页
第四章 BrYV侵染性克隆构建及侵染性检测第67-76页
    4.1 BrYV全长cDNA克隆的构建及侵染性检测第67-69页
        4.1.1 BrYV全长cDNA克隆构建第67-68页
        4.1.2 BrYV全长cDNA克隆在本生烟上的侵染性检测第68-69页
    4.2 BrYV全长cDNA克隆突变体的构建及侵染性检测第69-72页
        4.2.1 BrYV两种基因型人工重组突变体构建及侵染性检测第69-70页
        4.2.2 BrYV RTD缺失突变体构建及侵染性检测第70-72页
    4.3 小结与讨论第72-76页
        4.3.1 BrYV生物学特性第72-74页
        4.3.2 影响全长cDNA克隆侵染的因素第74-76页
第五章 BrYV RTD互作植物蛋白筛选及其功能初步探索第76-89页
    5.1 利用酵母双杂交筛选与BrYV通读区域互作的植物蛋白第76-79页
        5.1.1 RTD载体构建第76-77页
        5.1.2 拟南芥文库质粒扩繁第77页
        5.1.3 筛选与BrYV RTD互作的拟南芥蛋白第77-79页
    5.2 BrYV RTD与全长AtSAMS4互作检测第79-82页
        5.2.1 AtSAMS4克隆及与RTD互作检测相关载体构建第79-80页
        5.2.2 AtSAMS4与BrYV RTD在本生烟中的亚细胞定位第80-81页
        5.2.3 AtSAMS4与BrYV RTD相互作用检测第81-82页
    5.3 初步探索NbSAMS表达水平与BrYV系统侵染的相互关系第82-84页
        5.3.1 克隆NbSAMS第83页
        5.3.2 BrYV复制及系统侵染对NbSAMS mRNA表达水平的影响第83-84页
    5.4 小结与讨论第84-89页
        5.4.1 与RTD互作的植物蛋白相关研究第84-87页
        5.4.2 与RTD互作的病毒编码蛋白相关研究第87-88页
        5.4.3 对RTD翻译后修饰的预测第88-89页
第六章 哺乳动物病毒siRNA特征分析及分析方法的建立第89-114页
    6.1 NoV感染小鼠乳鼠产生的vsiRNA特征分析及分析方法的建立第89-96页
        6.1.1 NoV感染小鼠乳鼠产生的小RNAs特征第90-92页
        6.1.2 与AGO结合的NoV感染小鼠乳鼠产生的vsRNAs特征分析第92-93页
        6.1.3 与B2结合的NoV感染小鼠乳鼠产生的小RNA特征分析第93-94页
        6.1.4 NoVΔB2感染小鼠乳鼠不同时间周期的病毒积累量及vsiRNA的特征变化第94-96页
    6.2 甲型流感病毒感染人源细胞产生的小RNA特征分析第96-108页
        6.2.1 PR8感染人源及哺乳动物细胞产生的小RNA检测及特征分析第96-98页
        6.2.2 与AGO结合的PR8感染人源细胞产生的小RNA的特征分析第98-102页
        6.2.3 WSN感染人源细胞产生的小RNA检测及特征分析第102-108页
    6.3 小结与讨论第108-114页
        6.3.1 利用不表达VSR的突变体病毒结合AGO-IP及高通量测序的方法检测哺乳动物病毒产生的vsiRNA第109页
        6.3.2 NoV编码B2蛋白的沉默抑制机制分析第109-110页
        6.3.3 哺乳动物抗病毒RNAi反应与抗病毒免疫反应相互关系的初步讨论第110-114页
第七章 结论与展望第114-115页
    7.1 结论第114页
    7.2 展望第114-115页
参考文献第115-132页
附录第132-140页
    附录-Ⅰ瓜类温和花叶病毒外壳蛋白小亚基抗血清制备及与该属其他病毒血清学关系研究第132-137页
    附录-Ⅱ 引物列表第137-138页
    附录-Ⅲ 本生烟SAMS mRNA序列(1173 nt)第138-139页
    附录-Ⅳ 小RNA测序分析参考序列第139-140页
致谢第140-142页
个人简介第142页

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