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CRISPR/C2c1的结构与功能机制研究

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第1章 绪论第14-39页
    1.1 课题背景及研究的目的和意义第14-16页
        1.1.1 课题背景第14-15页
        1.1.2 研究的目的和意义第15-16页
    1.2 基因编辑技术研究进展第16-26页
        1.2.1 传统基因打靶技术第16-17页
        1.2.2 锌指核酸酶第17-19页
        1.2.3 类转录激活因子效应物核酸酶第19-21页
        1.2.4 CRISPR/Cas系统第21-26页
    1.3 二类CRISPR/Cas系统第26-37页
        1.3.1 CRISPR/Cas9系统研究进展第26-32页
        1.3.2 CRISPR/Cpf1系统研究进展第32-34页
        1.3.3 CRISPR/C2c1系统研究进展第34-37页
    1.4 本文主要研究内容及技术路线第37-39页
        1.4.1 本文主要研究内容第37-38页
        1.4.2 技术路线第38-39页
第二章 实验材料与方法第39-62页
    2.1 实验材料第39-43页
        2.1.1 质粒和表达系统第39页
        2.1.2 细胞系与小鼠第39-40页
        2.1.3 实验试剂药品第40-42页
        2.1.4 实验仪器第42-43页
    2.2 实验方法第43-62页
        2.2.1 分子克隆第43-47页
        2.2.2 蛋白表达第47-48页
        2.2.3 蛋白纯化第48-50页
        2.2.4 RNA的体外转录第50-51页
        2.2.5 RNA的纯化第51-54页
        2.2.6 DNA的设计与合成第54页
        2.2.7 蛋白结晶第54-55页
        2.2.8 数据收集与结构解析第55-56页
        2.2.9 细胞复苏、培养及冻存第56页
        2.2.10 细胞转染第56-57页
        2.2.11 T7E1实验第57-58页
        2.2.12 小鼠胚胎的提取第58-59页
        2.2.13 显微注射第59-60页
        2.2.14 微量热泳动仪(MST)检测第60-62页
第三章 BthC2c1-sgRNA-dsDNA复合物的纯化第62-72页
    3.1 引言第62页
    3.2 BthC2c1蛋白的克隆与表达第62-63页
    3.3 BthC2c1蛋白的纯化第63-66页
    3.4 BthC2c1sgRNA的体外转录与纯化第66-67页
    3.5 BthC2c1蛋白与sgRNA及dsDNA相互作用的检测第67-69页
    3.6 BthC2c1-sgRNA-dsDNA复合物的纯化第69-70页
    3.7 本章小结第70-72页
第四章 BthC2c1-sgRNA-dsDNA复合物的结晶与结构解析第72-81页
    4.1 引言第72页
    4.2 复合物结晶条件初步筛选第72-73页
    4.3 复合物结晶条件的优化第73-75页
    4.4 BthC2c1的Se-Met衍生型晶体第75-76页
    4.5 防冻液的选择第76页
    4.6 数据收集及结构解析第76-79页
    4.7 本章小结第79-81页
第五章 BthC2c1-sgRNA-dsDNA复合物的三维结构第81-93页
    5.1 引言第81页
    5.2 BthC2c1-sgRNA-dsDNA三元复合物的整体结构第81-83页
    5.3 BthC2c1对dsDNA的识别模式第83-87页
    5.4 BthC2c1对sgRNA的识别模式第87-89页
    5.5 BthC2c1与AacC2c1的序列比对与结构比较第89-91页
    5.6 本章小结第91-93页
第六章 sgRNA介导BthC2c1剪切DNA的功能机制研究第93-109页
    6.1 引言第93页
    6.2 BthC2c1剪切DNA产生黏性末端第93-96页
    6.3 金属离子对BthC2c1体外酶切活性的影响第96-98页
    6.4 温度对BthC2c1体外酶切活性的影响第98-99页
    6.5 BthC2c1在动物细胞内的酶切活性检测第99-101页
    6.6 BthC2c1在小鼠胚胎内的酶切活性检测第101-103页
    6.7 BthC2c1-sgRNA复合物对底物亲和力检测第103-107页
    6.8 本章小结第107-109页
结论第109-111页
参考文献第111-123页
攻读博士学位期间发表的论文及其它成果第123-125页
致谢第125-126页
个人简历第126页

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