| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 1 绪论 | 第12-25页 |
| 1.1 抗生素及耐药基因简介 | 第12-16页 |
| 1.1.1 抗生素定义及发展 | 第12页 |
| 1.1.2 抗生素分类及作用机理 | 第12-14页 |
| 1.1.3 抗生素抗性基因耐药机理 | 第14-16页 |
| 1.2 抗生素、耐药菌及抗性基因进入环境的潜在途径 | 第16-17页 |
| 1.3 水环境中的抗生素、耐药菌及抗性基因 | 第17-20页 |
| 1.3.1 水环境中的抗生素 | 第17-18页 |
| 1.3.2 水环境中的耐药菌 | 第18-19页 |
| 1.3.3 水环境中的抗生素抗性基因(ARGs) | 第19-20页 |
| 1.4 乳糖发酵型肠杆菌(lactose-fermentationEnterobacteriaceae,LFE)简介 | 第20-21页 |
| 1.5 研究意义、内容及技术路线 | 第21-25页 |
| 1.5.1 研究意义 | 第21-22页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第22-23页 |
| 1.5.3 技术路线 | 第23-25页 |
| 2 实验材料 | 第25-29页 |
| 2.1 研究对象 | 第25页 |
| 2.2 采样点简介 | 第25-27页 |
| 2.2.1 闵行水质净化厂 | 第25-26页 |
| 2.2.3 苏州二叶制药厂 | 第26-27页 |
| 2.3 实验材料 | 第27-29页 |
| 2.3.1 实验仪器 | 第27-28页 |
| 2.3.2 实验试剂 | 第28-29页 |
| 3 实验方法 | 第29-38页 |
| 3.1 乳糖发酵型肠杆菌分离计数 | 第29页 |
| 3.2 单菌落培养及等量混匀 | 第29-30页 |
| 3.3 DNA提取及高通量测序 | 第30-33页 |
| 3.3.1 细菌DNA提取 | 第30-32页 |
| 3.3.2 样品总DNA提取 | 第32-33页 |
| 3.3.3 高通量测序 | 第33页 |
| 3.4 测序数据处理 | 第33-38页 |
| 3.4.1 数据分析原理 | 第33-34页 |
| 3.4.2 数据分析步骤 | 第34-36页 |
| 3.4.3 数据分析结果 | 第36-38页 |
| 4 闵行水质净化厂处理过程中耐药基因的变化 | 第38-49页 |
| 4.1 LFE计数结果 | 第38页 |
| 4.2 污水处理过程及LFE、TR-LFE中抗性基因类型及丰度的变化 | 第38-44页 |
| 4.2.1 污水处理过程中LFE体内抗性基因类型及丰度的变化 | 第38-39页 |
| 4.2.2 污水处理过程中TR-LFE体内抗性基因类型及丰度的变化 | 第39-40页 |
| 4.2.3 污水处理过程中抗性基因类型及丰度的变化 | 第40-41页 |
| 4.2.4 结果与讨论 | 第41-44页 |
| 4.3 污水处理过程及LFE、TR-LFE中四环素类抗性基因丰度的变化 | 第44-49页 |
| 4.3.1 污水处理过程中LFE体内四环素类抗性基因类型及丰度的变化 | 第44-45页 |
| 4.3.2 污水处理过程中TR-LFE体内四环素类抗性基因类型及丰度的变化 | 第45-47页 |
| 4.3.3 污水处理过程中四环素类抗性基因类型及丰度的变化 | 第47-48页 |
| 4.3.4 结果与讨论 | 第48-49页 |
| 5 苏州二叶制药厂污水处理过程中耐药基因的变化 | 第49-56页 |
| 5.1 LFE计数结果 | 第49页 |
| 5.2 污水处理过程及LFE中抗性基因类型及丰度的变化 | 第49-53页 |
| 5.2.1 污水处理过程中LFE体内抗性基因类型及丰度的变化 | 第49-50页 |
| 5.2.2 污水处理过程中抗性基因类型及丰度的变化 | 第50-51页 |
| 5.2.3 结果与讨论 | 第51-53页 |
| 5.3 污水处理过程及LFE中四环素类抗性基因丰度的变化 | 第53-56页 |
| 5.3.1 污水处理过程中LFE体内四环素类抗性基因类型及丰度的变化 | 第53-54页 |
| 5.3.2 污水处理过程中四环素类抗性基因类型及丰度的变化 | 第54-55页 |
| 5.3.3 结果与讨论 | 第55-56页 |
| 6 两个污水处理厂中耐药基因比较分析 | 第56-59页 |
| 6.1 两个污水厂间耐药基因比较分析 | 第56页 |
| 6.2 Beta多样性分析 | 第56-59页 |
| 7 结论与展望 | 第59-64页 |
| 7.1 结论 | 第59-63页 |
| 7.2 展望与建议 | 第63-64页 |
| 附录1 菌液OD值及加入量 | 第64-82页 |
| 附录2 本地数据分析脚本及相关命令 | 第82-89页 |
| 附录3 抗生素抗性基因类型及丰度值数据 | 第89-119页 |
| 参考文献 | 第119-124页 |
| 致谢 | 第124页 |
