| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 研究背景 | 第10-12页 |
| 1.1.1 化学调节剂 | 第10-11页 |
| 1.1.2 蛋白调节剂 | 第11页 |
| 1.1.3 多肽调节剂 | 第11-12页 |
| 1.2 肽类药物的研究进展 | 第12-14页 |
| 1.2.1 化学修饰 | 第13页 |
| 1.2.2 环肽化 | 第13页 |
| 1.2.3 装订肽 | 第13-14页 |
| 1.2.4 聚脯氨酸多肽 | 第14页 |
| 1.3 脯氨酸在肽类药物设计的研究现状 | 第14-15页 |
| 1.4 本论文的主要研究内容 | 第15页 |
| 1.5 本论文的结构安排 | 第15-16页 |
| 第二章 脯氨酸介导的肽构象约束研究 | 第16-32页 |
| 2.1 背景及研究问题 | 第16-18页 |
| 2.2 材料和方法 | 第18-24页 |
| 2.2.1 聚脯氨酸多肽体系的选择 | 第18-20页 |
| 2.2.2 分子动力学模拟(MD)基本理论及方法 | 第20-22页 |
| 2.2.3 MM/PBSA方法计算肽/蛋白结合自由能 | 第22-23页 |
| 2.2.4 虚拟突变(VM)方法 | 第23-24页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第24-30页 |
| 2.3.1 MD轨迹比较及分析 | 第24-26页 |
| 2.3.2 从热力学角度对比分析脯氨酸对PRP/靶标结合的影响 | 第26-28页 |
| 2.3.3 分析不同位置的脯氨酸对PRP/靶蛋白体系结合亲和力的影响 | 第28页 |
| 2.3.4 分析突变后PRP的动力学行为 | 第28-30页 |
| 2.4 本章小结 | 第30-32页 |
| 第三章 设计靶向c-SrcSH3结构域的PRP肽 | 第32-46页 |
| 3.1 背景及研究问题 | 第32-33页 |
| 3.2 材料和方法 | 第33-36页 |
| 3.2.1 动力学模拟和分析 | 第33-35页 |
| 3.2.3 基于受体的药物设计方法 | 第35-36页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第36-45页 |
| 3.3.1 蛋白质环境在原生SH3/PPⅡ结合中起关键作用 | 第36-38页 |
| 3.3.2 优化c-SrcSH3肽结合物的序列模式 | 第38-42页 |
| 3.3.3 基于结构的锚定残基Lys249和Thr252的重新设计 | 第42-45页 |
| 3.4 本章小结 | 第45-46页 |
| 第四章 展望和总结 | 第46-47页 |
| 4.1 全文总结 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-53页 |
| 攻读硕士期间取得的成果 | 第53页 |
