肠结核患者肠道菌群的特点
中文摘要 | 第4-6页 |
abstract | 第6-7页 |
第1章 前言 | 第10-12页 |
第2章 综述 | 第12-19页 |
2.1 肠道菌群 | 第12-13页 |
2.2 肠道菌群与疾病的关系 | 第13-14页 |
2.3 肠道菌群在治疗方面的应用 | 第14-16页 |
2.4 肠道菌群研究由细菌向真菌发展 | 第16-17页 |
2.5 肠道菌群与肠结核的鉴别诊断 | 第17-18页 |
2.6 结论 | 第18-19页 |
第3章 对象与方法 | 第19-29页 |
3.1 对象 | 第19-20页 |
3.2 方法 | 第20-23页 |
3.2.1 Illumina测序实验流程 | 第21页 |
3.2.2 基因组DNA抽提和质检 | 第21页 |
3.2.3 引物设计并合成 | 第21页 |
3.2.4 PCR扩增和产物纯化 | 第21-22页 |
3.2.5 PCR产物定量和均一化 | 第22页 |
3.2.6 Illumina测序 | 第22-23页 |
3.3 数据处理及分析 | 第23-29页 |
3.3.1 生物信息分析流程 | 第23-24页 |
3.3.2 测序数据统计 | 第24页 |
3.3.2.1 有效数据统计 | 第24页 |
3.3.3 OTU分析 | 第24-26页 |
3.3.4 物种分类和丰度分析 | 第26页 |
3.3.5 Alpha多样性分析 | 第26-27页 |
3.3.6 beta多样性分析 | 第27-28页 |
3.3.7 组间差异分析 | 第28-29页 |
第4章 实验结果 | 第29-35页 |
第5章 讨论 | 第35-38页 |
第6章 结论 | 第38-39页 |
参考文献 | 第39-44页 |
作者简介及科研成果 | 第44-45页 |
致谢 | 第45页 |