摘要 | 第8-10页 |
ABSTRACT | 第10-12页 |
第一章 绪论 | 第13-19页 |
1.1 研究背景与意义 | 第13-15页 |
1.1.1 白血病简介 | 第13-14页 |
1.1.2 基因芯片简介 | 第14页 |
1.1.3 基因芯片数据 | 第14-15页 |
1.2 基因芯片数据研究现状 | 第15-16页 |
1.2.1 国内研究现状 | 第15-16页 |
1.2.2 国外研究现状 | 第16页 |
1.3 本文的主要贡献 | 第16-17页 |
1.4 论文结构 | 第17-19页 |
第二章 理论基础 | 第19-35页 |
2.1 主成分分析 | 第19-24页 |
2.1.1 主成分分析的数学模型 | 第19-21页 |
2.1.2 主成分的推导 | 第21-23页 |
2.1.3 主成分的性质 | 第23-24页 |
2.1.4 求解主成分的步骤 | 第24页 |
2.2 稀疏主成分分析 | 第24-28页 |
2.2.1 线性回归模型估计 | 第24-25页 |
2.2.2 弹性网方法 | 第25-26页 |
2.2.3 稀疏主成分 | 第26-28页 |
2.3 聚类分析 | 第28-35页 |
2.3.1 相似性测度 | 第28-30页 |
2.3.2 层次聚类 | 第30-33页 |
2.3.3 K-means聚类 | 第33-35页 |
第三章 基因芯片数据的预处理 | 第35-41页 |
3.1 基因芯片数据特征 | 第35页 |
3.2 基因芯片数据预处理 | 第35-37页 |
3.2.1 基因芯片数据预处理步骤 | 第35-36页 |
3.2.2 实验数据集 | 第36-37页 |
3.3 基因差异表达分析方法 | 第37-38页 |
3.3.1 倍数法 | 第37-38页 |
3.3.2 t检验法 | 第38页 |
3.3.3 方差分析方法 | 第38页 |
3.4 差异表达结果分析 | 第38-41页 |
第四章 AML基因芯片数据的主成分降维分析 | 第41-59页 |
4.1 AML基因芯片数据的传统主成分降维分析 | 第41-48页 |
4.1.1 基于主成分分析提取关键基因的结果分析 | 第41-48页 |
4.1.2 提取基因主成分的结果分析 | 第48页 |
4.2 AML基因芯片数据的Bootstrap -主成分降维分析 | 第48-57页 |
4.2.1 Bootstrap简介 | 第49-50页 |
4.2.2 Bootstrap估计偏差 | 第50页 |
4.2.3 Bootstrap -主成分分析 | 第50-52页 |
4.2.4 实证分析 | 第52-57页 |
4.3 AML基因芯片数据的稀疏主成分降维分析 | 第57页 |
4.4 小结 | 第57-59页 |
第五章 AML基因芯片数据的聚类分析 | 第59-65页 |
5.1 AML基因芯片数据的层次聚类分析 | 第59-62页 |
5.2 AML基因芯片数据的K-means聚类分析 | 第62-63页 |
5.3 小结 | 第63-65页 |
第六章 总结 | 第65-69页 |
6.1 本文主要内容 | 第65-66页 |
6.2 问题和展望 | 第66-69页 |
参考文献 | 第69-73页 |
致谢 | 第73-74页 |
学位论文评阅及答辩情况表 | 第74页 |