HIV-1病毒中NCp7锌指区域与配体相互作用的理论研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 引言 | 第9-11页 |
| 1 基本理论 | 第11-18页 |
| 1.1 密度泛函理论的发展 | 第11-13页 |
| 1.2 ABEEMσπ模型 | 第13-15页 |
| 1.3 广义活性指标的提出 | 第15-16页 |
| 1.4 有限差分近似下反应活性指标的计算 | 第16-18页 |
| 2 锌指蛋白及配体的选取和参数的探究 | 第18-22页 |
| 2.1 量子化学计算方法 | 第18-20页 |
| 2.1.1 锌指蛋白及配体的模型分子选取 | 第18-19页 |
| 2.1.2 计算方法 | 第19-20页 |
| 2.2 ABEEMσπ参数的确定 | 第20-22页 |
| 2.2.1 参数的调节 | 第20-21页 |
| 2.2.2 ABEEMσπ方法中的标号命名原则 | 第21-22页 |
| 3 锌指蛋白及配体的电荷分布 | 第22-28页 |
| 3.1 ABEEMσπ方法计算分子电荷 | 第22-25页 |
| 3.1.1 理论方法 | 第22页 |
| 3.1.2 电荷分布结果与讨论 | 第22-25页 |
| 3.2 锌指蛋白及配体的偶极矩探究 | 第25-26页 |
| 3.2.1 理论方法 | 第25页 |
| 3.2.2 数据及讨论 | 第25-26页 |
| 3.3 小结 | 第26-28页 |
| 4 计算分子体系整体反应活性 | 第28-31页 |
| 4.1 计算细节 | 第28页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第28-31页 |
| 5 锌指蛋白与配体的反应活性位点选择 | 第31-38页 |
| 5.1 理论方法 | 第31页 |
| 5.2 计算细节 | 第31-37页 |
| 5.3 小结 | 第37-38页 |
| 6 33 个锌指蛋白分子的研究 | 第38-45页 |
| 6.1 33 个锌指蛋白的选取 | 第38-39页 |
| 6.2 电荷分布 | 第39-43页 |
| 6.2.1 计算方法 | 第39页 |
| 6.2.2 计算细节 | 第39-43页 |
| 6.3 大体系锌指蛋白分子的反应活性指标 | 第43-44页 |
| 6.4 小结 | 第44-45页 |
| 结论 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-49页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第49-50页 |
| 致谢 | 第50页 |
